More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3921 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2407  amino acid adenylation domain-containing protein  36.6 
 
 		 3101 aa  681    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.195315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1008  Beta-ketoacyl synthase  37.06 
 
 		 1832 aa  665    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3010  polyketide synthase, type I, putative  45.33 
 
 		 2486 aa  1941    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0317  Beta-ketoacyl synthase  38.43 
 
 		 2476 aa  1332    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.567588 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02547  polyketide synthase, putative (Eurofung)  27.89 
 
 		 2534 aa  758    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1947  Beta-ketoacyl synthase  39.78 
 
 		 2468 aa  722    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1873  Beta-ketoacyl synthase  31.86 
 
 		 2333 aa  733    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3960  Beta-ketoacyl synthase  37.08 
 
 		 2232 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2166  type I polyketide synthase WcbR  42.51 
 
 		 2546 aa  1592    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2289  type I polyketide synthase WcbR  42.51 
 
 		 2546 aa  1593    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0751  Beta-ketoacyl synthase  42.19 
 
 		 2545 aa  1584    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2956  KR domain protein  36.87 
 
 		 3930 aa  641    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0245476 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3286  capsular polysaccharide biosynthesis fatty acid synthase  42.55 
 
 		 2546 aa  1593    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3873  Beta-ketoacyl synthase  42.2 
 
 		 2545 aa  1602    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2223  Beta-ketoacyl synthase  39.63 
 
 		 2468 aa  722    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.978203 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0197  Beta-ketoacyl synthase  34.75 
 
 		 2500 aa  1242    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3959  Beta-ketoacyl synthase  36.09 
 
 		 2230 aa  655    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2723  Beta-ketoacyl synthase  39.37 
 
 		 2492 aa  727    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1341  putative type I polyketide synthase WcbR  50.44 
 
 		 2543 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  37.56 
 
 		 1939 aa  716    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3725  polyketide synthase modules and related proteins-like  36.54 
 
 		 3111 aa  704    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.816556 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1838  Beta-ketoacyl synthase  40.15 
 
 		 2468 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1509  KR domain protein  38.14 
 
 		 2507 aa  810    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2617  Beta-ketoacyl synthase  45.33 
 
 		 2486 aa  1941    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0299  beta-ketoacyl synthase  42.34 
 
 		 2544 aa  1595    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3819  beta-ketoacyl synthase  30.33 
 
 		 2551 aa  1010    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1113  Beta-ketoacyl synthase  36.67 
 
 		 2492 aa  1304    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14838  normal  0.128141 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2600  Beta-ketoacyl synthase  51.94 
 
 		 2543 aa  2368    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3805  Beta-ketoacyl synthase  36.05 
 
 		 2460 aa  654    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.780265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1541  Beta-ketoacyl synthase  49.47 
 
 		 2547 aa  2345    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0782  beta-ketoacyl synthase  42.34 
 
 		 2544 aa  1596    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4330  polyketide synthetase protein  33.35 
 
 		 2523 aa  679    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3921  Beta-ketoacyl synthase-like protein  100 
 
 		 2499 aa  5039    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.802024 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1322  6-deoxyerythronolide-B synthase  34.72 
 
 		 1804 aa  657    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000693596 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1945  Beta-ketoacyl synthase  37.58 
 
 		 2484 aa  1306    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1146  Beta-ketoacyl synthase  40.89 
 
 		 2556 aa  1618    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0539  type I polyketide synthase WcbR  42.51 
 
 		 2546 aa  1592    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1061  type I polyketide synthase WcbR  42.51 
 
 		 2546 aa  1592    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3235  type I polyketide synthase WcbR  42.47 
 
 		 2546 aa  1588    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.606406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3271  type I polyketide synthase WcbR  42.55 
 
 		 2546 aa  1593    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0952  Beta-ketoacyl synthase  37.58 
 
 		 2485 aa  1295    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2955  6-deoxyerythronolide-B synthase  37.9 
 
 		 1867 aa  634  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.13088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4742  Beta-ketoacyl synthase  39.77 
 
 		 1144 aa  624  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0640  Beta-ketoacyl synthase  37.13 
 
 		 2352 aa  617  9.999999999999999e-175  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2972  6-deoxyerythronolide-B synthase  36.62 
 
 		 2136 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1182  Acyl transferase  35.43 
 
 		 2890 aa  598  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  38.84 
 
 		 1656 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0798  amino acid adenylation domain protein  37.03 
 
 		 4183 aa  587  1e-166  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2954  Acyl transferase  35.24 
 
 		 3449 aa  583  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.342173 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1186  Acyl transferase  34.79 
 
 		 2225 aa  583  1e-164  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4745  Beta-ketoacyl synthase  38.47 
 
 		 1587 aa  580  1.0000000000000001e-163  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1173  KR domain protein  33.94 
 
