287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3825 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3825  pili assembly chaperone  100 
 
 
245 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1465  pili assembly chaperone  55.83 
 
 
244 aa  263  2e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.548977 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2229  chaperone protein PapD  54.59 
 
 
251 aa  258  8e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.482953  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2038  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  53.88 
 
 
248 aa  257  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361686  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  49.79 
 
 
259 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1500  pili assembly chaperone  50.7 
 
 
245 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0208  putative chaperone protein EcpD  36.33 
 
 
245 aa  152  7e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2971  putative fimbrial chaperone protein  37.29 
 
 
247 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  37.56 
 
 
250 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0151  putative chaperone protein EcpD  35.78 
 
 
246 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00134354  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3033  Pili assembly chaperone, N-terminal  41.87 
 
 
243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3975  putative chaperone protein EcpD  33.47 
 
 
247 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1054  pili assembly chaperone  34.84 
 
 
234 aa  132  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0368487 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3462  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.48 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000279745  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2873  pili assembly chaperone  38.36 
 
 
226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3519  putative chaperone protein EcpD  34.71 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0338964  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00139  predicted periplasmic pilin chaperone  34.48 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0365328  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00138  hypothetical protein  34.48 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0326342  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0143  putative chaperone protein EcpD  34.48 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000190021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0143  putative chaperone protein EcpD  34.48 
 
 
246 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867572  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6668  Pili assembly chaperone, N-terminal  40 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0489694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0149  putative chaperone protein EcpD  33.06 
 
 
241 aa  129  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0213386  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0575  pili assembly chaperone  33.33 
 
 
256 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3291  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.71 
 
 
238 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0353367 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6637  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.47 
 
 
250 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480181  hitchhiker  0.00000000170705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3754  pili assembly chaperone  36.96 
 
 
248 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6928  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.72 
 
 
265 aa  124  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.35944  normal  0.811433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0116  fimbrial chaperone protein ecpD  35 
 
 
241 aa  122  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1818  pili assembly chaperone  33.88 
 
 
249 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000389193 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  31.9 
 
 
246 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0064  chaperone protein precursor  32.67 
 
 
266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.00812776  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  32.33 
 
 
227 aa  118  7e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3625  pili assembly chaperone protein  30.8 
 
 
231 aa  118  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1535  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.33 
 
 
266 aa  118  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0256445  normal  0.556062 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1022  fimbrial chaperone protein  37.5 
 
 
256 aa  118  9e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.490389  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1015  chaperone CupB2  32.22 
 
 
248 aa  118  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.674844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2232  fimbrial chaperone protein  37.45 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0389823  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2089  fimbrial assembly chaperone protein  37.45 
 
 
256 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3917  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.92 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.878446 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4105  pili assembly chaperone protein  38.1 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2032  fimbrial assembly chaperone protein  37.45 
 
 
256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.381459  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0053  pili assembly chaperone  38.1 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4022  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.92 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3961  putative pili assembly chaperone, N- domain  32.92 
 
 
232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0053  Pili assembly chaperone, N-terminal  32.27 
 
 
266 aa  116  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.541811  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  30.4 
 
 
231 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0151  fimbrial assembly chaperone protein  33.18 
 
 
236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0831  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.55 
 
 
248 aa  115  5e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.440668  normal  0.119444 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1599  chaperone protein EcpD precursor  33.18 
 
 
240 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307824  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0127  fimbrial assembly chaperone protein  33.18 
 
 
245 aa  115  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  31.48 
 
 
237 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  31.78 
 
 
257 aa  115  8.999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03010  predicted periplasmic pilin chaperone  30.4 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3852  putative gram-negative pili assembly chaperone, N- domain  32.5 
 
 
232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0370  fimbrial chaperone protein  35.71 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.189862 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0372  fimbrial chaperone protein  35.71 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.577806  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  30.97 
 
 
249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02961  hypothetical protein  30.4 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0432  fimbrial chaperone protein  35.71 
 
 
267 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.206552  hitchhiker  0.0000544991 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3335  pili assembly chaperone protein  30.4 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.63342  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0555  pili assembly chaperone  30.4 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.970343  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4164  pili assembly chaperone protein  37.57 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00562333 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  32.39 
 
 
250 aa  113  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1272  chaperone protein FimC  29.79 
 
 
225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.910323  normal  0.405441 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2659  fimbrial assembly chaperone protein  34.65 
 
 
245 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0270298  normal  0.0110591 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2694  pili assembly chaperone  35.44 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0316944  hitchhiker  0.00667169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1364  pili assembly chaperone  35.44 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.353604  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1476  pili assembly chaperone  35.44 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.952607  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0392  fimbrial chaperone protein  35.71 
 
 
309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.533887  normal  0.0135729 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0380  fimbrial chaperone protein  36.55 
 
 
309 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0692869 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1787  pili assembly chaperone  34.65 
 
 
259 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0172451  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4461  gram-negative pili assembly chaperone protein  30.45 
 
 
224 aa  113  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0615  chaperone protein PapD  33.95 
 
 
239 aa  113  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3810  Pili assembly chaperone, N-terminal  33 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0391987  normal  0.124157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11070  chaperone CupB2  31.95 
 
 
248 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.745503  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3923  Pili assembly chaperone, N-terminal  33 
 
 
247 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.358656  normal  0.566628 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0208  chaperone protein FimC  30.66 
 
 
227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1676  fimbrial assembly chaperone protein  34.65 
 
 
245 aa  112  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.315033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0562  Pili assembly chaperone, N-terminal  34.76 
 
 
243 aa  112  6e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.333601 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0191  chaperone protein FimC  30.19 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0195  chaperone protein FimC  30.66 
 
 
227 aa  111  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.857802  normal  0.345309 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0200  chaperone protein FimC  30.19 
 
 
227 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.873819  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  33.7 
 
 
252 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0192  chaperone protein FimC  30.19 
 
 
227 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0696  pili assembly chaperone  32.77 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0839  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  29.49 
 
 
251 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0251  fimbrial chaperone protein  32.77 
 
 
239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0319296  hitchhiker  0.0000992715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1132  pili assembly chaperone: pili assembly chaperone  31.46 
 
 
264 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.083408 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0762  Pili assembly chaperone, N-terminal  35.15 
 
 
248 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.0172596 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4242  pili assembly chaperone protein  32.79 
 
 
243 aa  108  7.000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4921  chaperone protein FimC  32.33 
 
 
229 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4145  pili assembly chaperone  34.17 
 
 
251 aa  108  9.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193579  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4095  long polar fimbrial operon protein LpfB  32.79 
 
 
243 aa  108  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.124467 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1313  pili assembly chaperone  32.56 
 
 
250 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.654177  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  30.73 
 
 
234 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5934  pili assembly chaperone  30.14 
 
 
253 aa  106  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2449  pili assembly chaperone  31.15 
 
 
228 aa  106  3e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4722  pili assembly chaperone  35.05 
 
 
252 aa  105  7e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.570892  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3392  pili assembly chaperone  27.31 
 
 
248 aa  104  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1533  Pili assembly chaperone, N-terminal  33.95 
 
 
252 aa  104  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.981289  normal  0.941111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>