More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4567 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05626  Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1)(Acetate--CoA ligase)(Acyl-activating enzyme) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16928]  53.55 
 
 		 670 aa  679    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0101756 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03941  acetyl-coenzyme A synthetase  60.47 
 
 		 652 aa  842    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3923  acetate/CoA ligase  60.47 
 
 		 652 aa  842    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06751  acetyl-coenzyme A synthetase  53.83 
 
 		 660 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4487  acetyl-CoA synthetase  64.36 
 
 		 653 aa  864    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4702  acetyl-CoA synthetase  99.53 
 
 		 644 aa  1326    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105105 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2043  acetyl-CoA synthetase  67.77 
 
 		 662 aa  923    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2349  acetyl-CoA synthetase  59.66 
 
 		 650 aa  842    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3955  acetyl-CoA synthetase  65.15 
 
 		 648 aa  902    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1752  acetyl-CoA synthetase  59.5 
 
 		 650 aa  838    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1811  acetyl-CoA synthetase  63.68 
 
 		 651 aa  865    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2743  acetyl-CoA synthetase  59.5 
 
 		 650 aa  838    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1825  acetyl-CoA synthetase  63.89 
 
 		 651 aa  860    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.90086  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3109  acetyl-CoA synthetase  64.56 
 
 		 653 aa  863    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0141  hypothetical protein  56.63 
 
 		 652 aa  743    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0126  hypothetical protein  55.85 
 
 		 652 aa  739    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07740  acetate--CoA ligase, putative  54.95 
 
 		 680 aa  646    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.534841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3572  acetyl-CoA synthetase  64.21 
 
 		 651 aa  862    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0184  acetyl-CoA synthetase  56.07 
 
 		 653 aa  751    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.217877 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2288  acetate--CoA ligase  64.84 
 
 		 644 aa  882    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2856  acetyl-CoA synthetase  53.53 
 
 		 656 aa  654    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0057  acetyl-coenzyme A synthetase  53.77 
 
 		 658 aa  688    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0333  acetyl-CoA synthetase  67.74 
 
 		 650 aa  882    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0282682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0504  acetyl-CoA synthetase  52.62 
 
 		 655 aa  648    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.359208 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0467  acetyl-CoA synthetase  64.74 
 
 		 652 aa  872    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1206  acetyl-CoA synthetase  56.52 
 
 		 657 aa  706    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3595  acetyl-CoA synthetase  80.16 
 
 		 645 aa  1087    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0688  acetyl-coenzyme A synthetase  64.56 
 
 		 651 aa  817    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.84853  normal  0.838987 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4293  acetyl-CoA synthetase  65.57 
 
 		 651 aa  877    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4814  acetyl-CoA synthetase  81.86 
 
 		 645 aa  1116    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.422495  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0579  Acetyl-coenzyme A synthetase  63.26 
 
 		 653 aa  827    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44757  predicted protein  54.44 
 
 		 644 aa  678    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199264  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1637  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 667 aa  651    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.97368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1318  acetate--CoA ligase  56.03 
 
 		 673 aa  698    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1685  acetyl-CoA synthetase  49.92 
 
 		 666 aa  665    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1139  acetyl-coenzyme A synthetase  55.24 
 
 		 657 aa  677    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3207  acetyl-coenzyme A synthetase  58.47 
 
 		 661 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1116  acetyl-CoA synthetase  53.28 
 
 		 653 aa  677    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.311917  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1451  acetyl-CoA synthetase  51.85 
 
 		 651 aa  635    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0619  acetyl-coenzyme A synthetase  54.25 
 
 		 660 aa  680    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1352  acetyl-CoA synthetase  54.12 
 
 		 656 aa  692    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0172568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3575  acetyl-coenzyme A synthetase  67.77 
 
 		 646 aa  904    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.566418  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3479  acetyl-coenzyme A synthetase  62.4 
 
 		 645 aa  835    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.837124  hitchhiker  0.000568147 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0276  acetyl-CoA synthetase  60.62 
 
 		 652 aa  846    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.715577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1895  acetyl-CoA synthetase  67.44 
 
 		 645 aa  936    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0173616  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0319  acetyl-CoA synthetase  66.93 
 
 		 652 aa  890    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.994772 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2625  acetyl-coenzyme A synthetase  64.11 
 
 		 649 aa  869    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3703  acetyl-coenzyme A synthetase  64.17 
 
 		 645 aa  831    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.963682 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1067  acetyl-CoA synthetase  69.01 
 
 		 645 aa  951    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0042  acetyl-CoA synthetase  66.45 
 
 		 647 aa  888    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1727  acetyl-CoA synthetase  53.38 
 
