176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3965 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1749  acetyltransferase  99.83 
 
 
581 aa  1173    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.489963  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34970  Acetyltransferase GNAT family  76.4 
 
 
579 aa  885    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.20863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1632  acetyltransferase, GNAT family  79.14 
 
 
582 aa  944    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1299  GNAT family acetyltransferase  89.67 
 
 
581 aa  1011    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  79.83 
 
 
582 aa  952    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0306402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  79.27 
 
 
581 aa  921    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19360  GNAT family acetyltransferase  76.71 
 
 
585 aa  889    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.371953  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2956  glutathione synthase  77.97 
 
 
579 aa  889    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0363198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3965  glutathione synthase  100 
 
 
581 aa  1175    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.731928  normal  0.0882664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1667  putative acetyltransferase  76.53 
 
 
585 aa  895    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1341  GNAT family acetyltransferase  98.28 
 
 
581 aa  1158    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.21434  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2468  GCN5-related N-acetyltransferase  56.26 
 
 
593 aa  619  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.290695  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2679  GNAT family acetyltransferase  58.26 
 
 
571 aa  597  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.607587  normal  0.473005 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2963  glutathione synthase  51.38 
 
 
597 aa  589  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0141  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  56.81 
 
 
569 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.789273  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3641  glutathione synthase  52.12 
 
 
595 aa  570  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0113  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  50.63 
 
 
578 aa  560  1e-158  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1988  GCN5-related N-acetyltransferase  52.98 
 
 
562 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0217  GCN5-related N-acetyltransferase  51.14 
 
 
588 aa  543  1e-153  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0815  glutathione synthase  53.33 
 
 
572 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2245  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  52.85 
 
 
584 aa  532  1e-150  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.560299  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5017  GNAT-family acetyltransferase TIGR03103  52.42 
 
 
584 aa  523  1e-147  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2275  GCN5-related N-acetyltransferase  52.78 
 
 
593 aa  525  1e-147  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.264429  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4067  GCN5-related N-acetyltransferase  51.85 
 
 
588 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0859  glutathione synthase  49.18 
 
 
612 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490863 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2054  GCN5-related N-acetyltransferase  51.02 
 
 
594 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.668084  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2100  GCN5-related N-acetyltransferase  51.02 
 
 
594 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0999072 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2037  GCN5-related N-acetyltransferase  51.02 
 
 
594 aa  512  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130763  normal  0.0643161 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0916  glutathione synthase  50.56 
 
 
616 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.777962 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  51.83 
 
 
609 aa  483  1e-135  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0274694  normal  0.643266 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2671  cyanophycin synthetase  37.81 
 
 
896 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.36198  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3981  cyanophycin synthetase  38.17 
 
 
861 aa  171  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5710  cyanophycin synthetase  36.39 
 
 
875 aa  167  4e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.011022 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1058  cyanophycin synthetase  37.42 
 
 
855 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0635  cyanophycin synthetase  36.08 
 
 
861 aa  163  7e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.298111  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0656  cyanophycin synthetase  36.08 
 
 
861 aa  162  1e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.271968  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0132  cyanophycin synthetase  31.6 
 
 
893 aa  160  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.914556  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0617  cyanophycin synthetase  35.03 
 
 
894 aa  160  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.634255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0173  cyanophycin synthetase  35.22 
 
 
881 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859046  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4854  cyanophycin synthetase  35.98 
 
 
914 aa  157  5.0000000000000005e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3265  cyanophycin synthetase  33.83 
 
 
857 aa  155  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.146214  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4082  cyanophycin synthetase  37.5 
 
 
855 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.88935 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3969  cyanophycin synthetase  37.5 
 
 
855 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2204  cyanophycin synthetase  32 
 
 
882 aa  153  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0097589  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2398  cyanophycin synthetase  30.94 
 
 
876 aa  152  1e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4152  cyanophycin synthetase  31.56 
 
 
895 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.38257  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2250  cyanophycin synthetase  34.38 
 
 
856 aa  150  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.755842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0703  cyanophycin synthetase  36.82 
 
 
856 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.331658  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1005  cyanophycin synthetase  35.19 
 
