157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3444 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2326  universal stress protein  100 
 
 		 165 aa  331  3e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.341198  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3444  UspA domain-containing protein  100 
 
 		 165 aa  331  3e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0150899  hitchhiker  0.00194101 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1927  UspA domain-containing protein  98.18 
 
 		 165 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000483446  hitchhiker  0.0000000000012349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1767  UspA domain-containing protein  95.15 
 
 		 165 aa  319  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000240026 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4004  hypothetical protein  73.78 
 
 		 167 aa  244  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.209434  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2547  UspA domain-containing protein  68.1 
 
 		 166 aa  226  1e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.903802  hitchhiker  0.00000022804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3555  universal stress protein family protein  63.8 
 
 		 165 aa  217  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41880  universal stress protein  63.19 
 
 		 165 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2278  universal stress protein family  64.33 
 
 		 167 aa  207  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000472572  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2076  hypothetical protein  63.69 
 
 		 164 aa  204  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.969502  decreased coverage  0.00116153 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  33.12 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  27.39 
 
 		 161 aa  82  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3274  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 160 aa  79.3  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0533854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1348  UspA domain protein  30.13 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1199  Bile acid:sodium symporter  29.19 
 
 		 515 aa  65.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0818  UspA domain-containing protein  28.66 
 
 		 151 aa  65.5  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.128659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3344  UspA domain protein  30.97 
 
 		 141 aa  63.9  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.225845  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  32.24 
 
 		 288 aa  58.2  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3185  UspA domain-containing protein  27.06 
 
 		 170 aa  57.4  0.00000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1774  universal stress protein  28.21 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1454  universal stress protein  26.62 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.0000316755  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  25.86 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3498  hypothetical protein  27.1 
 
 		 153 aa  53.9  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0015  UspA domain-containing protein  25.81 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.246066  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  28.85 
 
 		 145 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  26.42 
 
 		 140 aa  52  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4069  UspA domain-containing protein  27.63 
 
 		 162 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0307561  normal  0.903316 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  26.62 
 
 		 140 aa  50.8  0.000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3081  UspA domain-containing protein  21.43 
 
 		 177 aa  50.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110686  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  25.93 
 
 		 142 aa  50.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0589  universal stress protein  25.83 
 
 		 140 aa  49.7  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.558284  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  27.92 
 
 		 144 aa  49.3  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1142  UspA domain-containing protein  29.87 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.925681  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  27.39 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 137 aa  49.7  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1050  hypothetical protein  28.87 
 
 		 141 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  29.7 
 
 		 294 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  27.27 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0384  UspA domain protein  27.1 
 
 		 142 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150335  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  28.21 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  26 
 
 		 137 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  29.81 
 
 		 128 aa  48.5  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  25.97 
 
 		 297 aa  48.5  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  27.74 
 
 		 149 aa  48.1  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2204  UspA domain protein  26.49 
 
 		 150 aa  48.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27981  universal stress protein  43.64 
 
 		 127 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  29.45 
 
 		 155 aa  47.8  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  26.75 
 
 		 151 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  30.13 
 
 		 153 aa  47.4  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  26.45 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  24.68 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0352  UspA domain-containing protein  24.07 
 
 		 159 aa  47  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.818544 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0095  UspA domain-containing protein  34.45 
 
 		 157 aa  47  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5355  UspA domain protein  28.85 
 
 		 148 aa  46.6  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  24.14 
 
 		 137 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1198  UspA domain protein  24.68 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.473556  normal  0.580664 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0762  UspA domain protein  24.68 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0914  UspA domain protein  26.8 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.446701 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  23.53 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  30 
 
 		 147 aa  46.2  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1414  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 300 aa  46.2  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3776  UspA domain-containing protein  25.32 
 
 		 297 aa  46.6  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226753  normal  0.31919 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4083  UspA domain-containing protein  23.98 
 
 		 172 aa  46.2  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.391845  normal  0.267182 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  27.74 
 
 		 167 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1974  hypothetical protein  31.06 
 
 		 166 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  33.1 
 
 		 301 aa  45.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4074  hypothetical protein  26.54 
 
 		 145 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  25.16 
 
 		 290 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  25.97 
 
 		 288 aa  45.1  0.0004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  24.84 
 
 		 153 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  23.57 
 
 		 147 aa  45.4  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  41.82 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  24.84 
 
 		 212 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  26.45 
 
 		 158 aa  45.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2379  UspA domain protein  33.33 
 
 		 163 aa  44.7  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.54331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  30.13 
 
 		 142 aa  44.7  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3774  UspA domain-containing protein  29.85 
 
 		 317 aa  44.7  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143188  normal  0.471237 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2036  universal stress protein (Usp)  25.95 
 
 		 155 aa  43.9  0.0009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0997  hypothetical protein  27.16 
 
 		 143 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0966  hypothetical protein  26.92 
 
 		 143 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0771  hypothetical protein  23.87 
 
 		 135 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.584879  normal  0.0448473 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2016  universal stress protein UspA-like protein  22.73 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1009  UspA domain protein  24.67 
 
 		 304 aa  43.9  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1963  UspA domain-containing protein  24.84 
 
 		 147 aa  43.9  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1016  UspA domain-containing protein  24.68 
 
 		 149 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.597353  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0337  UspA domain protein  20.65 
 
 		 283 aa  43.9  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000175107  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0954  UspA domain protein  25.32 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.548739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1083  universal stress protein family  25.81 
 
 		 145 aa  43.1  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0354  universal stress protein F  33.73 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  26.14 
 
 		 301 aa  43.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0065  UspA domain protein  25 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3858  hypothetical protein  25.45 
 
 		 297 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1740  UspA domain protein  25.97 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.253274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4298  hypothetical protein  25.47 
 
 		 155 aa  43.1  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5009  UspA domain-containing protein  27.04 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5241  UspA domain protein  23.46 
 
 		 154 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.639442 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0758  UspA domain protein  28.17 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.16073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  26.02 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2102  UspA domain protein  29.3 
 
 		 289 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00791  hypothetical protein  32.53 
 
 		 145 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>