214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3059 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2693  dipeptidase, putative  99.09 
 
 		 328 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.882727 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3059  peptidase M19, renal dipeptidase  100 
 
 		 328 aa  681    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3861  M19 family peptidase  69 
 
 		 332 aa  505  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0876  membrane dipeptidase  64.04 
 
 		 329 aa  442  1e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.131069  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05502  hypothetical protein  60.68 
 
 		 329 aa  434  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1239  peptidase M19, renal dipeptidase  62.78 
 
 		 346 aa  431  1e-119  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120176 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001564  microsomal dipeptidase  61.51 
 
 		 329 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.609765  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1814  peptidase M19, renal dipeptidase  59.63 
 
 		 329 aa  425  1e-118  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2127  peptidase M19, renal dipeptidase  61.51 
 
 		 329 aa  427  1e-118  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0146717  hitchhiker  0.00435983 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3382  peptidase M19, renal dipeptidase  59.26 
 
 		 326 aa  418  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.290781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0814  peptidase M19 renal dipeptidase  59.63 
 
 		 327 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0578  peptidase M19 renal dipeptidase  62.7 
 
 		 336 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1602  peptidase M19, renal dipeptidase  56.15 
 
 		 323 aa  366  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.184491  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3733  membrane dipeptidase  42.86 
 
 		 323 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.632106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0988  peptidase M19, renal dipeptidase  38.56 
 
 		 325 aa  245  6.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71240  hypothetical protein  38.05 
 
 		 325 aa  238  8e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1105  peptidase M19, renal dipeptidase  38.24 
 
 		 332 aa  237  2e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0497  membrane dipeptidase  39.18 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0308  membrane dipeptidase  38.75 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00278532 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6182  hypothetical protein  37.58 
 
 		 320 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0329  membrane dipeptidase  38.75 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.371464  normal  0.432124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5225  peptidase M19, renal dipeptidase  38.75 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.511272  normal  0.0279561 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4899  membrane dipeptidase  38.75 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.195029  normal  0.655649 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0331  membrane dipeptidase  38.75 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.991063  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5064  Membrane dipeptidase  34.98 
 
 		 323 aa  230  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.0155477 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1584  membrane dipeptidase  34.98 
 
 		 323 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4784  peptidase M19, renal dipeptidase  37.62 
 
 		 325 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.100008 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0829  dipeptidase family protein  35.4 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0741  dipeptidase family protein  35.4 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1867  renal dipeptidase family protein  35.71 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0861  membrane dipeptidase  36.16 
 
 		 324 aa  227  3e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0394  renal dipeptidase family protein  37.62 
 
 		 325 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4019  M19 family peptidase  35.33 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0472  renal dipeptidase family protein  35.09 
 
 		 323 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2108  renal dipeptidase family protein  35.09 
 
 		 323 aa  225  6e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0709  renal dipeptidase family protein  35.09 
 
 		 323 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1005  renal dipeptidase family protein  35.09 
 
 		 323 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.616075  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1978  renal dipeptidase family protein  35.09 
 
 		 323 aa  225  6e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.159584  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3437  membrane dipeptidase  33.96 
 
 		 323 aa  225  8e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2726  membrane dipeptidase  36.34 
 
 		 325 aa  225  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.147057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3302  membrane dipeptidase  34.06 
 
 		 323 aa  224  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.347896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3547  membrane dipeptidase  34.89 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5201  membrane dipeptidase  34.47 
 
 		 323 aa  219  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3284  membrane dipeptidase  34.47 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5084  membrane dipeptidase  34.47 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02031  putative dipeptidase protein  34.47 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.237279 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5021  membrane dipeptidase  34.47 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4496  membrane dipeptidase  34.47 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4821  membrane dipeptidase  34.16 
 
 		 323 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0572  membrane dipeptidase  33.85 
 
 		 323 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4050  membrane dipeptidase  34.49 
 
 		 323 aa  212  7e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.36145 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0068  peptidase M19 renal dipeptidase  33.66 
 
