More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3127 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3249  aldehyde dehydrogenase  95.77 
 
 
497 aa  979  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0656585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02680  putative aldehyde dehydrogenase  78.02 
 
 
496 aa  763  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.24739 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2589  aldehyde dehydrogenase family protein  96.58 
 
 
497 aa  984  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.675648  normal  0.340951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0305  putative aldehyde dehydrogenase  78.23 
 
 
496 aa  775  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4933  aldehyde dehydrogenase  75.2 
 
 
497 aa  773  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2872  aldehyde dehydrogenase  80.04 
 
 
496 aa  826  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.442211  normal  0.721273 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3127  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 
497 aa  1017  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2053  aldehyde dehydrogenase family protein  60.2 
 
 
499 aa  631  1e-180  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6645  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  66.26 
 
 
501 aa  624  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.217332  normal  0.0894525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1623  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  61.18 
 
 
499 aa  581  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207083  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0298  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  60.12 
 
 
499 aa  568  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2372  Betaine-aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
495 aa  567  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.169396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2545  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  59.05 
 
 
511 aa  560  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.572579 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0237  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.78 
 
 
497 aa  552  1e-156  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0566  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  55.4 
 
 
504 aa  548  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0049  betaine-aldehyde dehydrogenase  56.42 
 
 
505 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2725  aldehyde dehydrogenase  56.44 
 
 
493 aa  545  1e-154  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5534  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.58 
 
 
497 aa  548  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0937134  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0227  aldehyde dehydrogenase  53.37 
 
 
499 aa  542  1e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1187  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  56.48 
 
 
509 aa  544  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0092  aldehyde dehydrogenase family protein  53.78 
 
 
497 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.769215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5330  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
497 aa  540  1e-152  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0557529 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5278  aldehyde dehydrogenase family protein  52.97 
 
 
497 aa  538  1e-152  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5188  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
526 aa  538  1e-152  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.536573  normal  0.0718586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0192  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
497 aa  540  1e-152  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  8.10218e-05 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48030  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  56.24 
 
 
497 aa  538  1e-151  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6087  putative aldehyde dehydrogenase  52.76 
 
 
497 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70140  putative aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
497 aa  538  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643605  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2648  aldehyde dehydrogenase  52.97 
 
 
498 aa  538  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.868356  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2123  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.37 
 
 
496 aa  536  1e-151  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.57663 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0967  aldehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
498 aa  531  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.593803  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2836  aldehyde dehydrogenase  55.03 
 
 
495 aa  530  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.123667  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0937  aldehyde dehydrogenase  51.02 
 
 
499 aa  530  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.370684  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3105  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  52.24 
 
 
498 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791112  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3021  aldehyde dehydrogenase  51.12 
 
 
498 aa  528  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3202  Aldehyde Dehydrogenase  51.74 
 
 
498 aa  525  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.394681 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1737  aldehyde dehydrogenase  53.99 
 
 
498 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.92172e-05 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3176  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.83 
 
 
495 aa  526  1e-148  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.762089  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1093  aldehyde dehydrogenase  51.74 
 
 
498 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0180881  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3859  aldehyde dehydrogenase  54.47 
 
 
497 aa  525  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3527  aldehyde dehydrogenase  51.31 
 
 
495 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000694209  normal  0.0931426 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1187  aldehyde dehydrogenase  51.74 
 
 
498 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00220575  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1153  aldehyde dehydrogenase  51.74 
 
 
498 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734271  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2065  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.31 
 
 
498 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3008  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.63 
 
 
498 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.227807  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2926  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  51.43 
 
 
498 aa  521  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3533  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.62 
 
 
495 aa  525  1e-147  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.185726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1085  aldehyde dehydrogenase  51.74 
 
 
498 aa  523  1e-147  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000455021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1045  aldehyde dehydrogenase (NAD(+))  49.7 
 
 
503 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.154048  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3034  aldehyde dehydrogenase  51.53 
 
 
499 aa  521  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.329193  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3496  aldehyde dehydrogenase  50.92 
 
 
498 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1115  aldehyde dehydrogenase  51.22 
 
