49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3546 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3546  water stress/hypersensitive response protein  100 
 
 		 159 aa  320  3e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2191  putative lipoprotein  96.23 
 
 		 159 aa  310  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1815  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  92.45 
 
 		 160 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0854923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3428  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  82.91 
 
 		 162 aa  240  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.765772  normal  0.866468 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2572  putative lipoprotein  66.18 
 
 		 176 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3165  lipoprotein, putative  64.39 
 
 		 159 aa  179  2e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.262178  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3032  putative lipoprotein  64.39 
 
 		 159 aa  177  4e-44  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0397077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0203  putative lipoprotein  56.16 
 
 		 166 aa  177  7e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01550  putative lipoprotein  55.86 
 
 		 166 aa  175  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.814803  normal  0.550997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1086  water stress/hypersensitive response protein  58.67 
 
 		 157 aa  167  7e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.605963 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2944  hypothetical protein  51.88 
 
 		 198 aa  165  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3621  putative lipoprotein  57.46 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2815  hypothetical protein  58.33 
 
 		 180 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3163  putative lipoprotein  57.46 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3634  putative lipoprotein  57.46 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3609  putative lipoprotein  57.46 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1729  putative lipoprotein  57.46 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0037  putative lipoprotein  57.46 
 
 		 167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3726  hypothetical protein  48.68 
 
 		 196 aa  155  3e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1033  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  48.1 
 
 		 163 aa  152  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.357786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0399  hypothetical protein  51.72 
 
 		 164 aa  151  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0426  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  55.3 
 
 		 164 aa  150  8.999999999999999e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.63413 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2902  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  54.55 
 
 		 180 aa  150  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.586012  normal  0.820452 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1928  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  49.01 
 
 		 167 aa  147  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198508  normal  0.554929 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3583  hypothetical protein  55.56 
 
 		 183 aa  147  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.732027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0494  hypothetical protein  54.14 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2611  hypothetical protein  54.14 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0467  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  54.55 
 
 		 164 aa  146  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.353267 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2272  putative lipoprotein  46.79 
 
 		 167 aa  140  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000762605  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2421  hypothetical protein  51.09 
 
 		 158 aa  137  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0086  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  49.66 
 
 		 166 aa  127  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3555  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  49.21 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.113514 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0226  hypothetical protein  42.47 
 
 		 157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0149  putative lipoprotein  32.85 
 
 		 160 aa  69.3  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.400959  normal  0.856742 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1587  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  30.83 
 
 		 158 aa  64.7  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.205042  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1774  water stress/hypersensitive response protein  29.17 
 
 		 161 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0609  hypothetical protein  29.63 
 
 		 159 aa  63.5  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.647076  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0650  hypothetical protein  28.39 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0799  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  28.39 
 
 		 167 aa  60.8  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.335821  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3440  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  29.33 
 
 		 155 aa  55.5  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.983784  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1708  hypothetical protein  33.03 
 
 		 193 aa  54.3  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0942  putative lipoprotein  28.91 
 
 		 160 aa  53.9  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.236049  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1217  hypothetical protein  24.82 
 
 		 161 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1417  water stress/hypersensitive response protein  25.87 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00876316  normal  0.917345 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3789  putative lipoprotein  25.71 
 
 		 167 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1574  trigger factor  26.24 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227775  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4130  hypothetical protein  24.63 
 
 		 164 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1043  Water Stress and Hypersensitive response domain protein  23.97 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.402135 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0667  water stress/hypersensitive response domain-containing protein  27.08 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>