 		 332 aa  170  4e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1522  Zn-dependent dipeptidase  31.61 
 
 		 368 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.329262  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1847  peptidase M19, renal dipeptidase  33.33 
 
 		 357 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0917  peptidase M19, renal dipeptidase  29.13 
 
 		 386 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.182228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2882  peptidase M19, renal dipeptidase  30.86 
 
 		 377 aa  155  8e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756766  normal  0.22542 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0081  peptidase M19, renal dipeptidase  32.34 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3174  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  32.3 
 
 		 399 aa  142  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845004  normal  0.812253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3166  Zn-dependent dipeptidase microsomal dipeptidase  30.62 
 
 		 400 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0814  multidrug resistance protein B  32.58 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1009  membrane dipeptidase  27.97 
 
 		 311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3840  peptidase M19, renal dipeptidase  29.02 
 
 		 335 aa  126  5e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1494  membrane dipeptidase  23.34 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3097  Membrane dipeptidase  29.5 
 
 		 333 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0690607 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3448  Membrane dipeptidase  30.92 
 
 		 333 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0756  thermostable dipeptidase  29.27 
 
 		 311 aa  117  3e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6456  Membrane dipeptidase  23.91 
 
 		 402 aa  116  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2779  renal dipeptidase family protein  26.97 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0779  Membrane dipeptidase  29.02 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1454  hypothetical protein  27.34 
 
 		 329 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18060  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase  27.81 
 
 		 433 aa  110  3e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00000416179  normal  0.24272 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1472  Membrane dipeptidase  26.88 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3100  Membrane dipeptidase  28.21 
 
 		 315 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119053  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1701  glutamine amidotransferase, class II/dipeptidase  27.99 
 
 		 602 aa  108  1e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.176176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0102  thermostable dipeptidase  27.04 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0721  peptidase M19 renal dipeptidase  30.24 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00790748  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1664  peptidase M19 renal dipeptidase  29.38 
 
 		 312 aa  107  3e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.791756  hitchhiker  0.00631997 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0827  Membrane dipeptidase  25.81 
 
 		 399 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1837  Membrane dipeptidase  26.95 
 
 		 363 aa  106  6e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.36005  normal  0.515995 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0645  peptidase M19, renal dipeptidase  31.61 
 
 		 306 aa  105  7e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2477  Membrane dipeptidase  25.86 
 
 		 438 aa  105  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.533309  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3791  renal dipeptidase family protein  26.52 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0951  membrane dipeptidase  22.06 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3107  peptidase M19, renal dipeptidase  25.56 
 
 		 385 aa  104  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.178357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3688  membrane dipeptidase  22.1 
 
 		 399 aa  102  7e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.083911  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5702  Membrane dipeptidase  26.5 
 
 		 345 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1249  Zn-dependent dipeptidase, microsomal dipeptidase-like protein  26.34 
 
 		 311 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0331  Membrane dipeptidase  25.14 
 
 		 444 aa  100  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1127  Membrane dipeptidase  24.74 
 
 		 297 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0633246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1477  Membrane dipeptidase  29.35 
 
 		 315 aa  99.4  7e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.203918  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3756  peptidase M19, renal dipeptidase  27.03 
 
 		 388 aa  99  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC05890  conserved hypothetical protein  24.22 
 
 		 433 aa  98.6  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.970035  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0834  twin-arginine translocation pathway signal  26.7 
 
 		 387 aa  98.6  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11333  dipeptidase  29.73 
 
 		 439 aa  98.2  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0806  peptidase M19, renal dipeptidase  26.7 
 
 		 387 aa  97.8  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0834  Membrane dipeptidase  25.35 
 
 		 390 aa  97.8  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1478  Membrane dipeptidase  27.48 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000344928  normal  0.899515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3133  twin-arginine translocation pathway signal  26.24 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1894  dipeptidase family protein  32.09 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09650  Membrane dipeptidase  25.24 
 
 		 315 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>