More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3155 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2560  type I secretion system ATPase  99.13 
 
 		 578 aa  1151    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.11254 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3354  type I secretion system ATPase  97.58 
 
 		 578 aa  1116    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.74579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3155  type I secretion system ATPase  100 
 
 		 578 aa  1161    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1818  Type I secretion system ATPase, PrtD  53.86 
 
 		 591 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00373836  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1596  type I secretion system ATPase  56.32 
 
 		 588 aa  609  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.276203  normal  0.125682 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1280  Type I secretion system ATPase, PrtD  57.35 
 
 		 573 aa  600  1e-170  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4928  Type I secretion system ATPase, PrtD  56.17 
 
 		 585 aa  596  1e-169  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3161  Type I secretion system ATPase, PrtD  54.86 
 
 		 598 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.135174 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48115  alkaline protease secretion protein AprD  55.92 
 
 		 593 aa  587  1e-166  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.969364  hitchhiker  0.00672446 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4146  alkaline protease secretion protein AprD  55.12 
 
 		 593 aa  585  1e-166  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.591571  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2680  Type I secretion system ATPase, PrtD  55.12 
 
 		 595 aa  581  1e-164  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000301439 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16240  Type I secretion system ATPase  51.12 
 
 		 580 aa  567  1e-160  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1409  type I secretion system ATPase  53.26 
 
 		 619 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3330  ABC transporter, ATP-binding protein  54.11 
 
 		 599 aa  561  1e-158  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.355213  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0583  type I secretion system ATPase  49.73 
 
 		 574 aa  559  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.020719 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0933  Type I secretion system ATPase, PrtD  50.19 
 
 		 584 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0820439 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1555  type I secretion system ATPase  51.66 
 
 		 575 aa  552  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.649141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2907  type I secretion system ATPase  51.57 
 
 		 575 aa  547  1e-154  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0039  Type I secretion system ATPase, PrtD  47.9 
 
 		 585 aa  543  1e-153  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1707  Type I secretion system ATPase, PrtD  46.82 
 
 		 596 aa  538  9.999999999999999e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4084  type I secretion system ATPase  49.74 
 
 		 602 aa  540  9.999999999999999e-153  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3892  ABC transporter  50 
 
 		 602 aa  541  9.999999999999999e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.881504 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0132  type I secretion ATP-binding protein  49.21 
 
 		 602 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0379  type I secretion system ATPase  45.54 
 
 		 570 aa  523  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.092179  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0720  type I secretion system ATPase  49.47 
 
 		 572 aa  521  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1405  type I secretion system ATPase  47.38 
 
 		 603 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.466667  normal  0.826572 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2107  type I secretion system ATPase  53.02 
 
 		 575 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3382  type I secretion system ATPase  47.73 
 
 		 579 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1723  transport protein HasD  53.8 
 
 		 595 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0378  type I secretion system ATPase  49.09 
 
 		 573 aa  499  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0307649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2512  type I secretion system ATPase  47.4 
 
 		 581 aa  497  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0459  hypothetical protein  45.04 
 
 		 583 aa  497  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00151029  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20030  transport protein HasD  54.17 
 
 		 596 aa  496  1e-139  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.863087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8002  type I secretion system ATPase  46.97 
 
 		 588 aa  490  1e-137  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0582  type I secretion system ATPase  47.83 
 
 		 581 aa  486  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.430347  normal  0.0200066 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1644  type I secretion system ATPase  45.09 
 
 		 589 aa  485  1e-135  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.57007  normal  0.467937 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3835  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.6 
 
 		 570 aa  479  1e-134  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.171691  normal  0.0822882 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2206  type I secretion system ATPase  45.22 
 
 		 582 aa  473  1e-132  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1274  type I secretion system ATPase  45.94 
 
 		 588 aa  472  1e-132  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.401757 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1748  type I secretion system ATPase  44.05 
 
 		 571 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.492562  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5907  type I secretion system ATPase  45.44 
 
 		 587 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742047  normal  0.0169981 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1510  type I secretion system ATPase  46.04 
 
 		 643 aa  472  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7141  HlyB family ABC transporter  46.45 
 
 		 582 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.470411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1749  type I secretion system ATPase  45.99 
 
 		 561 aa  465  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1321  type I secretion system ATPase  43.21 
 
 		 587 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0740  Type I secretion system ATPase, PrtD  45.63 
 
 		 587 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0285827  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2861  type I secretion system ATPase  44.28 
 