 
502 aa  518  1e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00211349  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0945  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.14 
 
 
497 aa  512  1e-144  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.587312  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0386  Aldehyde Dehydrogenase  55.56 
 
 
500 aa  514  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0356  aldehyde dehydrogenase  55.77 
 
 
489 aa  514  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.69961  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1741  betaine-aldehyde dehydrogenase  55.53 
 
 
504 aa  508  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0495652  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1330  Aldehyde Dehydrogenase  57.06 
 
 
498 aa  505  1e-142  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.174379  normal  0.217301 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4669  Aldehyde Dehydrogenase  54.55 
 
 
497 aa  506  1e-142  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.395716  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3955  aldehyde dehydrogenase  54.87 
 
 
495 aa  507  1e-142  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768123  normal  0.683477 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2325  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.09 
 
 
495 aa  504  1e-141  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1909  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  53.37 
 
 
499 aa  503  1e-141  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.295691 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1510  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.69 
 
 
495 aa  502  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1536  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.89 
 
 
495 aa  501  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01288  hypothetical protein  48.69 
 
 
495 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1822  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.69 
 
 
495 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0935717 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01277  gamma-Glu-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase, NAD(P)H-dependent  48.69 
 
 
495 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1415  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.69 
 
 
495 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2346  Aldehyde Dehydrogenase  48.69 
 
 
495 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0952724  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1942  gamma-glutamyl-gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.89 
 
 
495 aa  495  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2376  aldehyde dehydrogenase  54.95 
 
 
496 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2990  aldehyde dehydrogenase  54.95 
 
 
496 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3010  aldehyde dehydrogenase  54.95 
 
 
496 aa  494  1e-138  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3567  aldehyde dehydrogenase  52.93 
 
 
497 aa  493  1e-138  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1942  aldehyde dehydrogenase family protein  53.94 
 
 
496 aa  493  1e-138  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7675  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.75 
 
 
496 aa  492  1e-138  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal  0.331249 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2026  aldehyde dehydrogenase family protein  54.14 
 
 
496 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6073  betaine-aldehyde dehydrogenase  54.75 
 
 
496 aa  489  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.972484  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6339  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  54.34 
 
 
496 aa  489  1e-137  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0642  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.14 
 
 
496 aa  488  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0734  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  54.14 
 
 
528 aa  488  1e-136  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0834633  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2984  aldehyde dehydrogenase  54.55 
 
 
496 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2460  aldehyde dehydrogenase  53.48 
 
 
499 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.399277  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2900  aldehyde dehydrogenase  54.34 
 
 
496 aa  479  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3037  aldehyde dehydrogenase  54.14 
 
 
496 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4003  aldehyde dehydrogenase  47.98 
 
 
498 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6864  aldehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
497 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0403228  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3064  aldehyde dehydrogenase family protein  46.37 
 
 
505 aa  473  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0192942  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1869  aldehyde dehydrogenase  51.33 
 
 
496 aa  471  1e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1371  aldehyde dehydrogenase  48.44 
 
 
500 aa  470  1e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0762191 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2110  aldehyde dehydrogenase  46.37 
 
 
502 aa  468  1e-130  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0052069  normal  0.609482 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4607  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  49.08 
 
 
505 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5756  betaine-aldehyde dehydrogenase  50.2 
 
 
497 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.969126  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7257  aldehyde dehydrogenase  48.38 
 
 
505 aa  464  1e-129  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.548914  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4835  Betaine-aldehyde dehydrogenase  46.73 
 
 
505 aa  460  1e-128  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0460635 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5279  Aldehyde Dehydrogenase  45.92 
 
 
505 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1689  Aldehyde Dehydrogenase  47.17 
 
 
500 aa  456  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.337297  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4752  aldehyde dehydrogenase  48.99 
 
 
501 aa  454  1e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.33696  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31630  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  48.23 
 
 
491 aa  449  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4432  Aldehyde Dehydrogenase  49.28 
 
 
492 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0316709  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4109  aldehyde dehydrogenase  45.55 
 
 
496 aa  446  1e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>