More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3328 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2367  major facilitator family transporter  99.49 
 
 		 395 aa  751    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1879  major facilitator transporter  92.49 
 
 		 393 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.985188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3328  major facilitator transporter  100 
 
 		 395 aa  753    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.933916 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5366  transporter, major facilitator superfamily (MFS)  81.51 
 
 		 388 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0480063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3051  major facilitator transporter  77.51 
 
 		 404 aa  558  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2928  major facilitator transporter  77.97 
 
 		 400 aa  548  1e-155  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0657  major facilitator superfamily MFS_1  73.55 
 
 		 386 aa  490  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2696  major facilitator superfamily MFS_1  73.51 
 
 		 400 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.793708  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2307  major facilitator superfamily MFS_1  73.96 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.17268  hitchhiker  0.00000016872 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1736  major facilitator transporter  67.11 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000269291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01627  putative transport protein (MFS family)  67.11 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1983  major facilitator superfamily MFS_1  67.11 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.128161  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1870  major facilitator transporter  67.11 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000971933  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1541  major facilitator transporter  67.11 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188499  normal  0.114044 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1972  major facilitator transporter  67.11 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116324 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01617  hypothetical protein  67.11 
 
 		 389 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1790  major facilitator transporter  71.11 
 
 		 388 aa  465  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0297909 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4398  major facilitator transporter  72.3 
 
 		 401 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2369  transporter, major facilitator family  67.11 
 
 		 389 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000585363  normal  0.236969 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1854  transporter, major facilitator family  66.58 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000789042  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1227  major facilitator transporter  73.12 
 
 		 401 aa  457  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.309225 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0774  major facilitator transporter  73.41 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1134  major facilitator transporter  72.25 
 
 		 408 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1255  major facilitator transporter  73.41 
 
 		 401 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1146  major facilitator transporter  71.97 
 
 		 401 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.668538  normal  0.271127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2061  major facilitator transporter  71.04 
 
 		 401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1505  major facilitator transporter  57.41 
 
 		 395 aa  397  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.484367  normal  0.264768 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2535  major facilitator superfamily MFS_1  59.78 
 
 		 391 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.216008  normal  0.0447169 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2020  major facilitator transporter  60.06 
 
 		 391 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.286294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3182  major facilitator transporter  59.78 
 
 		 391 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.372943 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2254  major facilitator transporter  52.8 
 
 		 390 aa  384  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.364288  normal  0.844618 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2206  major facilitator superfamily MFS_1  56.68 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0553  major facilitator transporter  58.15 
 
 		 390 aa  354  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.125845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2432  major facilitator transporter  55.71 
 
 		 389 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.984047  normal  0.214475 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0138  major facilitator transporter  52.76 
 
 		 391 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.412913  normal  0.0151016 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0415  major facilitator transporter  49.19 
 
 		 392 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.240789 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0633  major facilitator transporter  48.39 
 
 		 388 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.510644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2009  major facilitator transporter  45.24 
 
 		 408 aa  309  6.999999999999999e-83  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.40621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3326  major facilitator superfamily MFS_1  49.43 
 
 		 388 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.139767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0607  major facilitator transporter  47.55 
 
 		 391 aa  305  7e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2608  major facilitator transporter  48 
 
 		 391 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0593  major facilitator family transporter  50.56 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2744  major facilitator transporter  47.73 
 
 		 391 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  49.3 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  49.3 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  49.3 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  49.3 
 
 		 390 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  49.3 
 
 		 390 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0892  major facilitator family transporter  49.01 
 
 		 390 aa  302  9e-81  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2719  major facilitator transporter  47.47 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0727  major facilitator transporter  49.01 
 
 		 390 aa  301  1e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2691  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 391 aa  298  1e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4250  major facilitator transporter  50 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2079  major facilitator transporter  47.2 
 
 		 416 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2985  major facilitator superfamily MFS_1  45.28 
 
 		 388 aa  295  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0895325 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6019  major facilitator transporter  46.51 
 
 		 391 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56640  putative MFS transporter  48.44 
 
 		 388 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3905  major facilitator superfamily MFS_1  46.15 
 
 		 392 aa  291  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0803065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2724  major facilitator superfamily MFS_1  44.47 
 
 		 388 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4926  MFS family transporter  48.16 
 
 		 388 aa  288  8e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2910  major facilitator superfamily MFS_1  49.57 
 
 		 397 aa  288  1e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0635  major facilitator superfamily MFS_1  45.11 
 
 		 385 aa  285  7e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.294822 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3403  major facilitator transporter  46.43 
 
 		 391 aa  285  7e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3712  major facilitator superfamily MFS_1  46.43 
 
 		 391 aa  285  8e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0196377 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1201  major facilitator transporter  44.68 
 
 		 383 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.915784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2432  major facilitator transporter  44.5 
 
 		 385 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.122726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5276  major facilitator transporter  45.98 
 
 		 389 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2308  major facilitator transporter  44.51 
 
 		 412 aa  281  1e-74  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.209482 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3838  major facilitator transporter  46.94 
 
 		 384 aa  279  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2360  major facilitator superfamily MFS_1  44.02 
 
 		 393 aa  278  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5612  major facilitator family transporter  50.72 
 
 		 393 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.111142  normal  0.11347 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4993  major facilitator transporter  44.41 
 
 		 406 aa  276  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.400801  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1283  general substrate transporter  46.4 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5951  major facilitator transporter  46.36 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0793  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0340  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0823  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 389 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414709  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5098  major facilitator transporter  43.43 
 
 		 378 aa  270  2.9999999999999997e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1022  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3250  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000228404 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0971  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 386 aa  268  8.999999999999999e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3916  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1400  major facilitator family transporter  46.2 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0801718  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3132  major facilitator transporter  44.76 
 
 		 389 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3170  inner membrane transport protein YdhP  45.92 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0159821  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3223  major facilitator transporter  45.92 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0914412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3209  major facilitator family transporter  45.92 
 
 		 389 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.38015  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0143  major facilitator superfamily MFS_1  47.44 
 
 		 406 aa  266  4e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2052  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00152251  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2693  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1917  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214346  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0861  major facilitator family transporter  45.63 
 
 		 389 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0136838  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3596  major facilitator superfamily MFS_1  46.88 
 
 		 391 aa  265  7e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.357847 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2560  major facilitator transporter  47.4 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0784  major facilitator superfamily MFS_1  45.97 
 
 		 388 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.524508  normal  0.485682 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4890  major facilitator superfamily transporter  46.05 
 
 		 403 aa  263  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0076  major facilitator transporter  44.86 
 
 		 391 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0287  inner membrane transport protein YdhP  42.11 
 
 		 391 aa  262  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.699069 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3897  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 388 aa  262  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.808229 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0280  inner membrane transport protein YdhP  41.84 
 
 		 391 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>