61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4115 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_4080  peptidase U35 phage prohead HK97  59.85 
 
 
659 aa  753  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5067  peptidase U35 phage prohead HK97  59.39 
 
 
659 aa  743  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4115  peptidase U35, phage prohead HK97  100 
 
 
649 aa  1305  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2238  peptidase U35, phage prohead HK97  51.59 
 
 
646 aa  605  1e-172  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2246  putative prohead protease  50 
 
 
645 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  1.01798e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2892  putative prohead protease  50 
 
 
645 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  2.04536e-05 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1539  putative prohead protease  50 
 
 
645 aa  595  1e-169  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2613  peptidase U35 phage prohead HK97  47.51 
 
 
661 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.846097  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4282  peptidase U35 phage prohead HK97  47.51 
 
 
661 aa  556  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2015  putative phage-related protein  45.97 
 
 
446 aa  377  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0608266 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0240  putative major head protein/prohead protease  46.41 
 
 
469 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1640  hypothetical protein  41.8 
 
 
431 aa  306  1e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0958  putative major phage head protein/prohead proteinase  34.88 
 
 
357 aa  181  5e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0701578 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2184  peptidase U35, phage prohead HK97  48.94 
 
 
177 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  6.92792e-06 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0239  peptidase U35 phage prohead HK97  49.4 
 
 
206 aa  164  4e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2974  putative major phage head protein/prohead proteinase  32.77 
 
 
360 aa  148  4e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.594334  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1717  prohead protease  46.2 
 
 
525 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.155167  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1641  prohead protease  44.3 
 
 
197 aa  124  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.627569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1622  hypothetical protein  26.42 
 
 
439 aa  90.9  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.264122  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1619  HK97 family phage major capsid protein  24.3 
 
 
437 aa  86.7  1e-15  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.314426 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1753  phage major capsid protein, HK97  26.56 
 
 
435 aa  85.5  2e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.357661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3877  hypothetical protein  25.07 
 
 
490 aa  84.7  5e-15  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0282142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2686  phage major capsid protein, HK97 family  24.36 
 
 
466 aa  82.8  2e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2917  HK97 family phage prohead protease  29.63 
 
 
579 aa  77.8  5e-13  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.595306  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0562  hypothetical protein  23.1 
 
 
472 aa  71.2  5e-11  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.123092  hitchhiker  1.08718e-07 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3514  prohead peptidase  29.69 
 
 
526 aa  71.2  6e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3562  prohead peptidase  29.07 
 
 
526 aa  70.5  9e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.530159 
 
 
-
 
NC_002978  WD0447  phage prohead protease  31.9 
 
 
177 aa  70.1  1e-10  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0713063  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3586  prohead peptidase  28.68 
 
 
526 aa  70.1  1e-10  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.286744  normal  0.0669671 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1601  phage prohead protease, HK97 family  31.41 
 
 
240 aa  65.5  3e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0554  HK97 family phage prohead protease  30.65 
 
 
172 aa  63.5  1e-08  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5150  putative phage-related protein  24.37 
 
 
409 aa  63.5  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.788402  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0276  HK97 family phage prohead protease  36.2 
 
 
168 aa  62  3e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0032  HK97 family phage prohead protease  32.31 
 
 
177 aa  61.2  6e-08  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.378426  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0012  prohead peptidase  34.82 
 
 
177 aa  60.8  8e-08  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1358  HK97 family phage prohead protease  33.96 
 
 
171 aa  60.1  1e-07  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.272379 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1645  putative phage-related protein  24.56 
 
 
444 aa  59.3  2e-07  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1681  hypothetical protein  27.75 
 
 
228 aa  57  1e-06  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1284  major capsid protein HK97  21.8 
 
 
416 aa  57  1e-06  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0461297  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3485  HK97 family phage prohead protease  26.61 
 
 
244 aa  55.1  4e-06  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.41974  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1338  HK97 family phage prohead protease  31.45 
 
 
248 aa  53.5  1e-05  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.155288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0648  prohead peptidase  32.38 
 
 
231 aa  53.5  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.857863  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3708  HK97 family phage prohead protease  29.24 
 
 
371 aa  52.8  2e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1669  prohead peptidase  30.18 
 
 
228 aa  52  3e-05  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1566  head maturation protease, putative  30.82 
 
 
233 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  5.25183e-05 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3652  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.28 
 
 
393 aa  49.7  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1718  peptidase U35, phage prohead HK97  29.59 
 
 
176 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.806315  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  26.7 
 
 
279 aa  47.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1337  phage prohead protease HK97 family  30.65 
 
 
189 aa  47.8  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00130891  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1150  hypothetical protein  27.45 
 
 
624 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0411  hypothetical protein  27.45 
 
 
624 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3121  prohead peptidase  29.63 
 
 
150 aa  46.2  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0369  peptidase U35 phage prohead HK97  27.45 
 
 
624 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1170  peptidase U35 phage prohead HK97  27.45 
 
 
624 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2988  peptidase U35 phage prohead HK97  23.88 
 
 
600 aa  45.8  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0566  peptidase U35 phage prohead HK97  34.04 
 
 
218 aa  45.4  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0319239  hitchhiker  1.24993e-14 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2264  phage prohead protease, HK97 family  35.19 
 
 
216 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0493377 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1189  HK97 family phage prohead protease  35.19 
 
 
216 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  2.50589e-08 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3979  phage prohead protease, HK97 family  33.55 
 
 
165 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2026  peptidase U35, phage prohead HK97  29.41 
 
 
177 aa  44.3  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.671288  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0338  peptidase U35, phage prohead HK97  29.41 
 
 
177 aa  44.3  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.04025  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>