More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2735 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2735  two component transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3217  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.164246  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1287  two component transcriptional regulator  75 
 
 		 221 aa  326  2.0000000000000001e-88  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00449543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1602  two component transcriptional regulator  73.61 
 
 		 223 aa  320  9.999999999999999e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.389685 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0224  two component transcriptional regulator  71.3 
 
 		 221 aa  320  9.999999999999999e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0104787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3399  two component transcriptional regulator  71.3 
 
 		 223 aa  319  1.9999999999999998e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3094  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.44 
 
 		 223 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0210  DNA-binding response regulator  67.13 
 
 		 225 aa  300  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4961  two component transcriptional regulator  69.95 
 
 		 220 aa  296  2e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.952404 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3284  two component transcriptional regulator  69.27 
 
 		 219 aa  292  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0910618 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3088  two component transcriptional regulator  64.52 
 
 		 219 aa  288  5.0000000000000004e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0559  DNA-binding response regulator  71.3 
 
 		 232 aa  288  6e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0784  DNA-binding response regulator  71.3 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.42757  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1977  DNA-binding response regulator  71.3 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2074  DNA-binding response regulator  71.3 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.401565  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0490  two component response regulator  71.3 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.663456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0671  DNA-binding response regulator  71.3 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.485657  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1624  DNA-binding response regulator  71.3 
 
 		 219 aa  287  8e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0176162  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3815  two component transcriptional regulator  64.06 
 
 		 219 aa  287  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.681737  normal  0.25062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0903  DNA-binding response regulator  71.3 
 
 		 219 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604027  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_7369  two component transcriptional regulator  64.35 
 
 		 219 aa  280  2e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.175011  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5168  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  67.59 
 
 		 219 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6259  two component response regulator  58.45 
 
 		 220 aa  273  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1188  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5392  winged helix family two component transcriptional regulator  65.74 
 
 		 219 aa  270  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.890679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6029  two component transcriptional regulator  58.06 
 
 		 222 aa  247  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.167629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0699  two component transcriptional regulator  56.07 
 
 		 220 aa  226  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3267  two component transcriptional regulator, winged helix family  56.07 
 
 		 220 aa  226  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.387524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0469  two component transcriptional regulator  55.61 
 
 		 220 aa  215  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.601273  normal  0.0513669 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0845  DNA-binding response regulator  56.07 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2437  DNA-binding response regulator  56.07 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0308  DNA-binding response regulator  56.07 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0051  DNA-binding response regulator  56.07 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0850  DNA-binding response regulator  56.07 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0136  two component transcriptional regulator  49.54 
 
 		 220 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.259962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2154  two component transcriptional regulator  52.31 
 
 		 218 aa  204  1e-51  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0603  DNA-binding response regulator  55.66 
 
 		 283 aa  202  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0680  two component transcriptional regulator  55.14 
 
 		 225 aa  201  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.982653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2618  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 220 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5949  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 224 aa  201  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2647  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 224 aa  201  7e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0673  DNA-binding response regulator  55.19 
 
 		 241 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2665  two component transcriptional regulator  54.67 
 
 		 220 aa  200  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3674  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5326  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 235 aa  199  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3786  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 279 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.898509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3443  two component transcriptional regulator  50.23 
 
 		 213 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0278745 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4863  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.32 
 
 		 244 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.494797 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5798  winged helix family two component transcriptional regulator  48.42 
 
 		 242 aa  195  5.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0751826 
 
 
-
 
NC_003296  RS02110  two-component response regulator transcription regulator protein  46.19 
 
 		 246 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6233  two component transcriptional regulator  49.07 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0277  two component transcriptional regulator  47.58 
 
 		 235 aa  192  2e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.344057 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1535  two component transcriptional regulator  47.22 
 
 		 222 aa  192  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4760  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00176778  hitchhiker  0.0056462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4239  two component transcriptional regulator  46.76 
 
 		 220 aa  192  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0202421  normal  0.361244 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3105  two component transcriptional regulator  47.66 
 
 		 219 aa  192  4e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.136173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1953  two component transcriptional regulator  52.07 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1754  two component transcriptional regulator, winged helix family  52.07 
 
 		 226 aa  192  4e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3285  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.03 
 
 		 224 aa  192  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00225391  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5497  DNA-binding response regulator  45.79 
 
 		 221 aa  191  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.553345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2538  two component transcriptional regulator  54.19 
 
 		 210 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.322532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63150  two-component response regulator  45.79 
 
 		 221 aa  191  7e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.388672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1765  DNA-binding response regulator  50 
 
 		 255 aa  191  9e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.003723  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0830  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0346205  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1570  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.00189564  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0050  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000526726  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2208  response regulator protein  49.54 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000167641  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0124  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.3 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.0356027 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0866  DNA-binding response regulator  49.54 
 
 		 220 aa  190  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.775386  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3680  histidine kinase A domain-containing protein  46.12 
 
 		 220 aa  189  2e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.894604 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3491  two component transcriptional regulator  50 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0557217 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2384  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.58 
 
 		 219 aa  189  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23421  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4177  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.06 
 
 		 223 aa  189  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.622163  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4243  response regulator receiver  46.3 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.376113 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3871  two component transcriptional regulator  47.3 
 
 		 230 aa  188  5.999999999999999e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2208  two component transcriptional regulator, winged helix family  50.88 
 
 		 232 aa  187  7e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3456  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  187  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.836579  normal  0.262944 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0958  DNA-binding response regulator  49.07 
 
 		 220 aa  187  8e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000129968  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3252  two component transcriptional regulator  45.37 
 
 		 220 aa  187  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0622  DNA-binding response regulator  45.62 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1696  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.79 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.904967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2032  DNA-binding response regulator  45.79 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0270369  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2733  two component transcriptional regulator  48.62 
 
 		 242 aa  186  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00185097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3124  transcriptional regulatory protein QseB  45.87 
 
 		 221 aa  187  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3148  two component response regulator  50 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.174373  hitchhiker  0.000575412 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1312  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 232 aa  185  4e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0158381  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2298  two component transcriptional regulator  46.05 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6226  two component transcriptional regulator  44.24 
 
 		 221 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4873  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00274413  hitchhiker  0.0000000776703 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4356  two component transcriptional regulator  48.15 
 
 		 220 aa  185  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00111042  unclonable  0.00000437588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6335  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 223 aa  185  6e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.923263 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2815  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.59 
 
 		 218 aa  184  7e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.877458  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0575  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.3 
 
 		 224 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.21251 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1372  transcriptional regulatory protein  44.44 
 
 		 223 aa  184  7e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000461157  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2596  two component transcriptional regulator  47.69 
 
 		 233 aa  184  8e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.606495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0616  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0199047  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3414  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  184  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00145574  normal  0.355768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0615  two component transcriptional regulator  45.16 
 
 		 224 aa  184  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0124209  normal  0.327567 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3430  transcriptional regulator  44.75 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.325979  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2197  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.66 
 
 		 219 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5326  two component transcriptional regulator  47 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.575046 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>