More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3574 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3574  transaldolase B  100 
 
 		 308 aa  628  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2168  transaldolase B  99.03 
 
 		 308 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1709  transaldolase B  98.38 
 
 		 308 aa  617  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.137258  hitchhiker  0.0000213936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1685  transaldolase B  95.13 
 
 		 308 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1931  transaldolase B  80.84 
 
 		 308 aa  514  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.247297 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27960  transaldolase B  78.18 
 
 		 307 aa  488  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2119  transaldolase  75.24 
 
 		 309 aa  481  1e-135  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3847  transaldolase B  77.85 
 
 		 308 aa  473  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2361  transaldolase B  77.85 
 
 		 307 aa  471  1e-132  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32700  transaldolase B  76.55 
 
 		 308 aa  469  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1914  transaldolase B  72.67 
 
 		 313 aa  464  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163672 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1485  transaldolase B  66.88 
 
 		 310 aa  420  1e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000000365093  normal  0.591576 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2514  transaldolase B  68.91 
 
 		 316 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.38793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03321  transaldolase B  65.19 
 
 		 319 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1655  transaldolase B  64.35 
 
 		 316 aa  392  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000243642  normal  0.288713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1280  transaldolase B  62.22 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000101503  normal  0.0282739 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3622  transaldolase B  62.94 
 
 		 317 aa  388  1e-107  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1049  transaldolase B  61.59 
 
 		 318 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00112286  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4104  transaldolase B  61.78 
 
 		 320 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.559408  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2054  transaldolase B  60.38 
 
 		 319 aa  384  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.4803  normal  0.221848 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1185  transaldolase B  62.54 
 
 		 318 aa  387  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0507197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2967  transaldolase B  61.27 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000461015  normal  0.264438 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3049  transaldolase B  61.27 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00546599  normal  0.166064 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3546  transaldolase B  60.63 
 
 		 318 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1919  transaldolase B  64.42 
 
 		 321 aa  384  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1074  transaldolase B  61.27 
 
 		 318 aa  381  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3437  transaldolase B  61.54 
 
 		 321 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2900  transaldolase B  62.22 
 
 		 317 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3147  transaldolase B  61.27 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000170325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0913  transaldolase B  62.22 
 
 		 317 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.507004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3245  transaldolase B  60.63 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000112094  decreased coverage  0.000667795 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0564  transaldolase B  61.59 
 
 		 316 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1044  transaldolase B  60.63 
 
 		 318 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265536  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3850  transaldolase B  60.95 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.866528  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0521  transaldolase B  60.95 
 
 		 316 aa  378  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1145  transaldolase B  60.63 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000154463  normal  0.579932 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1111  transaldolase B  60.63 
 
 		 318 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000240039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0204  transaldolase B  61.51 
 
 		 317 aa  379  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1089  transaldolase B  62.18 
 
 		 318 aa  378  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000675704  normal  0.0360442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2734  transaldolase B  60.32 
 
 		 317 aa  376  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000145141  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3736  transaldolase B  59.94 
 
 		 321 aa  376  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3664  transaldolase B  60.57 
 
 		 317 aa  371  1e-102  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0570  transaldolase B  61.01 
 
 		 317 aa  374  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00008  transaldolase B  60.25 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3588  transaldolase  60.25 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0007  transaldolase B  60.25 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0008  transaldolase B  60.25 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3647  transaldolase B  60.25 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0008  transaldolase B  60.25 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0086  transaldolase B  58.6 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.946439  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0576  transaldolase B  60.44 
 
 		 317 aa  368  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0009  transaldolase B  60.25 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.967516  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0009  transaldolase B  60.25 
 
 		 338 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.703316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3859  transaldolase B  59.94 
 
 		 317 aa  368  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00008  hypothetical protein  60.25 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0007  transaldolase B  58.68 
 
 		 317 aa  365  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0007  transaldolase B  58.99 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.811187  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0537  transaldolase B  60.69 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06256  transaldolase B  60.32 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000494  transaldolase  60.32 
 
 		 316 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.237649  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27340  transaldolase B  59.74 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0007  transaldolase B  58.99 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.411691  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22140  transaldolase B  59.74 
 
 		 322 aa  367  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0007  transaldolase B  58.99 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0007  transaldolase B  58.99 
 
 		 317 aa  367  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111561  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1167  transaldolase B  62.38 
 
 		 319 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0516908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3479  transaldolase A  59.29 
 
 		 316 aa  363  3e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.272335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0775  transaldolase B  59.68 
 
 		 318 aa  362  5.0000000000000005e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.38826  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1075  transaldolase B  62.06 
 
 		 319 aa  360  1e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.170663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3806  transaldolase B  58.73 
 
 		 326 aa  360  2e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.390141 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1231  transaldolase B  61.74 
 
 		 319 aa  359  3e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0164617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0803  transaldolase B  58.41 
 
 		 317 aa  359  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.240224  normal  0.311976 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3472  transaldolase B  58.41 
 
 		 317 aa  359  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.179148  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3599  transaldolase B  58.41 
 
 		 317 aa  359  4e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.83514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0688  transaldolase B  57.78 
 
 		 317 aa  355  3.9999999999999996e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0573478  hitchhiker  0.00205888 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_28222  transaldolase  58.1 
 
 		 316 aa  355  5e-97  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.562417  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2610  transaldolase A  57.64 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02355  transaldolase A  57.64 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1206  transaldolase  57.64 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2593  transaldolase A  57.64 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02317  hypothetical protein  57.64 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1213  transaldolase A  57.64 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3685  transaldolase A  57.64 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.206304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2742  transaldolase A  57.64 
 
 		 316 aa  355  6.999999999999999e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2830  transaldolase A  57.32 
 
 		 316 aa  353  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1424  transaldolase/EF-hand domain-containing protein  58.49 
 
 		 392 aa  353  1e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2959  transaldolase A  57.96 
 
 		 316 aa  352  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.874274 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5677  transaldolase B  59.42 
 
 		 317 aa  351  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.237593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0982  transaldolase A  57.59 
 
 		 316 aa  350  2e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0645  transaldolase B  59.74 
 
 		 316 aa  349  3e-95  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.452226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3234  transaldolase B  54.78 
 
 		 324 aa  349  4e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2069  transaldolase B  59.43 
 
 		 318 aa  349  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.851541  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0746  transaldolase A  56.69 
 
 		 316 aa  349  4e-95  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1174  transaldolase B  59.42 
 
 		 317 aa  347  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.980689  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0700  transaldolase A  59.16 
 
 		 315 aa  347  1e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.420489  normal  0.432881 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0852  transaldolase B  59.11 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0296  transaldolase B  59.11 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.257551  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1940  transaldolase B  59.11 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1013  transaldolase B  59.11 
 
 		 317 aa  346  3e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.930396  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2089  transaldolase B  58.86 
 
 		 318 aa  345  4e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.466177  normal  0.339985 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>