299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4254 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_4152  sodium/hydrogen exchanger  92.81 
 
 		 608 aa  1069    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1467  sodium/hydrogen exchanger  98 
 
 		 601 aa  1155    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.236845 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1380  putative sodium/hydrogen antiporter  74.21 
 
 		 611 aa  861    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00463957  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1024  Sodium/hydrogen exchanger  82.8 
 
 		 602 aa  961    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.30796  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0220  hypothetical protein  53.99 
 
 		 598 aa  637    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1072  sodium/hydrogen exchanger  97 
 
 		 601 aa  1117    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.558941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16030  putative sodium/hydrogen antiporter  74.21 
 
 		 611 aa  861    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4254  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 601 aa  1174    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000727  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  50.84 
 
 		 599 aa  589  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04922  Na+/K+/H+ antiporter  50.17 
 
 		 597 aa  584  1.0000000000000001e-165  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0511  sodium/hydrogen exchanger  49.58 
 
 		 622 aa  578  1.0000000000000001e-163  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1982  sodium/hydrogen exchanger  50.17 
 
 		 619 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3909  Na+/H+ antiporter  49.16 
 
 		 607 aa  555  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2318  sodium/hydrogen exchanger  51.71 
 
 		 599 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0395796  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0127  sodium/hydrogen exchanger  46.11 
 
 		 760 aa  524  1e-147  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.302904  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2537  sodium/hydrogen exchanger family protein  49.14 
 
 		 669 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2147  sodium/hydrogen exchanger  48.8 
 
 		 670 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.251145  normal  0.368531 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2224  sodium/hydrogen exchanger  48.8 
 
 		 673 aa  521  1e-146  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00760493  normal  0.0969988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2324  sodium/hydrogen exchanger  48.46 
 
 		 670 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.339898  normal  0.580137 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2605  sodium/hydrogen exchanger  47.86 
 
 		 637 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00858761  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1998  sodium/hydrogen exchanger  47.16 
 
 		 616 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000112153 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1871  sodium/hydrogen exchanger family protein  49.49 
 
 		 666 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2109  sodium/hydrogen exchanger  49.66 
 
 		 643 aa  511  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.235083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0477  sodium/hydrogen exchanger  48.19 
 
 		 616 aa  506  9.999999999999999e-143  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2017  sodium/hydrogen exchanger  49.24 
 
 		 660 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000155921  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00461  Na+/H+ antiporter  47.14 
 
 		 569 aa  504  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2065  sodium/hydrogen exchanger  49.24 
 
 		 660 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000562767  hitchhiker  0.000963897 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2321  sodium/hydrogen exchanger  49.08 
 
 		 660 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.545125  hitchhiker  0.000203679 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2308  sodium/hydrogen exchanger  49.24 
 
 		 660 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0707  sodium/hydrogen exchanger  46.41 
 
 		 651 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2400  sodium/hydrogen exchanger  48.07 
 
 		 625 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000130765  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0146  CPA1 family Na(+)/H(+) antiporter  44.54 
 
 		 763 aa  491  1e-137  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000269507 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0850  sodium/hydrogen exchanger  48.54 
 
 		 617 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0156  sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 		 764 aa  488  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4478  sodium/hydrogen exchanger  48.25 
 
 		 602 aa  488  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1861  sodium/hydrogen exchanger  47.88 
 
 		 719 aa  484  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.182882  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1211  Sodium/hydrogen exchanger  44.37 
 
 		 611 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0280603  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1732  sodium/hydrogen exchanger  47.8 
 
 		 702 aa  478  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0424  sodium/hydrogen exchanger  41.58 
 
 		 852 aa  389  1e-107  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0521  Sodium/hydrogen exchanger  39.96 
 
 		 604 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4286  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.23 
 
 		 596 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0381852  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4654  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.39 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4781  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.39 
 
 		 596 aa  366  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4369  sodium/hydrogen exchanger  36.39 
 
 		 596 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4275  Na+/H+ exchanger (Na+/H+ antiporter)  36.23 
 
 		 596 aa  365  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4667  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.23 
 
 		 596 aa  365  1e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4436  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.23 
 
 		 596 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00005477  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0868  Na(+):H(+) antiporter  39.07 
 
 		 606 aa  344  2e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2869  sodium/hydrogen exchanger  36.82 
 
 		 623 aa  340  4e-92  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.824474  normal  0.920346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03225  Na(+):H(+) antiporter, CPA1 family protein  39.54 
 
 		 625 aa  319  1e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19170  NhaP-type Na+(K+)/H+ antiporter  34.52 
 