 		 1966 aa  580  1.0000000000000001e-163  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1247  Beta-ketoacyl synthase  35.77 
 
 		 5255 aa  579  1.0000000000000001e-163  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.491739 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12085  hypothetical protein  34.63 
 
 		 4151 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2695  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.49 
 
 		 7110 aa  574  1.0000000000000001e-162  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0172  Beta-ketoacyl synthase  35.29 
 
 		 3176 aa  572  1e-161  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2781  Acyl transferase  35.16 
 
 		 2020 aa  568  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4686  coronafacic acid polyketide synthase I  35.17 
 
 		 2719 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.57402  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2968  6-deoxyerythronolide-B synthase  35.98 
 
 		 1909 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00185411 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4441  Acyl transferase  35.91 
 
 		 2966 aa  565  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3128  beta-ketoacyl synthase  35.74 
 
 		 1828 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.446873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3293  Acyl transferase  34.82 
 
 		 3408 aa  563  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0383  Beta-ketoacyl synthase  35.28 
 
 		 3080 aa  562  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.658279 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1250  Acyl transferase  35.17 
 
 		 3494 aa  560  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000258761 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1248  Beta-ketoacyl synthase  36.02 
 
 		 1831 aa  563  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.238508  hitchhiker  0.00102719 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2768  beta-ketoacyl synthase  35.22 
 
 		 7210 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.1197 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3887  erythronolide synthase  35.71 
 
 		 3158 aa  560  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3986  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.48 
 
 		 1874 aa  560  1e-157  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3124  beta-ketoacyl synthase  34.35 
 
 		 1805 aa  559  1e-157  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.774851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3153  Acyl transferase  34.35 
 
 		 3508 aa  559  1e-157  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.215777 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3889  Beta-ketoacyl synthase  35.87 
 
 		 3493 aa  556  1e-156  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.49017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3395  acyl transferase domain-containing protein  40.97 
 
 		 1823 aa  557  1e-156  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.371857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4132  Acyl transferase  34.26 
 
 		 2277 aa  555  1e-156  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4286  6-deoxyerythronolide-B synthase  33.65 
 
 		 1822 aa  556  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2781  beta-ketoacyl synthase  36.01 
 
 		 3463 aa  551  1e-155  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2974  6-deoxyerythronolide-B synthase., (Acyl-carrier- protein) S-malonyltransferase  40.07 
 
 		 2719 aa  553  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11679  polyketide synthase pks7  34.77 
 
 		 2126 aa  552  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.00819043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12948  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsD  35.12 
 
 		 1827 aa  550  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.413378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0269  beta-ketoacyl synthase  33.77 
 
 		 3676 aa  550  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180962 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1249  Beta-ketoacyl synthase  34.78 
 
 		 1789 aa  550  1e-154  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191618  decreased coverage  0.0000247366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0496  Acyl transferase  35.35 
 
 		 2090 aa  545  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.456019  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2835  beta-ketoacyl synthase  42.52 
 
 		 1580 aa  547  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3119  acyl transferase region  33.08 
 
 		 2085 aa  546  1e-153  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2879  beta-ketoacyl synthase  42.52 
 
 		 1580 aa  547  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337443  normal  0.115744 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3179  acyl transferase domain-containing protein  33.08 
 
 		 2085 aa  546  1e-153  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.569352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1003  beta-ketoacyl synthase  34.49 
 
 		 3696 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3294  Acyl transferase  35.23 
 
 		 6768 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3126  beta-ketoacyl synthase  39.37 
 
 		 1581 aa  543  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.228806  normal  0.663439 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2866  beta-ketoacyl synthase  42.17 
 
 		 1580 aa  543  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.385254  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3130  acyl transferase domain-containing protein  33.02 
 
 		 2085 aa  542  9.999999999999999e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2953  Acyl transferase  37.29 
 
 		 1114 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.622829 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3391  beta-ketoacyl synthase  35.67 
 
 		 1806 aa  540  1e-151  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.492462  normal  0.298792 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0244  beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 		 3693 aa  540  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0254  beta-ketoacyl synthase  33.83 
 
 		 3693 aa  540  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0409493 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0234  beta-ketoacyl synthase  33.85 
 
 		 3702 aa  538  1e-151  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2778  beta-ketoacyl synthase  35.49 
 
 		 3711 aa  534  1e-150  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00772657 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7004  Acyl transferase  33.39 
 
 		 2846 aa  533  1e-149  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0213287 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12945  phenolpthiocerol synthesis type-I polyketide synthase ppsA  40.28 
 
 		 1876 aa  533  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.918232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0405  beta-ketoacyl synthase  33.19 
 
 		 3679 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.541813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4604  amino acid adenylation domain protein  35.75 
 
 		 4607 aa  532  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>