93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2757 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  97.99 
 
 		 348 aa  660    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  100 
 
 		 348 aa  696    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  93.39 
 
 		 348 aa  632  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  64.43 
 
 		 346 aa  436  1e-121  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  67.07 
 
 		 339 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  65.23 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  33.71 
 
 		 476 aa  162  9e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  31.51 
 
 		 410 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  33.01 
 
 		 330 aa  138  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  29.73 
 
 		 320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  30.42 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  30.42 
 
 		 318 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  30.07 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  31.79 
 
 		 341 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  31.29 
 
 		 337 aa  132  7.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  32.78 
 
 		 298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  35.77 
 
 		 327 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  29.61 
 
 		 318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  29.37 
 
 		 374 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  31.38 
 
 		 372 aa  123  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  27.86 
 
 		 376 aa  122  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1192  hypothetical protein  33.12 
 
 		 316 aa  120  3e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.52379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  28.75 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  28.4 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  30.45 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  28.31 
 
 		 373 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  30.63 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  27.61 
 
 		 347 aa  109  6e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  32.11 
 
 		 380 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  31.8 
 
 		 300 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  27.04 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  29.29 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  29.14 
 
 		 352 aa  102  8e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  26 
 
 		 312 aa  102  8e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  30.48 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  29.05 
 
 		 382 aa  100  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  29.13 
 
 		 342 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  30.61 
 
 		 345 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  24.69 
 
 		 341 aa  94.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  33.58 
 
 		 410 aa  92  1e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  27.15 
 
 		 346 aa  89.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  28.3 
 
 		 330 aa  84.3  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  32.11 
 
 		 546 aa  79.3  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  29.32 
 
 		 543 aa  78.2  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  34.18 
 
 		 569 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  26.58 
 
 		 339 aa  77.4  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  24.93 
 
 		 570 aa  77  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1764  hypothetical protein  37.59 
 
 		 340 aa  76.3  0.0000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.49495  normal  0.0945387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  27.27 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  25.26 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  27.04 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  30.31 
 
 		 568 aa  75.1  0.000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  27.04 
 
 		 600 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  25.32 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  24.6 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  31.44 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  28.79 
 
 		 433 aa  72.8  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  29.41 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  29.24 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  30.37 
 
 		 547 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.18 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  30.21 
 
 		 607 aa  70.5  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  32.29 
 
 		 498 aa  70.1  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  28.65 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30.37 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  30.37 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  31.58 
 
 		 568 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  25.98 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  25.36 
 
 		 571 aa  66.6  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  28.95 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  29.74 
 
 		 605 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  26.39 
 
 		 565 aa  63.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  26.91 
 
 		 601 aa  63.2  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  25.79 
 
 		 449 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  28.96 
 
 		 278 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  30.8 
 
 		 498 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  29.33 
 
 		 464 aa  60.1  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0787  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.3 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1868  Triacylglycerol lipase  29.74 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.021332  normal  0.0911205 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  22.97 
 
 		 339 aa  52.8  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  28.06 
 
 		 302 aa  52.8  0.000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  26.67 
 
 		 505 aa  52.8  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0391  hypothetical protein  26.41 
 
 		 526 aa  51.6  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0764093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  29.36 
 
 		 146 aa  52  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  21.05 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  21.9 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  21.4 
 
 		 369 aa  48.1  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0078  hypothetical protein  29.06 
 
 		 526 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.0137812  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0911  alpha/beta hydrolase fold protein  28.76 
 
 		 276 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2206  hypothetical protein  26.46 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  25.61 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0883  triacylglycerol lipase  23.67 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.613439  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5516  Triacylglycerol lipase  22.27 
 
 		 323 aa  43.5  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00684094  normal  0.859333 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>