 		 640 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490991  normal  0.0684118 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0042  sodium/hydrogen exchanger  34 
 
 		 607 aa  283  6.000000000000001e-75  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.126585  normal  0.101979 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0759  sodium/hydrogen exchanger  40.34 
 
 		 584 aa  279  1e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.135673  normal  0.3149 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2891  sodium/hydrogen exchanger  37.94 
 
 		 652 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3229  sodium/hydrogen exchanger  37.94 
 
 		 652 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0859  sodium/hydrogen exchanger  37.7 
 
 		 640 aa  261  2e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0888  sodium/hydrogen exchanger  37.84 
 
 		 628 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.043911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5185  sodium/hydrogen exchanger  40.46 
 
 		 660 aa  258  2e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1446  sodium/hydrogen exchanger  35.84 
 
 		 641 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4282  sodium/hydrogen exchanger  36.82 
 
 		 609 aa  250  6e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2077  Na+/H+ antiporter, putative  30.46 
 
 		 595 aa  239  8e-62  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2292  sodium/hydrogen exchanger  36.02 
 
 		 637 aa  238  2e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.042334  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0956  sodium/hydrogen exchanger  36.98 
 
 		 639 aa  237  5.0000000000000005e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2740  Sodium/hydrogen exchanger  36.16 
 
 		 629 aa  236  6e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.370681 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4262  sodium/hydrogen exchanger  35.81 
 
 		 741 aa  234  3e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.387435  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1363  sodium/hydrogen exchanger  29.92 
 
 		 610 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00040523  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3722  TrkA-N domain protein  34.3 
 
 		 617 aa  223  9.999999999999999e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.207998  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3335  sodium/hydrogen exchanger  37.25 
 
 		 620 aa  214  2.9999999999999995e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.263671  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2394  Na+/H+ antiporter  42.25 
 
 		 593 aa  214  3.9999999999999995e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00954713  hitchhiker  0.00302602 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3265  hypothetical protein  28.92 
 
 		 612 aa  211  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.769883  normal  0.438481 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0112  TrkA-N domain protein  33.81 
 
 		 617 aa  206  7e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.440921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3821  sodium/hydrogen exchanger  41.78 
 
 		 407 aa  205  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0739  TrkA-N domain protein  33.26 
 
 		 630 aa  196  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.524407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1318  TrkA-N domain protein  33.84 
 
 		 628 aa  176  9.999999999999999e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0378  TrkA-N domain protein  33.03 
 
 		 626 aa  173  6.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05361  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.09 
 
 		 399 aa  166  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0472  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.58 
 
 		 399 aa  160  7e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0494569  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04971  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 		 401 aa  155  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05271  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.69 
 
 		 401 aa  155  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0377759  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06781  putative Na+/H+ antiporter, CPA1 family  34.9 
 
 		 421 aa  154  5e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1720  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.29 
 
 		 414 aa  150  5e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04731  CPA1 family Na+/H+ antiporter  32.96 
 
 		 402 aa  142  1.9999999999999998e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.281963  normal  0.831051 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0640  CPA1 family Na+/H+ antiporter  34.7 
 
 		 421 aa  141  3e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1805  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.62 
 
 		 414 aa  136  9e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.781588  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05281  CPA1 family Na+/H+ antiporter  31.62 
 
 		 414 aa  136  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0626531  normal  0.0646135 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0056  potassium/proton antiporter  30.93 
 
 		 597 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0157  potassium/proton antiporter  30.13 
 
 		 596 aa  107  8e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0657  potassium/proton antiporter  27.81 
 
 		 597 aa  106  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0833853 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0827  sodium/hydrogen exchanger  29.12 
 
 		 605 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0583075 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0583  sodium/hydrogen exchanger  31.16 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5023  sodium/hydrogen exchanger family protein  29.77 
 
 		 598 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0502  potassium/proton antiporter  29.77 
 
 		 580 aa  103  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002210  NhaP-type Na+/H+ and K+/H+ antiporter  28.68 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.90325  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0762  potassium/proton antiporter  27.42 
 
 		 576 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2276  potassium/proton antiporter  28.12 
 
 		 581 aa  99.8  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0543146  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0846  transporter-associated region:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  28.39 
 
 		 588 aa  97.8  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0222  potassium/proton antiporter  30.67 
 
 		 499 aa  97.4  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0393  potassium/proton antiporter  30.75 
 
 		 597 aa  96.7  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7379  potassium/proton antiporter  29.2 
 
 		 597 aa  95.5  3e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0580  potassium/proton antiporter  29.4 
 
 		 598 aa  95.1  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.316248  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>