More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3131 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_49290  Aldehyde dehydrogenase  75.05 
 
 
526 aa  764    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.213935  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2460  aldehyde dehydrogenase  73.66 
 
 
527 aa  740    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000205723 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2585  aldehyde dehydrogenase family protein  99.05 
 
 
526 aa  1046    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3602  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  70.49 
 
 
526 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.133791  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2314  aldehyde dehydrogenase  70.27 
 
 
526 aa  702    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0433257  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1998  aldehyde dehydrogenase  77.18 
 
 
524 aa  764    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0448113  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3323  aldehyde dehydrogenase family protein  72.34 
 
 
527 aa  736    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0559722  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3157  aldehyde dehydrogenase  71.37 
 
 
527 aa  729    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000809211  normal  0.137723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2817  aldehyde dehydrogenase  70.29 
 
 
526 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106118  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5736  Aldehyde Dehydrogenase  66.6 
 
 
533 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.437114  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3224  aldehyde dehydrogenase  74.47 
 
 
526 aa  745    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.169196  normal  0.562334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05180  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  75 
 
 
525 aa  770    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3131  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
526 aa  1058    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3101  aldehyde dehydrogenase  70.49 
 
 
526 aa  699    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3112  aldehyde dehydrogenase  73.4 
 
 
527 aa  715    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0864  aldehyde dehydrogenase  63.48 
 
 
528 aa  655    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.321546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3253  aldehyde dehydrogenase  95.04 
 
 
526 aa  976    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.177644 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3072  putative aldehyde dehydrogenase  75.78 
 
 
527 aa  763    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0227  aldehyde dehydrogenase  75.44 
 
 
527 aa  763    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4139  putative semialdehyde dehydrogenase  73.69 
 
 
526 aa  736    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.557422  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36050  putative aldehyde dehydrogenase  75.78 
 
 
527 aa  762    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0976275  hitchhiker  0.00000000280554 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48010  putative semialdehyde dehydrogenase  73.89 
 
 
526 aa  724    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.014327  normal  0.873423 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1837  aldehyde dehydrogenase  62.4 
 
 
536 aa  613  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1283  aldehyde dehydrogenase  54.63 
 
 
525 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.435 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1256  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  54.25 
 
 
525 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.333102 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1140  aldehyde dehydrogenase  53.08 
 
 
525 aa  509  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0832  aldehyde dehydrogenase  55.73 
 
 
525 aa  510  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0547808 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3713  aldehyde dehydrogenase  55.58 
 
 
525 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5206  aldehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
525 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.222173 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3399  aldehyde dehydrogenase  54.87 
 
 
525 aa  499  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.202581  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2306  aldehyde dehydrogenase  52.42 
 
 
530 aa  499  1e-140  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.862226  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3617  aldehyde dehydrogenase  56.86 
 
 
512 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0328  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase (NAD+)  55.74 
 
 
525 aa  501  1e-140  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3045  aldehyde dehydrogenase  54.67 
 
 
525 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4947  aldehyde dehydrogenase  54.67 
 
 
525 aa  498  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0190727 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5321  aldehyde dehydrogenase  54.67 
 
 
525 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.711093 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4679  aldehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
525 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4135  aldehyde dehydrogenase  54.58 
 
 
525 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6713  aldehyde dehydrogenase  53.14 
 
 
529 aa  497  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2116  aldehyde dehydrogenase  52.6 
 
 
525 aa  487  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.458004  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4441  aldehyde dehydrogenase  51.49 
 
 
526 aa  483  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1897  2,5-dioxopentanoate dehydrogenase  53.48 
 
 
527 aa  482  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.271045  normal  0.510287 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0038  aldehyde dehydrogenase  52.39 
 
 
526 aa  483  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4029  aldehyde dehydrogenase  53.39 
 
 
530 aa  482  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.123507  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1805  putative fatty aldehyde dehydrogenase  51.68 
 
 
527 aa  481  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00336157  normal  0.0125854 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4861  Aldehyde Dehydrogenase  50.67 
 
 
527 aa  479  1e-134  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.187571 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3382  aldehyde dehydrogenase  52.99 
 
