15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3601 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2141  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.582922  normal  0.0825689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3601  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00263204  normal  0.496996 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1681  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.703863  normal  0.165271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1657  hypothetical protein  100 
 
 		 77 aa  152  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.191309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3874  hypothetical protein  88.31 
 
 		 77 aa  140  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.415735  normal  0.883789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3512  hypothetical protein  84.42 
 
 		 87 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3285  hypothetical protein  84.42 
 
 		 77 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.54392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25140  hypothetical protein  80.52 
 
 		 77 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1585  hypothetical protein  78.21 
 
 		 78 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.681662 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14490  hypothetical protein  77.92 
 
 		 77 aa  119  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.279152  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2150  hypothetical protein  79.1 
 
 		 67 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2005  hypothetical protein  44.59 
 
 		 86 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.238929  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1785  hypothetical protein  47.44 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.416073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2116  hypothetical protein  32.95 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.2237  hitchhiker  0.000000248115 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1562  hypothetical protein  43.75 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.82883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>