More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4150 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4150  phage integrase family protein  100 
 
 		 326 aa  673    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0489444 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4057  site-specific recombinase, phage integrase family  78.57 
 
 		 325 aa  534  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.251442  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4875  integrase family protein  32.15 
 
 		 368 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446933  hitchhiker  0.00171454 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  33.02 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4708  integrase family protein  31.76 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.014031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2250  phage integrase family site specific recombinase  33.73 
 
 		 338 aa  125  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.150880000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1185  phage-related integrase  39.32 
 
 		 339 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1016  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2301  integrase protein  28.31 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.054386  hitchhiker  1.04073e-17 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1655  phage integrase family protein  27.61 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000880499  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1212  integrase family protein  35.92 
 
 		 339 aa  112  9e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.225164  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1275  integrase family protein  36.89 
 
 		 339 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2846  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.31 
 
 		 344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0361729 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0429  phage-related integrase  35.44 
 
 		 339 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0376  integrase family protein  35.44 
 
 		 339 aa  111  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0894  phage-related integrase  34.95 
 
 		 339 aa  110  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2257  phage integrase family site specific recombinase  28.87 
 
 		 342 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000231464  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1340  phage-related integrase  34.95 
 
 		 339 aa  109  5e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2355  phage integrase family site specific recombinase  31.02 
 
 		 334 aa  109  7.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3509  integrase family protein  27.71 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.167819  hitchhiker  0.00517521 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2832  Phage integrase:Phage integrase, N-terminal SAM-like  31.31 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.206304  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1150  phage integrase family site specific recombinase  27.38 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000198353  hitchhiker  0.0000000000000625111 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2415  phage integrase family site specific recombinase  33.64 
 
 		 270 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3384  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000032973  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0808  integrase family protein  34.3 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1083  integrase family protein  35.75 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000439188  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1129  site-specific recombinase, phage integrase family  32.98 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.3601e-24 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2817  site-specific recombinase, phage integrase family  27.8 
 
 		 359 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000101654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1490  phage integrase family site specific recombinase  33.18 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1686  phage integrase family site specific recombinase  33.18 
 
 		 270 aa  102  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0310  phage integrase family site specific recombinase  33.64 
 
 		 228 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0342  phage integrase family site specific recombinase  33.64 
 
 		 228 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2096  phage integrase family protein  33.88 
 
 		 200 aa  100  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635069  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3920  phage integrase, putative  27.89 
 
 		 349 aa  100  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.227044  normal  0.0484515 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4095  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 335 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3987  phage integrase family site specific recombinase  32.14 
 
 		 319 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00618755 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2648  phage integrase family protein  33.91 
 
 		 182 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2290  phage-related integrase  30.81 
 
 		 346 aa  83.2  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.306481  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.44 
 
 		 411 aa  82.4  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1532  phage integrase, putative  29.72 
 
 		 368 aa  82.4  0.000000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.697393  normal  0.0751805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  24.91 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  24.91 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  29.3 
 
 		 387 aa  79.7  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1599  intergrase  32.45 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000122116 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  29.13 
 
 		 222 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.38 
 
 		 397 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2889  lambda integrase  25.83 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  normal  0.0727877 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0877  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 356 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2475  integrase family protein  23.5 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1790  phage integrase family protein  23.86 
 
 		 361 aa  75.1  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0999654  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3294  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.550021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3110  putative phage integrase  27.24 
 
 		 350 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000337156  decreased coverage  0.0000174724 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2419  phage integrase family protein  25.86 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.342392 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1650  phage integrase family protein  28.7 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.187891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1927  integrase family protein  27.79 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0800  phage integrase family protein  25.53 
 
 		 356 aa  72.8  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.501928  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  27.98 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2946  integrase  25.95 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00837646  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25.57 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3623  putative integrase  27.98 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238631  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2771  phage-related integrase  25.14 
 
 		 311 aa  71.2  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.256547  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.28 
 
 		 388 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.57 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 376 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  25.11 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1203  hypothetical protein  26.79 
 
 		 360 aa  69.7  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000176468  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.18 
 
 		 412 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  25.91 
 
 		 402 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0988  integrase family protein  27.27 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  26.38 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  26.38 
 
 		 331 aa  67.4  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0886  phage-related integrase  25.57 
 
 		 349 aa  67  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.280114  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.44 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1378  integrase family protein  27.23 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.545263  hitchhiker  0.00000000645491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  26.34 
 
 		 347 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  26.11 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2519  integrase family protein  30.12 
 
 		 346 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2028  integrase family protein  29.36 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0383876  normal  0.0301338 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  27.75 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2865  phage integrase  27.27 
 
 		 370 aa  64.7  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.520837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6293  integrase family protein  28.99 
 
 		 344 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1328  phage integrase  24.88 
 
 		 333 aa  63.9  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.478819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.08 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  25.37 
 
 		 334 aa  63.2  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 412 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0325  phage integrase  26.58 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.701127  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5393  integrase family protein  25.37 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  23.22 
 
 		 378 aa  62  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0275  phage integrase  26.79 
 
 		 359 aa  62.4  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0362718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  28.37 
 
 		 396 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2906  integrase family protein  28.57 
 
 		 357 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0825768  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01326  site-specific recombinase, phage integrase family  20.54 
 
 		 342 aa  62.4  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0890687  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3344  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 360 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563509  normal  0.0469601 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  24.26 
 
 		 365 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  28.97 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2929  integrase family protein  28.12 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3933  integrase family protein  25.78 
 
 		 344 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00343242  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 451 aa  60.8  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>