 
862 aa  146  9e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.623044 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13530  cyanophycin synthetase  34.44 
 
 
908 aa  146  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0500694  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2586  cyanophycin synthetase  36.15 
 
 
856 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.96396  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1023  cyanophycin synthetase  35.1 
 
 
855 aa  144  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.434242  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1314  cyanophycin synthetase  33.23 
 
 
858 aa  143  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.098804  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0670  cyanophycin synthetase  31.86 
 
 
856 aa  142  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4989  cyanophycin synthetase  37.15 
 
 
890 aa  141  3.9999999999999997e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.267943  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5803  cyanophycin synthetase  33.96 
 
 
910 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0493543  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1178  cyanophycin synthetase  31.08 
 
 
900 aa  140  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2585  cyanophycin synthetase  33.96 
 
 
878 aa  140  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.588307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4852  cyanophycin synthetase  28.57 
 
 
918 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.744581  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1871  cyanophycin synthetase  31.53 
 
 
939 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0515  cyanophycin synthetase  33.02 
 
 
906 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.371154  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0671  cyanophycin synthetase  30.36 
 
 
730 aa  137  5e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.192053  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0055  cyanophycin synthetase  29.43 
 
 
894 aa  137  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2672  cyanophycin synthetase  34.48 
 
 
871 aa  136  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4040  cyanophycin synthetase  35.29 
 
 
865 aa  136  9e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000142292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1814  cyanophycin synthetase  30.96 
 
 
901 aa  136  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  32.26 
 
 
885 aa  134  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1965  cyanophycin synthetase  30.98 
 
 
902 aa  133  9e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.644693  normal  0.187039 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4081  cyanophycin synthetase  32.71 
 
 
886 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.664063 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1350  cyanophycin synthetase  31.67 
 
 
887 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3968  cyanophycin synthetase  32.71 
 
 
886 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1415  cyanophycin synthetase  33.44 
 
 
872 aa  131  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.557329 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1059  cyanophycin synthetase  32.95 
 
 
748 aa  129  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115061  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1545  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  27.24 
 
 
778 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0227328  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0636  cyanophycin synthetase  32.2 
 
 
723 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.698291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1825  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  26.63 
 
 
778 aa  129  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0657  cyanophycin synthetase  32.2 
 
 
727 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0704  cyanophycin synthetase  34.47 
 
 
883 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.183942  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0873  cyanophycin synthetase  29.05 
 
 
879 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0987  cyanophycin synthetase  28.7 
 
 
877 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0216297 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2187  cyanophycin synthetase  26.71 
 
 
874 aa  125  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0960  cyanophycin synthetase  28.7 
 
 
877 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1114  cyanophycin synthetase  31.35 
 
 
879 aa  125  3e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.654809  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2251  cyanophycin synthetase  31.56 
 
 
746 aa  124  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2477  cyanophycin synthetase  27.27 
 
 
874 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4990  cyanophycin synthetase  30.84 
 
 
741 aa  122  1.9999999999999998e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0271462  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3264  cyanophycin synthetase  30.59 
 
 
751 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.480302  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1416  cyanophycin synthetase  29.65 
 
 
743 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.190049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5052  D-alanine-D-alanine ligase and related ATP-grasp enzymes-like  32.04 
 
 
790 aa  118  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46089  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3980  cyanophycin synthetase  28.11 
 
 
723 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1558  hypothetical protein  28.86 
 
 
328 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2081  Glutathione synthase  29.41 
 
 
646 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5709  cyanophycin synthetase  30.77 
 
 
730 aa  114  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0197645 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1022  cyanophycin synthetase  30.28 
 
 
755 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1983  Cyanophycin synthase (L-arginine-adding)  35.98 
 
 
664 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4039  cyanophycin synthetase  30.51 
 
 
727 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000502251 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0287  bifunctional glutamate--cysteine ligase/glutathione synthetase  25.21 
 
 
757 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.309745  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1006  cyanophycin synthetase  30.63 
 
 
744 aa  110  7.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.264367 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 
1103 aa  109  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00733019  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1315  cyanophycin synthetase  31.09 
 
 
722 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.943879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>