 		 654 aa  664    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000298638 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0510  acetate--CoA ligase  63.1 
 
 		 653 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0620636 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06451  acetyl-coenzyme A synthetase  53.97 
 
 		 660 aa  677    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06781  acetyl-coenzyme A synthetase  53.61 
 
 		 658 aa  685    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2044  acetyl-CoA synthetase  60.87 
 
 		 651 aa  850    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.408247  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5037  acetate/CoA ligase  54.22 
 
 		 656 aa  684    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0474  acetyl-CoA synthetase  68.06 
 
 		 650 aa  897    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.165738 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0865  acetyl-coenzyme A synthetase  63.51 
 
 		 649 aa  862    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0558  acetyl-CoA synthetase  64.9 
 
 		 652 aa  869    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0203  acetyl-CoA synthetase  55.92 
 
 		 655 aa  769    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1744  acetyl-CoA synthetase  63.68 
 
 		 651 aa  864    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3520  acetyl-coenzyme A synthetase  53.86 
 
 		 652 aa  696    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.877944  normal  0.990981 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1759  acetyl-CoA synthetase  53.92 
 
 		 655 aa  675    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.147819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1489  acetyl-coenzyme A synthetase  63.3 
 
 		 652 aa  827    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0115492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1811  acetate--CoA ligase  62.32 
 
 		 654 aa  785    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.573695  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2691  acetyl-CoA synthetase  63.57 
 
 		 649 aa  887    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.217498  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18991  acetyl-coenzyme A synthetase  55.78 
 
 		 658 aa  703    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4809  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 		 660 aa  640    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.313575  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0856  acetyl-coenzyme A synthetase  55.93 
 
 		 644 aa  706    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0521  acetate--CoA ligase  62.93 
 
 		 646 aa  857    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3431  acetyl-CoA synthetase  66.62 
 
 		 654 aa  903    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.405806  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2429  acetyl-coenzyme A synthetase  53.4 
 
 		 631 aa  697    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2371  acetyl-CoA synthetase  55.77 
 
 		 655 aa  692    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2362  acetyl-CoA synthetase  59.66 
 
 		 650 aa  841    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0493483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2434  acetyl-CoA synthetase  59.66 
 
 		 650 aa  841    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.134569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0673  acetyl-CoA synthetase  68.99 
 
 		 645 aa  960    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1469  acetyl-CoA synthetase  59.29 
 
 		 650 aa  840    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.126764  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1621  acetyl-coenzyme A synthetase  64.65 
 
 		 651 aa  860    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.423647  normal  0.248645 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2859  acetate--CoA ligase  52.4 
 
 		 636 aa  697    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 		 666 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52800  acetyl-CoA synthetase  64.05 
 
 		 651 aa  867    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62630  acetyl-CoA synthetase  78.6 
 
 		 645 aa  1072    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_79135  Acyl-CoA synthetase 2 (ACS2)  51.96 
 
 		 679 aa  668    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89873  acetyl-coenzyme A synthetase (Acetate--CoA ligase 1) (Acyl-activating enzyme 1)  51.99 
 
 		 675 aa  663    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00976511 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0745  acetyl-CoA synthetase  65.57 
 
 		 650 aa  905    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.701189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0782  acetate--CoA ligase  54.67 
 
 		 649 aa  728    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0598  acetyl-coenzyme A synthetase  68.33 
 
 		 644 aa  947    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.957105  normal  0.326929 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2523  acetyl-CoA synthetase  59.81 
 
 		 650 aa  843    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0016553 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1984  acetyl-coenzyme A synthetase  53.81 
 
 		 657 aa  648    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0550  acetyl-CoA synthetase  50.23 
 
 		 667 aa  669    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0200961  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4213  acetate--CoA ligase  63.19 
 
 		 651 aa  819    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.169041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4550  acetate--CoA ligase  63.19 
 
 		 651 aa  818    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0101  acetyl-CoA synthetase  58.85 
 
 		 652 aa  830    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2232  acetate--CoA ligase  63.26 
 
 		 653 aa  827    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.590235  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2079  acetyl-CoA synthetase  62.42 
 
 		 650 aa  857    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4895  acetyl-CoA synthetase  50.7 
 
 		 660 aa  640    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.151369 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3120  acetate--CoA ligase  60.93 
 
 		 649 aa  845    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06841  acetyl-coenzyme A synthetase  52.1 
 
 		 660 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.184496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2219  acetate--CoA ligase  65.63 
 
 		 649 aa  890    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0401  acetate--CoA ligase  57.33 
 
 		 661 aa  724    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.170824 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>