 
530 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.869145  normal  0.274011 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6526  aldehyde dehydrogenase  53.36 
 
 
527 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.0487781 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0043  aldehyde dehydrogenase  53.04 
 
 
526 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0253475  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0035  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.83 
 
 
526 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0042  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.83 
 
 
656 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1541  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  53.04 
 
 
659 aa  477  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.211116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1470  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.83 
 
 
526 aa  477  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4137  aldehyde dehydrogenase  53.15 
 
 
530 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0528665  normal  0.209657 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0057  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  52.83 
 
 
526 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2670  aldehyde dehydrogenase  50.19 
 
 
533 aa  476  1e-133  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1189  aldehyde dehydrogenase (NADP) family protein  52.83 
 
 
656 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4229  aldehyde dehydrogenase  53.15 
 
 
530 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.857739  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3548  aldehyde dehydrogenase  53.11 
 
 
530 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623229  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6431  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
530 aa  474  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00291714  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1008  Aldehyde Dehydrogenase  49.81 
 
 
536 aa  472  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.69554 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3078  aldehyde dehydrogenase  52.99 
 
 
528 aa  466  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.165309 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2289  aldehyde dehydrogenase  48.73 
 
 
525 aa  466  9.999999999999999e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4450  aldehyde dehydrogenase  51.99 
 
 
530 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.888148 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1883  aldehyde dehydrogenase family protein  52.69 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0566  aldehyde dehydrogenase family protein  52.69 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0468  aldehyde dehydrogenase family protein  52.69 
 
 
530 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.315073  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4585  Aldehyde Dehydrogenase  52.5 
 
 
523 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.414415  normal  0.785416 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4451  Aldehyde Dehydrogenase  52.5 
 
 
523 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2192  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  52.5 
 
 
530 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.65984  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1422  aldehyde dehydrogenase family protein  52.5 
 
 
530 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.24251  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1631  aldehyde dehydrogenase family protein  55.12 
 
 
536 aa  455  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.464757  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0877  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  52.5 
 
 
530 aa  456  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.854859  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2442  NADP-dependent fatty aldehyde dehydrogenase  55.7 
 
 
501 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3624  aldehyde dehydrogenase  50.1 
 
 
525 aa  456  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.186491  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1031  aldehyde dehydrogenase  50.7 
 
 
532 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0036  aldehyde dehydrogenase  49.62 
 
 
538 aa  452  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4865  aldehyde dehydrogenase  50.84 
 
 
504 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.670882 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4199  aldehyde dehydrogenase  52.31 
 
 
522 aa  450  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2070  aldehyde dehydrogenase family protein  52.5 
 
 
530 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5547  aldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 
507 aa  448  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0649354 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0186  aldehyde dehydrogenase family protein  50.3 
 
 
524 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003674  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase  46.23 
 
 
510 aa  442  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.690417  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3869  aldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
505 aa  442  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6846  Aldehyde Dehydrogenase  49.9 
 
 
515 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.29435 
 
 
-
 
NC_003296  RS05368  ketoglutarate semialdehyde dehydrogenase protein  49.8 
 
 
528 aa  440  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.588855  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3264  aldehyde dehydrogenase  51.08 
 
 
508 aa  439  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000455371 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4104  aldehyde dehydrogenase  52.9 
 
 
502 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000295252 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3912  dehydrogenase  49.37 
 
 
504 aa  439  9.999999999999999e-123  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0195751  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2501  Aldehyde Dehydrogenase  45.49 
 
 
537 aa  441  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0197  aldehyde dehydrogenase  50.57 
 
 
522 aa  436  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3325  aldehyde dehydrogenase  51.19 
 
 
506 aa  438  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.476606 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3656  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  51.37 
 
 
508 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2498  Aldehyde Dehydrogenase  51.57 
 
 
549 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4665  aldehyde dehydrogenase  51.09 
 
 
524 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0844  aldehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
508 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4272  Aldehyde Dehydrogenase  47.75 
 
 
489 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0350  Aldehyde Dehydrogenase  48.55 
 
 
537 aa  430  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4869  aldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
530 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4783  aldehyde dehydrogenase  48.62 
 
 
530 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.233271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>