 		 577 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2543  type I secretion system ATPase  46.38 
 
 		 614 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23418  normal  0.267124 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2205  type I secretion system ATPase  44.58 
 
 		 576 aa  451  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0631  Type I secretion system ATPase, PrtD  42.83 
 
 		 592 aa  451  1e-125  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1161  type I secretion system ATPase  43.57 
 
 		 587 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.873156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3226  type I secretion system ATPase  42.4 
 
 		 588 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3437  type I secretion system ATPase  42.6 
 
 		 591 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.732646  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0383  type I secretion system ATPase  42.65 
 
 		 590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0270  type I secretion system ATPase  43.44 
 
 		 587 aa  444  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0802  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.67 
 
 		 593 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4007  type I secretion system ATPase  42.3 
 
 		 573 aa  441  9.999999999999999e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4390  type I secretion system ATPase  44.6 
 
 		 582 aa  439  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.500904 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3026  Type I secretion system ATPase, PrtD  44.64 
 
 		 667 aa  440  9.999999999999999e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2978  type I secretion system ATPase  43.22 
 
 		 589 aa  438  1e-121  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0770  type I secretion system ATPase  40.04 
 
 		 581 aa  436  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.164549  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2966  type I secretion system ATPase  43.9 
 
 		 582 aa  437  1e-121  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674529  normal  0.737202 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1645  type I secretion system ATPase  43.17 
 
 		 582 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2739  type I secretion system ATPase  43.9 
 
 		 582 aa  437  1e-121  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4814  type I secretion system ATPase  43.55 
 
 		 591 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0042  type I secretion system ATPase  42.34 
 
 		 577 aa  435  1e-120  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.195884  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0680  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.43 
 
 		 563 aa  429  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.738771  normal  0.0936545 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4713  type I secretion system ATPase  42.44 
 
 		 589 aa  430  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0148717 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1563  type I secretion system ATPase  44.85 
 
 		 603 aa  430  1e-119  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0679  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.74 
 
 		 572 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1114  rhiziobicin secretion  43.71 
 
 		 598 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4336  putative toxin/protease secretion system  42.57 
 
 		 583 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3317  type I secretion system ATPase  43.21 
 
 		 600 aa  420  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5958  type I secretion system ATPase  42.07 
 
 		 569 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0139  type I secretion system ATPase  42.49 
 
 		 579 aa  418  9.999999999999999e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.720717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0892  protein toxin ABC transporter ATPase and inner membrane subunit  44.11 
 
 		 578 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.287416  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2551  type I secretion system ATPase  43.93 
 
 		 578 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.961125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3996  type I secretion system ATPase  42.73 
 
 		 782 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0962  type I secretion system ATPase, PrtD  41.55 
 
 		 668 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2541  type I secretion system ATPase  43.76 
 
 		 598 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6292  type I secretion system ATPase  45.22 
 
 		 574 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4325  type I secretion system ATPase  43.63 
 
 		 764 aa  411  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.782007  normal  0.0375955 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3885  putative toxin/protease secretion system  42.47 
 
 		 573 aa  411  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.557144 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1347  Type I secretion system ATPase, PrtD  38.92 
 
 		 568 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.753541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0115  type I secretion system ATPase  42.65 
 
 		 578 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.869815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1561  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.1 
 
 		 583 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.323729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0618  type I secretion system ATPase  42.4 
 
 		 580 aa  409  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.441787  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2948  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.29 
 
 		 671 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2479  Type I secretion system ATPase, PrtD  43.63 
 
 		 587 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0339809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2599  type I secretion system ATPase  41.94 
 
 		 742 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4336  type I secretion system ATPase  40.49 
 
 		 663 aa  405  1e-111  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.270132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0792  type I secretion system ATPase  40.42 
 
 		 592 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05156  heme acquisition ABC transporter HasD  39.96 
 
 		 576 aa  401  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02274  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.15 
 
 		 560 aa  399  9.999999999999999e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1639  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.81 
 
 		 582 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.60166 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3586  type I secretion system ATPase  42.14 
 
 		 598 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1663  type I secretion system ATPase  42.75 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1761  type I secretion system ATPase  40.45 
 
 		 573 aa  397  1e-109  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1348  Type I secretion system ATPase, PrtD  40.25 
 
 		 556 aa  399  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.716552  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0433  Type I secretion system ATPase, PrtD  41.74 
 
 		 574 aa  394  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211617  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>