44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3958 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1756  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.150653  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3958  hypothetical protein  100 
 
 
174 aa  352  2e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.309289  normal  0.0283317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1347  hypothetical protein  99.43 
 
 
174 aa  350  8e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.363787  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4092  hypothetical protein  78.74 
 
 
172 aa  276  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.784057  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1363  hypothetical protein  93.29 
 
 
174 aa  270  7e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0624802  normal  0.80692 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3660  hypothetical protein  76.54 
 
 
175 aa  258  3e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.226562  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1732  hypothetical protein  76.54 
 
 
175 aa  258  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.568554  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34870  hypothetical protein  65.22 
 
 
166 aa  201  3e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.113804  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4663  hypothetical protein  59.77 
 
 
167 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0794491  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53200  hypothetical protein  60.34 
 
 
182 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1691  hypothetical protein  65.84 
 
 
165 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.774869  normal  0.207512 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1967  hypothetical protein  34.73 
 
 
178 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2850  hypothetical protein  27.86 
 
 
167 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0085  hypothetical protein  38.39 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0635336  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0073  hypothetical protein  38.39 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.260835  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02766  hypothetical protein  34.15 
 
 
180 aa  68.6  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0067  hypothetical protein  34.82 
 
 
203 aa  67.8  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.68024  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2525  hypothetical protein  26.97 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0188206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1426  hypothetical protein  24.82 
 
 
166 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.40646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0147  hypothetical protein  26.22 
 
 
174 aa  61.2  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0167  hypothetical protein  25.9 
 
 
174 aa  60.5  0.00000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0178  hypothetical protein  31.58 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3385  hypothetical protein  50.85 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.139305 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2077  hypothetical protein  44 
 
 
173 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.759836  normal  0.201615 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1222  hypothetical protein  48.21 
 
 
174 aa  55.1  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2056  hypothetical protein  49.02 
 
 
169 aa  54.7  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.203866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1481  hypothetical protein  41.33 
 
 
169 aa  54.7  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2195  hypothetical protein  48.21 
 
 
169 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3379  hypothetical protein  50 
 
 
140 aa  52.4  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000399217  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1317  hypothetical protein  36.21 
 
 
165 aa  48.5  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.008617  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2902  hypothetical protein  34.29 
 
 
202 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0189219 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3222  hypothetical protein  38 
 
 
181 aa  45.1  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0977  hypothetical protein  54.29 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0492338  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1011  hypothetical protein  54.29 
 
 
178 aa  44.7  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.578847  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3484  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.807247  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2012  hypothetical protein  39.62 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0281  hypothetical protein  23.02 
 
 
261 aa  43.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.790565 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2093  hypothetical protein  51.43 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2231  hypothetical protein  39.62 
 
 
187 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.647185 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1787  hypothetical protein  42.5 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510545  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0603  hypothetical protein  31.33 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.376516  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1460  hypothetical protein  37.74 
 
 
187 aa  42.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0969  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  41.6  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0225  hypothetical protein  31.34 
 
 
166 aa  41.2  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.112746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>