More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4065 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1652  sensor histidine kinase  98.47 
 
 		 458 aa  903    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.736934  normal  0.804947 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1214  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  88.02 
 
 		 463 aa  823    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1254  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  96.25 
 
 		 457 aa  874    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877162  hitchhiker  0.000367617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4065  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 463 aa  927    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.860107  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4220  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  68.64 
 
 		 472 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.345357  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52240  two-component sensor  55.41 
 
 		 445 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.332832 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37040  sensory histidine protein kinase, two component  52.57 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.550956  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4580  sensor protein PfeS  56.08 
 
 		 446 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.193076  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29360  two-component sensor PfeS  52.6 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.124674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1732  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  51.25 
 
 		 445 aa  402  1e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.268392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3963  two-component sensor PfeS  51.24 
 
 		 446 aa  403  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0578  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.67 
 
 		 448 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.317662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0567  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  50.11 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0533  sensor protein PfeS  50.11 
 
 		 442 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.65 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3412  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 471 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 449 aa  227  3e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.59 
 
 		 444 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3919  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 		 448 aa  207  3e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.370556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06113  histidine kinase  28.09 
 
 		 446 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 459 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000458656  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2278  sensor histidine kinase  33.65 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  32.79 
 
 		 452 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2007  putative two-component system sensor kinase  28.13 
 
 		 471 aa  160  4e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0750477  hitchhiker  0.00355536 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4505  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 446 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0126885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1406  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 446 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.0000501512  normal  0.872654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0705  sensor histidine kinase  37.87 
 
 		 381 aa  154  4e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529031 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2596  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 457 aa  154  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.338905 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06762  histidine kinase  26.86 
 
 		 457 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4011  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 		 446 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704889  hitchhiker  0.0000182562 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  28.42 
 
 		 449 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3591  sensor histidine kinase  30.8 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148051  normal  0.772509 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  28.42 
 
 		 449 aa  146  8.000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 449 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0194  two-component system sensor protein, histidine kinase  29.14 
 
 		 461 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0627121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0051  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.12 
 
 		 389 aa  144  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15590  periplasmic sensory histidine protein kinase  37.76 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506473  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3794  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 446 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000335712 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0772  histidine kinase  29.3 
 
 		 456 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000128087  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1803  sensor histidine kinase  30.49 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43373  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2573  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.236887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  32.89 
 
 		 458 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3186  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 469 aa  140  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.62 
 
 		 449 aa  140  7e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 455 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3433  sensor protein CpxA  36.39 
 
 		 453 aa  139  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0911326  normal  0.239328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 449 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1481  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 446 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0335199  normal  0.0698163 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3451  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 		 442 aa  138  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000191939 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  29.27 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  30.55 
 
 		 455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  32.87 
 
 		 449 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  0.0000000026524 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  30.55 
 
 		 455 aa  137  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4561  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.102367  normal  0.107463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  32.37 
 
 		 453 aa  136  7.000000000000001e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 458 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6516  histidine kinase  34.98 
 
 		 429 aa  136  9e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0252048 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1866  putative two-component system sensor kinase  27.79 
 
 		 468 aa  136  9e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 458 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.52 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3571  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.27 
 
 		 455 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.382959  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.335551  normal  0.20337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  31.64 
 
 		 449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4372  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 429 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  32.17 
 
 		 458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  0.0000137847 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000850  probable two-component system sensor kinase  26.05 
 
 		 457 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0135797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0988  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 467 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00659588  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2387  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.235334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 466 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 454 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  33.57 
 
 		 465 aa  133  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3792  sensor histidine kinase  32.77 
 
 		 416 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00122531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 459 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000534801  unclonable  0.0000000336351 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.02 
 
 		 1162 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19410  histidine kinase with HAMP domain  37.19 
 
 		 363 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.241582  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1920  putative two-component sensor  31.39 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 723 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  27.53 
 
 		 445 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3462  ATP-binding region, ATPase-like protein  32.49 
 
 		 471 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.015081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 462 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22730  putative two-component sensor  38.95 
 
 		 445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.172157  normal  0.0503129 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 463 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  34.09 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.76 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3486  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  29.72 
 
 		 461 aa  127  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  30.42 
 
 		 463 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 454 aa  126  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  33.22 
 
 		 469 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0278  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 455 aa  125  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000416507  hitchhiker  0.00000000404182 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6826  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.46 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.181381 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0564  histidine kinase  28.87 
 
 		 456 aa  125  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2357  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.62 
 
 		 458 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.837767  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  30.07 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1224  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.83 
 
 		 563 aa  124  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.600367  normal  0.164924 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6144  Signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3149  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 546 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.305074  normal  0.0948904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>