More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2715 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  98.63 
 
 
364 aa  736    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
364 aa  748    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2616  GCN5-related N-acetyltransferase  63.33 
 
 
367 aa  477  1e-133  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.719016  normal  0.647137 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  60.66 
 
 
382 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3348  hypothetical protein  61.77 
 
 
365 aa  449  1e-125  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39410  hypothetical protein  61.5 
 
 
365 aa  448  1e-125  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0574  GCN5-related N-acetyltransferase  47.35 
 
 
368 aa  333  2e-90  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0841815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1034  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  47.93 
 
 
371 aa  328  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2233  GCN5-related N-acetyltransferase  48.76 
 
 
389 aa  322  8e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561856  normal  0.320355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0222  GCN5-related N-acetyltransferase  46.11 
 
 
381 aa  315  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2765  GCN5-related N-acetyltransferase  48.37 
 
 
373 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0272238  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1156  acetyltransferase  45.18 
 
 
369 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  44.81 
 
 
373 aa  308  6.999999999999999e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1911  acetyltransferase  43.68 
 
 
363 aa  300  3e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1290  GCN5-related N-acetyltransferase  39.72 
 
 
364 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0777  GCN5-related N-acetyltransferase  44.48 
 
 
368 aa  288  1e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  43.67 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 
381 aa  278  9e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02215  CN5-related N-acetyltransferase  40.83 
 
 
429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0792847  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2799  hypothetical protein  60.11 
 
 
194 aa  238  1e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0105778  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0956  GCN5-related N-acetyltransferase  45.95 
 
 
154 aa  122  8e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.368211  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1891  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  46.15 
 
 
158 aa  120  3e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.304627 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1159  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
154 aa  107  5e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0360922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
178 aa  106  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1082  GCN5-related N-acetyltransferase  45.39 
 
 
146 aa  105  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.422971  normal  0.339183 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2047  GCN5-related N-acetyltransferase  42.76 
 
 
170 aa  105  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.938667  normal  0.82296 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2525  GCN5-related N-acetyltransferase  38.86 
 
 
188 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  43.14 
 
 
171 aa  104  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3165  hypothetical protein  33.78 
 
 
367 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0444  GCN5-related N-acetyltransferase  47.18 
 
 
164 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0724165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  46.98 
 
 
168 aa  98.6  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.961517  normal  0.229137 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1651  GCN5-related N-acetyltransferase  45.77 
 
 
159 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.758103  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0407  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.38 
 
 
153 aa  86.7  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
162 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2306  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.99 
 
 
152 aa  84  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0108888  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2462  hypothetical protein  31.67 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2467  acetyltransferase, GNAT family  42.42 
 
 
109 aa  77  0.0000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.35454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2631  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.3 
 
 
153 aa  75.1  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0709643  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2893  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.55 
 
 
181 aa  72.4  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.07 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2603  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.97 
 
 
179 aa  69.7  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000520127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1001  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.78 
 
 
170 aa  66.6  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.491632  hitchhiker  0.0014892 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1201  GCN5-related N-acetyltransferase  35.21 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00821471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.16 
 
 
150 aa  64.3  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1777  acetyltransferase  28.76 
 
 
185 aa  64.3  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0187  acetyltransferase  34.53 
 
 
138 aa  64.3  0.000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.046026  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1061  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.53 
 
 
151 aa  63.2  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288075  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.29 
 
 
159 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.2 
 
 
153 aa  63.2  0.000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  29.29 
 
 
147 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1724  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  40.37 
 
 
160 aa  62.4  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.784685 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0304  GCN5-related N-acetyltransferase  27.07 
 
 
143 aa  61.6  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0312411  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07490  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.35 
 
 
175 aa  61.6  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.106277  normal  0.121236 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.54 
 
 
147 aa  62  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.67 
 
 
183 aa  61.6  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.65 
 
 
162 aa  62  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
147 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
147 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.14 
 
 
154 aa  60.5  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.47 
 
 
139 aa  60.5  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1147  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.62 
 
 
150 aa  60.1  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547985  normal  0.809068 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.85 
 
 
157 aa  59.7  0.00000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0615  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.32 
 
 
165 aa  58.9  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.286495  normal  0.417084 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0651  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  39.33 
 
 
147 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.067134 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.41 
 
 
189 aa  59.3  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0008  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain 49kDa  28.17 
 
 
160 aa  59.3  0.0000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1774  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  28.06 
 
 
152 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.34696  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.57 
 
 
147 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0145  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.43 
 
 
166 aa  58.5  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00901236 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0413  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  29.77 
 
 
153 aa  58.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  37.08 
 
 
139 aa  58.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1099  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.85 
 
 
150 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1294  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
154 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.7344300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1343  GCN5-related N-acetyltransferase  29.45 
 
 
142 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280328  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1662  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, putative  32.14 
 
 
145 aa  57  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
145 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2603  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.58 
 
 
152 aa  57  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.68 
 
 
145 aa  57  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2643  putative acetyltransferase  27.56 
 
 
141 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2685  putative acetyltransferase  27.56 
 
 
141 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.440261  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2709  putative acetyltransferase  27.56 
 
 
141 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2815  putative acetyltransferase  27.56 
 
 
141 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.438827  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2475  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.09 
 
 
160 aa  57  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2594  putative acetyltransferase  27.56 
 
 
141 aa  57  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3585  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.56 
 
 
160 aa  56.6  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0599  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.38 
 
 
163 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0914549  normal  0.551178 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  40.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  40.7 
 
 
148 aa  56.6  0.0000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0943  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
152 aa  56.6  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0491  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  37.65 
 
 
148 aa  56.6  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.45 
 
 
167 aa  56.6  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>