209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3985 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3985  septum formation inhibitor  100 
 
 
255 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.441904  normal  0.387462 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1284  septum formation inhibitor  94.12 
 
 
248 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1734  septum formation inhibitor  97.65 
 
 
275 aa  448  1e-125  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.597956 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1326  septum formation inhibitor  96.47 
 
 
253 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3872  septum site-determining protein MinC  78.26 
 
 
246 aa  390  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1613  septum formation inhibitor  77.08 
 
 
246 aa  385  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1695  septum formation inhibitor  78.17 
 
 
245 aa  367  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.337254  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1235  septum formation inhibitor  75.93 
 
 
242 aa  354  6.999999999999999e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0560003  normal  0.567033 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22040  septum formation inhibitor  68.44 
 
 
263 aa  348  5e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517212  hitchhiker  0.0000000000000594989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1882  septum formation inhibitor  68.44 
 
 
263 aa  347  8e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35110  septum formation inhibitor  68.88 
 
 
238 aa  325  4.0000000000000003e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3027  septum site-determining protein MinC  45.93 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.218288  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0925  septum site-determining protein MinC  42.26 
 
 
243 aa  182  4.0000000000000006e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00858984  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0508  septum formation inhibitor MinC  43.27 
 
 
244 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2335  septum formation inhibitor  40 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.782568  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1510  hypothetical protein  41.3 
 
 
236 aa  166  4e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1473  hypothetical protein  41.3 
 
 
236 aa  165  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1998  septum site-determining protein MinC  45.23 
 
 
241 aa  165  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.256846  normal  0.258962 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01604  septum site-determining protein MinC  38.37 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00110922  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2354  septum site-determining protein MinC  39.43 
 
 
241 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0186227  normal  0.309008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3066  septum site-determining protein MinC  41.63 
 
 
240 aa  160  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1838  septum site-determining protein MinC  38.37 
 
 
259 aa  157  1e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106899 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1591  septum site-determining protein MinC  45.09 
 
 
247 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.153495  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2756  septum formation inhibitor  40.76 
 
 
233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.00000000039542  hitchhiker  0.00154059 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1503  septum formation inhibitor  38.75 
 
 
235 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00645654  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1952  septum formation inhibitor  38.75 
 
 
235 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00224738  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1956  septum formation inhibitor  38.75 
 
 
235 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000234823  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2013  septum formation inhibitor  38.75 
 
 
235 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00337935  normal  0.267553 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1319  septum formation inhibitor  38.75 
 
 
235 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000000246885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2121  septum formation inhibitor  41.39 
 
 
228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000192978  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2399  septum formation inhibitor  41.39 
 
 
228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000153282  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2010  septum formation inhibitor  41.39 
 
 
228 aa  152  5.9999999999999996e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000596174  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1545  septum formation inhibitor  37.66 
 
 
220 aa  149  4e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000716221  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004086  septum site-determining protein MinC  34.92 
 
 
220 aa  149  5e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000371161  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01151  septum formation inhibitor  38.08 
 
 
231 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.129311  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2472  septum site-determining protein MinC  38.08 
 
 
231 aa  148  7e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000733034  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2449  septum formation inhibitor  38.08 
 
 
231 aa  148  7e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00348167  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1276  septum formation inhibitor  38.08 
 
 
236 aa  148  7e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000289797  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01161  hypothetical protein  38.08 
 
 
231 aa  148  7e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0900971  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01386  septum formation inhibitor  35.32 
 
 
220 aa  148  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1940  septum formation inhibitor  36.67 
 
 
228 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000371298  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3341  septum site-determining protein MinC  36.67 
 
 
227 aa  146  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2236  septum formation inhibitor  38.71 
 
 
228 aa  146  3e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000399265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1936  septum site-determining protein MinC  40.62 
 
 
242 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3345  septum site-determining protein MinC  35.98 
 
 
253 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23046  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2006  septum formation inhibitor  37.5 
 
 
225 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.406679  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2581  septum formation inhibitor  33.47 
 
