More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4129 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4129  IstB ATP binding domain-containing protein  100 
 
 		 264 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.695799 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3438  IstB ATP binding domain-containing protein  54.85 
 
 		 268 aa  285  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000228593  unclonable  9.96626e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1552  IstB domain protein ATP-binding protein  58.56 
 
 		 234 aa  268  8e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000031305 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1319  IstB ATP binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 257 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3956  IstB ATP binding domain-containing protein  41.18 
 
 		 260 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0638  IstB ATP binding domain-containing protein  38.84 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.965458  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1434  DNA replication protein DnaC, putative  36.18 
 
 		 259 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1277  IstB domain protein ATP-binding protein  34.58 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0461295 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0137  IstB domain protein ATP-binding protein  34.58 
 
 		 284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.118943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1255  putative replication protein DnaC  33.73 
 
 		 276 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0168344  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1566  DNA replication protein DnaC, putative  33.75 
 
 		 286 aa  124  2e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0658558  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04238  DNA biosynthesis protein  33.9 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000679952  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3636  AAA ATPase  33.9 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000285217  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4954  DNA replication protein DnaC  33.9 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163404  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4593  DNA replication protein DnaC  33.9 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000805827  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4901  DNA replication protein DnaC  33.9 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000247783  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3694  DNA replication protein DnaC  33.9 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000380442  hitchhiker  0.00426992 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04204  hypothetical protein  33.9 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000534515  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5874  DNA replication protein DnaC  33.9 
 
 		 245 aa  109  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000300612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4023  hypothetical protein  33.15 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3827  hypothetical protein  33.15 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.745457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4120  hypothetical protein  33.15 
 
 		 267 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1084  putative replication protein  34.63 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.372508  hitchhiker  0.0000157316 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1054  putative replication protein  34.63 
 
 		 249 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.547763  hitchhiker  0.000000820302 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0425  hypothetical protein  33.15 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0439  hypothetical protein  33.15 
 
 		 267 aa  108  1e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00568017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4906  DNA replication protein DnaC  33.9 
 
 		 245 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000177661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2283  putative replication protein  34.15 
 
 		 249 aa  106  4e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552648  normal  0.146717 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4898  DNA replication protein DnaC  32.2 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.953972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4864  DNA replication protein DnaC  32.2 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4797  DNA replication protein DnaC  32.2 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.849133 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4957  DNA replication protein DnaC  32.2 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.178341  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4951  DNA replication protein DnaC  32.2 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0516  DNA replication protein DnaC  32.77 
 
 		 245 aa  98.6  1e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591707 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0041  hypothetical protein  34.81 
 
 		 241 aa  95.1  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4220  IstB domain protein ATP-binding protein  30.84 
 
 		 261 aa  90.5  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3449  AAA family ATPase  31.34 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.539616  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3454  AAA ATPase  31.34 
 
 		 276 aa  87.4  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2486  hypothetical protein  27.31 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3534  hypothetical protein  30.88 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3818  hypothetical protein  30.88 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1147  IstB ATP binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000971836  decreased coverage  0.00111999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1404  IstB ATP binding domain-containing protein  34.1 
 
 		 267 aa  80.1  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2785  IstB domain protein ATP-binding protein  36.29 
 
 		 275 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2283  IstB domain protein ATP-binding protein  28.5 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.681758  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3170  DNA replication protein-like protein  29.84 
 
 		 249 aa  79  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3988  IstB ATP binding domain-containing protein  30.86 
 
 		 263 aa  77.4  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0089  IstB ATP binding domain-containing protein  30.98 
 
 		 266 aa  74.7  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0885  phage DnaC-like protein  28.29 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0868  DNA replication protein-like protein  28.29 
 
 		 259 aa  74.7  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.752635  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2275  putative replication protein  27.87 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00200673  hitchhiker  0.0000000000000951726 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1254  DNA replication protein DnaC  26.61 
 
 		 242 aa  72.8  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.014499  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2606  DNA replication protein-like protein  34.06 
 
 		 211 aa  72  0.000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000882358 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2013  AAA ATPase  26.26 
 
 		 283 aa  71.6  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0083652  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1499  IstB domain protein ATP-binding protein  29.9 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0674056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2623  DNA replication protein DnaC  26.76 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1260  putative replication protein  26.92 
 
 		 248 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000160786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2340  IstB domain protein ATP-binding protein  29.19 
 
 		 241 aa  69.7  0.00000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0243849  decreased coverage  0.0019144 
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5818  ATPase  30.34 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1289  AAA ATPase  28.88 
 
 		 247 aa  68.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36867 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1434  putative replication protein  25.6 
 
 		 248 aa  68.6  0.0000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00253442  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3709  DNA replication protein-like protein  27.76 
 
 		 293 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.860458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18880  phage DNA replication protein (predicted replicative helicase loader)  38.69 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.614946  normal  0.0813321 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1153  putative replication protein  25.6 
 
 		 248 aa  67.4  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.255011 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2940  DNA replication protein DnaC  26.29 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.443717  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0060  DNA replication protein, DNAC-like  27.72 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0538  ATP-binding protein  27.89 
 
 		 426 aa  65.5  0.0000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.436507  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1184  IstB-like ATP-binding protein  31.54 
 
 		 270 aa  64.3  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.580215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1702  IstB domain protein ATP-binding protein  26.92 
 
 		 245 aa  64.3  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0524  IstB ATP binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0355335  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02920  hypothetical protein  29.88 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000406909  hitchhiker  2.4308e-42 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1816  IstB domain protein ATP-binding protein  24.46 
 
 		 280 aa  63.2  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_479  DNA replication protein  27.78 
 
 		 470 aa  62.4  0.000000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0893  IstB ATP binding domain-containing protein  29.6 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2865  IstB domain protein ATP-binding protein  28.73 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0985234  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0514  IstB ATP binding domain-containing protein  29.51 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3588  DNA replication protein-like  25.34 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3044  IstB-like ATP-binding protein  33.87 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3057  IstB-like ATP-binding protein  33.87 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.965627  normal  0.256495 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0806  AAA ATPase  29.45 
 
 		 343 aa  59.7  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.337759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3654  DNA replication protein-like protein  25.34 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.718161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2874  IstB ATP binding domain-containing protein  27.07 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00426393  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4065  IstB domain protein ATP-binding protein  28.18 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2885  IstB domain protein ATP-binding protein  28.18 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.46368e-23 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2411  IstB domain protein ATP-binding protein  28.18 
 
 		 245 aa  59.3  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.11316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3728  DNA replication protein-like protein  28.19 
 
 		 299 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2847  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1293  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1435  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0907  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4452  IstB domain protein ATP-binding protein  26.49 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2180  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2256  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0885  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00199941  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0017  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0105  DNA replication protein DnaC  26.8 
 
 		 334 aa  58.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3488  IstB domain protein ATP-binding protein  29.28 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0484  IstB-like ATP-binding protein  30.77 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3364  IstB-like ATP-binding protein  30.77 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1041  IstB domain protein ATP-binding protein  30.22 
 
 		 261 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.614106  normal  0.144827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>