170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3729 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2013  metallophosphoesterase  99.69 
 
 
323 aa  664    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1545  metallophosphoesterase  96.9 
 
 
323 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.556937  normal  0.552799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3729  metallophosphoesterase  100 
 
 
323 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1573  metallophosphoesterase  92.57 
 
 
323 aa  624  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.24274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2196  metallophosphoesterase  80.37 
 
 
323 aa  545  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24230  hypothetical protein  75 
 
 
326 aa  507  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000134322  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3792  serine/threonine protein phosphatase  76.4 
 
 
323 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.055034  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1686  metallophosphoesterase  76.64 
 
 
321 aa  504  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.275545  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2051  hypothetical protein  74.07 
 
 
326 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00546921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2943  metallophosphoesterase  71.25 
 
 
324 aa  485  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0111879  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34060  Metallophosphoesterase protein  70.4 
 
 
328 aa  472  1e-132  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0103996  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2071  diadenosine tetraphosphatase and related serine/threonine protein phosphatase  59.68 
 
 
337 aa  404  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.125008  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1308  hypothetical protein  53.85 
 
 
335 aa  349  4e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1734  serine/threonine protein phosphatase  52.5 
 
 
338 aa  343  2.9999999999999997e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1311  metallophosphoesterase  36.31 
 
 
311 aa  214  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.452113  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4095  metallophosphoesterase  36.77 
 
 
309 aa  212  5.999999999999999e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5182  metallophosphoesterase  36.2 
 
 
352 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2203  metallophosphoesterase  35.26 
 
 
329 aa  168  1e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1103  metallophosphoesterase  34.44 
 
 
350 aa  159  7e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0277  hypothetical protein  31.68 
 
 
323 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0304  hypothetical protein  31.46 
 
 
314 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1831  hypothetical protein  31.51 
 
 
427 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2270  hypothetical protein  30.19 
 
 
454 aa  130  3e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2477  ADP-ribosylation/crystallin J1  28.38 
 
 
1138 aa  118  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.462272 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1910  hypothetical protein  28.76 
 
 
298 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0184163  decreased coverage  0.000813491 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1977  metallophosphoesterase  40 
 
 
850 aa  92.8  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.350042  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4542  metallophosphoesterase  51.69 
 
 
859 aa  89.7  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.703829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1593  metallophosphoesterase  36.94 
 
 
858 aa  84.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.97058  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2768  metallophosphoesterase  38.06 
 
 
870 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.262412  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1723  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  38.56 
 
 
853 aa  81.6  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000078095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0483  metallophosphoesterase  38.36 
 
 
830 aa  80.5  0.00000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0942  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  35.76 
 
 
852 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2707  metallophosphoesterase  25.98 
 
 
412 aa  79.7  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.144061 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6752  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase(symmetrical)  39.47 
 
 
847 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3744  putative protein serine-threonine phosphatase  34.16 
 
 
852 aa  78.6  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.614096  normal  0.060115 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2592  putative phosphatase  39.07 
 
 
447 aa  77.4  0.0000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.739631  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4972  metallophosphoesterase  27.81 
 
 
360 aa  77.4  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0167  metallophosphoesterase  39.49 
 
 
852 aa  75.9  0.0000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.500527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2565  metallophosphoesterase  33.77 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.887956  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5514  metallophosphoesterase  36.36 
 
 
870 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425865  normal  0.108613 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0921  metallophosphoesterase  34.21 
 
 
847 aa  74.3  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.168883  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37630  predicted kinase  35.53 
 
 
877 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3131  metallophosphoesterase  37.25 
 
 
857 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000324494  hitchhiker  0.000110445 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2179  metallophosphoesterase  31.25 
 
 
258 aa  70.9  0.00000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2392  metallophosphoesterase  37.91 
 
 
852 aa  70.1  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.949066  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1195  metallophosphoesterase  34.39 
 
