33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3214 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3214  HNH endonuclease  100 
 
 		 268 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000245895  normal  0.0194211 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53670  hypothetical protein  64.02 
 
 		 270 aa  348  4e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00000000043823  hitchhiker  0.0011481 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1720  HNH endonuclease  38.03 
 
 		 266 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.26583  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48770  hypothetical protein  40.16 
 
 		 247 aa  103  4e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4474  HNH endonuclease  44.55 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3795  HNH endonuclease  42.48 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.952639  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1428  restriction endonuclease-like protein  37.16 
 
 		 212 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.352885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4750  HNH endonuclease  47.52 
 
 		 281 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.742551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0290  HNH endonuclease  38.84 
 
 		 281 aa  94.7  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0503  hypothetical protein  39.66 
 
 		 311 aa  92.8  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4820  HNH endonuclease domain-containing protein  38.02 
 
 		 213 aa  92.4  6e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.957283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1508  HNH endonuclease  38.61 
 
 		 224 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2154  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.116286  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2957  HNH endonuclease  38.98 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3090  HNH endonuclease  39 
 
 		 367 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.592375  normal  0.244813 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1637  restriction endonuclease-like protein  46.07 
 
 		 314 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2196  HNH endonuclease  36.44 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.471395  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0803  HNH endonuclease  49.3 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000235638  hitchhiker  0.00421341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3093  HNH endonuclease  39.56 
 
 		 267 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.208974  normal  0.66664 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2060  HNH endonuclease  43.68 
 
 		 109 aa  70.9  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000208549 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0008  HNH endonuclease  36.07 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  unclonable  0.000000000312042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0546  restriction endonuclease-like protein  40.24 
 
 		 261 aa  65.9  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4943  hypothetical protein  37.23 
 
 		 283 aa  62.4  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.141009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3801  hypothetical protein  36.11 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3519  hypothetical protein  36.11 
 
 		 211 aa  62  0.000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000000195013  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1424  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.154668  normal  0.504656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0587  hypothetical protein  31.21 
 
 		 285 aa  57  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0296117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0240  HNH endonuclease  24.57 
 
 		 324 aa  53.1  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00719063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0824  HNH endonuclease  35 
 
 		 276 aa  48.9  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00962018  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1959  HNH endonuclease  38.33 
 
 		 334 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1016  DNA helicase, putative  36 
 
 		 278 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.93737e-37 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0666  HNH endonuclease  31.88 
 
 		 282 aa  43.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000029476  normal  0.636948 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1641  HNH endonuclease  36.49 
 
 		 119 aa  42.7  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>