More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2818 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2818  aldolase II superfamily protein  100 
 
 		 251 aa  518  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2871  aldolase II superfamily protein  96.41 
 
 		 251 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2698  aldolase II superfamily protein  56.22 
 
 		 246 aa  280  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3366  class II aldolase/adducin-like  51.79 
 
 		 250 aa  272  4.0000000000000004e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0859  aldolase II superfamily protein  52.78 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1340  aldolase II superfamily protein  52.78 
 
 		 255 aa  270  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1319  aldolase II superfamily protein  52.78 
 
 		 255 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.764419 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1506  class II aldolase/adducin family protein  55.38 
 
 		 252 aa  269  4e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.443125  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3131  class II aldolase/adducin family protein  52.8 
 
 		 255 aa  268  5e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22582  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3038  aldolase II superfamily protein  54.37 
 
 		 259 aa  268  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.774237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3039  aldolase II superfamily protein  53.04 
 
 		 259 aa  266  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0672  class II aldolase/adducin family protein  55.16 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.999953 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1977  putative class II aldolase/adducin  57.2 
 
 		 261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.621706  normal  0.451747 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2707  class II aldolase/adducin family protein  53.36 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3521  aldolase II superfamily protein  52.59 
 
 		 259 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.568287  normal  0.727743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1938  aldolase II superfamily protein  52.99 
 
 		 259 aa  264  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0215875  normal  0.268304 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3183  class II aldolase/adducin family protein  55.42 
 
 		 256 aa  263  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0427  class II aldolase/adducin-like  54.84 
 
 		 263 aa  263  3e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.358684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4472  aldolase II superfamily protein  51.59 
 
 		 255 aa  261  6e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0173222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1719  class II aldolase/adducin family protein  55.16 
 
 		 267 aa  261  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.174281 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5236  class II aldolase/adducin family protein  51.97 
 
 		 282 aa  260  2e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2856  aldolase II superfamily protein  56.68 
 
 		 250 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2703  aldolase II superfamily protein  56.68 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1098  aldolase II superfamily protein  56.28 
 
 		 331 aa  258  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.674816  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1406  aldolase II superfamily protein  54.37 
 
 		 256 aa  258  5.0000000000000005e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2055  aldolase II superfamily protein  52.4 
 
 		 260 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3900  aldolase II superfamily protein  53.23 
 
 		 251 aa  254  7e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0893  aldolase II superfamily protein  52.19 
 
 		 256 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0382  aldolase II superfamily protein  53.25 
 
 		 250 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.583518  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4305  aldolase II superfamily protein  52.71 
 
 		 264 aa  253  3e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01199  class II aldolase/adducin-like protein  49.2 
 
 		 251 aa  252  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0069  class II aldolase/adducin-like  51.37 
 
 		 256 aa  251  8.000000000000001e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.872153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0503  class II aldolase/adducin family protein  49.41 
 
 		 266 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3083  aldolase II superfamily protein  49.03 
 
 		 258 aa  243  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3368  aldolase II superfamily protein  50.39 
 
 		 259 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000643093  hitchhiker  0.0000000000000156191 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2487  class II aldolase/adducin domain protein  53.62 
 
 		 271 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0255579  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2291  aldolase II superfamily protein  53.85 
 
 		 271 aa  239  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.318887  decreased coverage  0.0000307771 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3891  aldolase II superfamily protein  51.17 
 
 		 261 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1652  class II aldolase/adducin-like  52.63 
 
 		 257 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1837  class II aldolase/adducin family protein  46.61 
 
 		 255 aa  239  5e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.036347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3281  aldolase II superfamily protein  51 
 
 		 261 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4533  aldolase II superfamily protein  49.21 
 
 		 258 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.159765 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4074  aldolase II superfamily protein  49.21 
 
 		 258 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19700  aldolase II superfamily protein  48.81 
 
 		 259 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1964  aldolase II superfamily protein  49.4 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.467535 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2609  class II aldolase/adducin family protein  56.63 
 
 		 257 aa  234  1.0000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.79052  decreased coverage  0.00794454 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0901  aldolase II superfamily protein  47.62 
 
 		 260 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693732 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4013  aldolase II superfamily protein  49.6 
 
 		 258 aa  233  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.60091 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31370  aldolase II superfamily protein  52.16 
 
