More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3930 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3930  WxcM domain-containing protein  100 
 
 
317 aa  659    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.505027  normal  0.395139 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1070  lipopolysaccharide biosynthesis protein  86.86 
 
 
316 aa  577  1e-164  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710053  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1609  WxcM domain protein  62.95 
 
 
310 aa  430  1e-119  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.875347  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0692  WxcM domain-containing protein  62.46 
 
 
315 aa  422  1e-117  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253812  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1238  WxcM-like  63.96 
 
 
312 aa  419  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219256  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0690  WxcM-like  61.78 
 
 
313 aa  409  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2659  WxcM-like protein  60.53 
 
 
304 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1324  WxcM-like protein  57.52 
 
 
309 aa  382  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3027  WxcM-like protein  59.87 
 
 
153 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0683597  normal  0.28553 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1738  N-acetylglucosamine-1- phosphateuridyltransferase-like protein  52.2 
 
 
201 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1783  WxcM-like protein  54.67 
 
 
171 aa  173  3.9999999999999995e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0895  hexapaptide repeat-containing transferase  47.47 
 
 
202 aa  159  6e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1080  hexapaptide repeat-containing transferase  49.69 
 
 
203 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00205406  normal  0.0149533 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  51.68 
 
 
189 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.532773  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0206  hexapaptide repeat-containing transferase  42.95 
 
 
191 aa  149  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.238916  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1940  putative acetyltransferase  49.02 
 
 
191 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0290  acetyltransferase  45.45 
 
 
194 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0577  transferase hexapeptide repeat containing protein  45.91 
 
 
194 aa  141  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0641  transferase hexapeptide repeat containing protein  48.61 
 
 
192 aa  141  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.312071 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1694  hypothetical protein  43.9 
 
 
182 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.373843  normal  0.731728 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2971  putative acetyltransferase  43.45 
 
 
192 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.727659  normal  0.708619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0704  hexapeptide transferase family protein  45.16 
 
 
194 aa  139  4.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000306748  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1820  hexapaptide repeat-containing transferase  47.06 
 
 
187 aa  138  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0246  hexapaptide repeat-containing transferase  42.11 
 
 
193 aa  138  1e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.35108 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2258  putative acetyltransferase  42.37 
 
 
193 aa  138  1e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0569631  hitchhiker  0.00196203 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1928  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.4 
 
 
196 aa  138  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.746546  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2008  hexapaptide repeat-containing transferase  42.39 
 
 
186 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.500963  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1724  hexapaptide repeat-containing transferase  44.19 
 
 
182 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3256  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.94 
 
 
236 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1692  hypothetical protein  43.51 
 
 
182 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733433  decreased coverage  0.000199621 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0550  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.87 
 
 
193 aa  136  5e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.259438  normal  0.0248751 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4761  transferase hexapeptide repeat containing protein  44.16 
 
 
190 aa  136  5e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000053665  normal  0.125318 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0357  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.14 
 
 
192 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0951  hexapaptide repeat-containing transferase  45.7 
 
 
189 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1122  hexapeptide repeat-containing transferase  40.26 
 
 
517 aa  133  3e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0823  WbbJ protein  42.86 
 
 
193 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1421  hexapaptide repeat-containing transferase  41.56 
 
 
192 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1859  Serine acetyltransferase-like protein  41.94 
 
 
194 aa  132  5e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.127737  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0893  NAD-dependent oxidoreductase  40.26 
 
 
517 aa  132  6e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4289  putative acetyltransferase  43.66 
 
 
197 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.934275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1673  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.94 
 
 
192 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.160587  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4429  hexapaptide repeat-containing transferase  41.51 
 
 
207 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0871  carbohydrate kinase, thermoresistant glucokinase  43.21 
 
 
189 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1985  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.86 
 
 
203 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0062564 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1298  putative acetyltransferase  45 
 
 
207 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.248019  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3128  putative acetyltransferase WbpD  40.12 
 
 
194 aa  130  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0002  hexapeptide transferase family protein  45.1 
 
 
190 aa  130  4.0000000000000003e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123717 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0541  hexapaptide repeat-containing transferase  40.52 
 
 
191 aa  129  5.0000000000000004e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3315  hexapaptide repeat-containing transferase  40 
 
 
196 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.711982 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3016  putative acetyltransferase  42.11 
 