 
239 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.150935  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0014  septum site-determining protein MinC  35.74 
 
 
243 aa  142  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.062849 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1997  septum formation inhibitor  37.93 
 
 
232 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000933113  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2371  septum formation inhibitor  36.97 
 
 
235 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000657693  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0013  septum site-determining protein MinC  36.78 
 
 
227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.838268  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2424  septum formation inhibitor  36.24 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000361193  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1868  septum formation inhibitor  36.24 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000040137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1902  septum formation inhibitor  36.24 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000746493  normal  0.873963 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1895  septum formation inhibitor  36.24 
 
 
221 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000124722  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1067  septum formation inhibitor  33.33 
 
 
221 aa  138  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00667924  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0036  septum site-determining protein MinC  38.33 
 
 
261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2173  septum formation inhibitor  35.32 
 
 
221 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000273215  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2250  septum formation inhibitor  35.32 
 
 
221 aa  136  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000125523  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1930  septum formation inhibitor  34.17 
 
 
224 aa  136  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000000656846  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1077  septum site-determining protein MinC  35.56 
 
 
233 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00582076  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1765  septum formation inhibitor  36.53 
 
 
221 aa  135  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000919  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1737  septum formation inhibitor  36.65 
 
 
221 aa  135  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2576  septum formation inhibitor  34.82 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1973  septum formation inhibitor  34.87 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000684881  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1329  septum formation inhibitor  34.87 
 
 
236 aa  134  9.999999999999999e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000408843  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1320  septum formation inhibitor  34.87 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000146927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2382  septum formation inhibitor  34.86 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000920942  normal  0.215798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1661  septum formation inhibitor  34.87 
 
 
231 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000772871  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0032  septum site-determining protein MinC  35.36 
 
 
263 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.410574 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0067  septum site-determining protein MinC  37.75 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0084  septum site-determining protein MinC  35.89 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0065  septum site-determining protein MinC  35.89 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4713  septum site-determining protein MinC  38.43 
 
 
248 aa  132  5e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0342769  decreased coverage  0.00921136 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0444  septum formation inhibitor  34.47 
 
 
231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.66341  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1629  septum formation inhibitor  35.29 
 
 
221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000164279  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2444  septum formation inhibitor  34.25 
 
 
236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000352986  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2519  septum formation inhibitor  32.64 
 
 
221 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000141313  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1632  septum site-determining protein MinC  33.85 
 
 
251 aa  128  1.0000000000000001e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1164  septum site-determining protein MinC  32.05 
 
 
228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238053  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2184  septum formation inhibitor  33.74 
 
 
221 aa  126  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000257088  unclonable  0.00000164505 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2970  septum formation inhibitor  39.9 
 
 
242 aa  125  7e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.869143  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0680  septum formation inhibitor  32.53 
 
 
238 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0598  septum formation inhibitor  32.53 
 
 
238 aa  123  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0124  septum site-determining protein MinC  36.18 
 
 
257 aa  122  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0321  septum formation inhibitor  35.94 
 
 
253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0934288  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1096  septum formation inhibitor  51.56 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0020  septum site-determining protein MinC  35.87 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.973742  normal  0.645527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2114  septum formation inhibitor  33.88 
 
 
221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000440493  normal  0.228236 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4340  septum formation inhibitor  36.7 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.255105 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0275  septum site-determining protein MinC  39.43 
 
 
277 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.798079 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0319  septum formation inhibitor  36.4 
 
 
268 aa  120  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3237  septum formation inhibitor  35.47 
 
 
267 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3561  septum formation inhibitor  35.25 
 
 
264 aa  118  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0091  septum site-determining protein MinC  37.82 
 
 
271 aa  117  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2968  septum formation inhibitor  32.97 
 
 
270 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.930496  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1992  septum formation inhibitor  37.56 
 
 
282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3067  septum formation inhibitor  33.21 
 
 
270 aa  116  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0983  septum formation inhibitor  32.96 
 
 
261 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0943  septum formation inhibitor  32.96 
 
 
261 aa  116  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>