 		 257 aa  232  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.331304  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0340  aldolase II superfamily protein  49.59 
 
 		 237 aa  232  5e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.945791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1696  aldolase II superfamily protein  48.02 
 
 		 259 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2536  aldolase II superfamily protein  50 
 
 		 264 aa  226  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0456669  hitchhiker  0.00862817 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0857  aldolase II superfamily protein  47.81 
 
 		 257 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4200  class II aldolase/adducin family protein  47.01 
 
 		 264 aa  223  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.183465 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3224  aldolase II superfamily protein  50.43 
 
 		 264 aa  222  4e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.217165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4440  class II aldolase/adducin family protein  46.88 
 
 		 262 aa  222  4.9999999999999996e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.140435 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1685  class II aldolase/adducin-like  46 
 
 		 255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0807  aldolase II superfamily protein  49.35 
 
 		 257 aa  221  9.999999999999999e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.176092 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5623  class II aldolase/adducin family protein  46.09 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.136767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2667  aldolase II superfamily protein  43.48 
 
 		 257 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01738  class II aldolase/adducin-like protein  46 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5956  aldolase II superfamily protein  49.8 
 
 		 271 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.931337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2800  aldolase II superfamily protein  43.08 
 
 		 257 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2776  aldolase II superfamily protein  43.08 
 
 		 257 aa  214  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0548  aldolase II superfamily protein  42.69 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2138  aldolase II superfamily protein  42.69 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2751  aldolase II superfamily protein  42.69 
 
 		 257 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6078  aldolase II superfamily protein  43.08 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.91923 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3687  aldolase II superfamily protein  48.81 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4680  aldolase II superfamily protein  48.81 
 
 		 257 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0426137 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4873  aldolase II superfamily protein  51.97 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00795086  normal  0.948884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1139  aldolase II superfamily protein  48.41 
 
 		 258 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.8489  normal  0.168164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0822  aldolase II superfamily protein  47.67 
 
 		 261 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0953493  normal  0.275996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0752  aldolase II superfamily protein  47.67 
 
 		 261 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.322405 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3086  aldolase II superfamily protein  42.06 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0236483 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0518  aldolase II superfamily protein  42.69 
 
 		 258 aa  207  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4212  class II aldolase/adducin-like protein  44.14 
 
 		 262 aa  206  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3557  aldolase II superfamily protein  44.62 
 
 		 274 aa  205  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3233  aldolase II superfamily protein  45 
 
 		 274 aa  204  1e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0638  aldolase II superfamily protein  42.29 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0623  aldolase II superfamily protein  42.29 
 
 		 258 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1172  class II aldolase/adducin domain-containing protein  45.34 
 
 		 256 aa  203  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0834795  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1223  aldolase II superfamily protein  42.64 
 
 		 263 aa  202  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.199351 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0235  aldolase II superfamily protein  41.73 
 
 		 265 aa  202  6e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0806  aldolase II superfamily protein  47.67 
 
 		 261 aa  201  7e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.666611  normal  0.411116 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0024  aldolase II superfamily protein  41.9 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178448  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2494  aldolase II superfamily protein  41.9 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2870  aldolase II superfamily protein  41.9 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2213  aldolase II superfamily protein  41.9 
 
 		 258 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1038  aldolase II superfamily protein  41.83 
 
 		 254 aa  201  8e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.552674  normal  0.877247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5383  aldolase II superfamily protein  42.25 
 
 		 263 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.103736  normal  0.161678 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0803  aldolase II superfamily protein  41.9 
 
 		 258 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5620  aldolase II superfamily protein  49.21 
 
 		 257 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1795  aldolase II superfamily protein  43.67 
 
 		 277 aa  195  6e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185946 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5445  aldolase II superfamily protein  40.55 
 
 		 260 aa  192  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0975629  normal  0.0271848 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3282  aldolase II superfamily protein  39.44 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.271869  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21590  aldolase II superfamily protein  48.5 
 
 		 265 aa  185  7e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0947  class II aldolase/adducin family protein  44.27 
 
 		 250 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3889  class II aldolase/adducin-like  44.79 
 
 		 250 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.279463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2702  class II aldolase/adducin family protein  40.5 
 
 		 244 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00187501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>