 
215 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0783  hexapaptide repeat-containing transferase  38.12 
 
 
212 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.989182  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1971  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.88 
 
 
207 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365375 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0038  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.63 
 
 
196 aa  116  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1699  WxcM domain-containing protein  44.44 
 
 
136 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1784  WxcM domain protein  42.97 
 
 
134 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1509  transferase hexapeptide repeat containing protein  43.14 
 
 
214 aa  112  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2875  hexapaptide repeat-containing transferase  42.96 
 
 
159 aa  112  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00207  NDP-hexose isomerase  41.79 
 
 
143 aa  110  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6855  transferase hexapeptide repeat containing protein  42.31 
 
 
197 aa  109  7.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0929755 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3028  WxcM domain-containing protein  41.8 
 
 
143 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.437654  normal  0.160839 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2940  WxcM domain protein  40.15 
 
 
145 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5772  transferase hexapeptide repeat containing protein  40.14 
 
 
168 aa  106  6e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3422  WxcM-like  39.53 
 
 
136 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0396977  normal  0.668724 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1300  WxcM domain protein domain protein  39.52 
 
 
131 aa  104  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0973  hexapaptide repeat-containing transferase  39.46 
 
 
160 aa  101  1e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0161902  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3191  WxcM domain-containing protein  40.32 
 
 
138 aa  100  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1289  WxcM domain-containing protein  36.09 
 
 
138 aa  100  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0605  hexapaptide repeat-containing transferase  49.17 
 
 
227 aa  100  4e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.51526  normal  0.572168 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2309  WxcM domain-containing protein  37.07 
 
 
136 aa  100  5e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.132972 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1190  WxcM domain-containing protein  40.16 
 
 
137 aa  99.8  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.432823  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6224  transferase hexapeptide repeat containing protein  39.24 
 
 
168 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.164318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3195  transferase hexapeptide repeat protein  37.5 
 
 
175 aa  98.6  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1066  transferase hexapeptide repeat  36.81 
 
 
175 aa  98.2  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1396  acetyltransferase  40 
 
 
159 aa  96.3  5e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00150  hypothetical protein  36.09 
 
 
138 aa  95.9  9e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0636  WxcM domain protein  40.17 
 
 
136 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.72572 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6420  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.36 
 
 
167 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45706  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1424  hypothetical protein  43 
 
 
138 aa  94.4  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5179  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.61 
 
 
192 aa  94.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.781731  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4804  hexapaptide repeat-containing transferase  37.25 
 
 
166 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159641  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2036  transferase hexapeptide repeat containing protein  41.79 
 
 
193 aa  94  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.327248  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0120  hexapaptide repeat-containing transferase  42.54 
 
 
221 aa  94  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2242  WxcM domain-containing protein  36.75 
 
 
130 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3038  hexapaptide repeat-containing transferase  37.06 
 
 
169 aa  94  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4052  putative acetyltransferase  37.33 
 
 
198 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21040  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridylyltransferase/acetyltransferase  31.02 
 
 
228 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.94293  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1400  WxcM domain-containing protein  40.68 
 
 
132 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0251  WxcM domain protein domain protein  40.52 
 
 
127 aa  91.7  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124345  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1136  acetyltransferase  38.35 
 
 
240 aa  90.9  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1029  hexapaptide repeat-containing transferase  37.5 
 
 
252 aa  89.7  5e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1480  hexapaptide repeat-containing transferase  41.41 
 
 
251 aa  87  3e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0413  acetyl/acyl transferase related protein  35.66 
 
 
230 aa  87  4e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2143  hexapaptide repeat-containing transferase  40.52 
 
 
198 aa  86.7  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.748162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7631  putative acetyltransferase  31.25 
 
 
206 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1022  hexapaptide repeat-containing transferase  36.78 
 
 
251 aa  86.7  5e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2232  hexapaptide repeat-containing transferase  41.38 
 
 
199 aa  86.3  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0167  hexapaptide repeat-containing transferase  40.34 
 
 
254 aa  85.9  8e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.290287  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0476  hexapaptide repeat-containing transferase  37.25 
 
 
193 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.269907  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0040  transferase hexapeptide repeat containing protein  34.69 
 
 
249 aa  85.5  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0803  acetyl/acyl transferase related protein  44.54 
 
 
212 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>