 
863 aa  70.1  0.00000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0827204  normal  0.0150565 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1664  metallophosphoesterase  48.65 
 
 
269 aa  67.4  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0848196 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3285  Bis(5'-nucleosyl)- tetraphosphatase(asymmetrical)  31.08 
 
 
847 aa  65.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00153744 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0778  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40 
 
 
245 aa  63.9  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3502  metallophosphoesterase  34.87 
 
 
834 aa  63.2  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0262  diadenosine tetraphosphatase  29.5 
 
 
279 aa  62.4  0.000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1989  metallophosphoesterase  37.23 
 
 
236 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1210  metallophosphoesterase  31.61 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0838  metallophosphoesterase  37.8 
 
 
448 aa  61.6  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2800  metallophosphoesterase  33.15 
 
 
242 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0227115  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1049  diadenosine tetraphosphatase  25.57 
 
 
275 aa  60.8  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0099941  normal  0.793665 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1633  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  30.92 
 
 
245 aa  60.5  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0918  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  42.11 
 
 
246 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.562168  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4014  metallophosphoesterase  38.31 
 
 
864 aa  60.5  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.248508 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2701  metallophosphoesterase  30.34 
 
 
246 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.41286  normal  0.371482 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2893  metallophosphoesterase  32.58 
 
 
242 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.331732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1257  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
246 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4084  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
246 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1124  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1099  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1658  diadenosine tetraphosphatase  26.32 
 
 
282 aa  58.9  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1217  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1286  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2983  metallophosphoesterase  50 
 
 
854 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1105  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2593  metallophosphoesterase  27.95 
 
 
230 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000136211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1362  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  40.79 
 
 
246 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2707  metallophosphoesterase  32.02 
 
 
242 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.430014  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0240  diadenosine tetraphosphatase  28.57 
 
 
279 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.589484  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3306  metallophosphoesterase  29.94 
 
 
251 aa  56.6  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.645763  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2248  metallophosphoesterase  30.07 
 
 
251 aa  56.6  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2630  serine/threonine protein phosphatase, putative  31.82 
 
 
227 aa  55.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2646  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.82 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.476513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3470  bis(5'nucleosyl)-tetraphosphatase, ApaH  30.82 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0625  diadenosine tetraphosphatase  30.82 
 
 
282 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5084  metallophosphoesterase  36.05 
 
 
221 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349721  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1680  serine/threonine protein phosphatase  37.35 
 
 
235 aa  53.9  0.000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1112  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  39.47 
 
 
246 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1324  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase PrpE  39.47 
 
 
246 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43482  predicted protein  27.01 
 
 
1225 aa  53.5  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3932  diadenosine tetraphosphatase  25.84 
 
 
276 aa  53.5  0.000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1187  metallophosphoesterase  31.21 
 
 
243 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.634228  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0841  metallophosphoesterase  42.47 
 
 
226 aa  53.5  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3990  metallophosphoesterase  31.37 
 
 
250 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.399345 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5380  metallophosphoesterase  43.53 
 
 
221 aa  52.8  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04713  Ser/Thr protein phosphatase family (AFU_orthologue; AFUA_5G08620)  33.33 
 
 
259 aa  52.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0458  metallophosphoesterase  25.33 
 
 
230 aa  52.4  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0573  diadenosine tetraphosphatase  30.22 
 
 
296 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1654  serine/threonine specific protein phosphatase  39.19 
 
 
206 aa  51.6  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.0069459  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1931  serine/threonine protein phosphatase  33.12 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.824915  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001667  bis(5'-nucleosyl)-tetraphosphatase (symmetrical)  23.41 
 
 
268 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1216  metallophosphoesterase  40.28 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.498854 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2347  metallophosphoesterase  31.79 
 
 
234 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.419284 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3688  metallophosphoesterase  29.34 
 
 
269 aa  50.8  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2626  metallophosphoesterase  31.79 
 
 
224 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.726827  normal  0.0771552 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>