More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2695 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
315 aa  631  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  97.78 
 
 
315 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  76.04 
 
 
316 aa  478  1e-134  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  75.08 
 
 
316 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  75.08 
 
 
316 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  75.08 
 
 
316 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  72.2 
 
 
341 aa  448  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  75.08 
 
 
316 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  73.63 
 
 
316 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  72.29 
 
 
323 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  66.45 
 
 
335 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  64.19 
 
 
312 aa  369  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  38.56 
 
 
309 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4655  2-dehydropantoate 2-reductase  34.75 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  34.43 
 
 
299 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
300 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  40.58 
 
 
310 aa  157  2e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
301 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1448  2-dehydropantoate 2-reductase  34.74 
 
 
329 aa  154  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.619429  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  35.64 
 
 
295 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  35.86 
 
 
345 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5051  2-dehydropantoate 2-reductase  35.33 
 
 
325 aa  151  1e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.317407  normal  0.691254 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  38.24 
 
 
307 aa  151  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  34.98 
 
 
298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  32.89 
 
 
301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  34.8 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  32.24 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  34.64 
 
 
315 aa  145  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  32.63 
 
 
355 aa  145  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  34.5 
 
 
310 aa  145  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4016  2-dehydropantoate 2-reductase  35.31 
 
 
317 aa  144  2e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  34.2 
 
 
314 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  33.99 
 
 
313 aa  142  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1736  2-dehydropantoate 2-reductase  32.67 
 
 
309 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0419891 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  34.17 
 
 
319 aa  142  6e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  35.5 
 
 
305 aa  142  8e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  34.38 
 
 
314 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  37.03 
 
 
318 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  37.03 
 
 
318 aa  137  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  37.03 
 
 
318 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  37.03 
 
 
313 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  35.46 
 
 
314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  36.71 
 
 
318 aa  136  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  33.44 
 
 
314 aa  135  8e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  34.98 
 
 
299 aa  135  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3612  2-dehydropantoate 2-reductase  30.61 
 
 
342 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0535  2-dehydropantoate 2-reductase  31.65 
 
 
307 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.000195412  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2226  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 
336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  35.41 
 
 
313 aa  132  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  37.66 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0270  2-dehydropantoate 2-reductase  34.2 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.267073 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  32.34 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 
309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 
305 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5181  2-dehydropantoate 2-reductase  31.31 
 
 
307 aa  130  3e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000000387537  normal  0.288245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  30.42 
 
 
305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  36.08 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 
305 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 
305 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  29.64 
 
 
305 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  31.37 
 
 
307 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0107  2-dehydropantoate 2-reductase  30.63 
 
 
333 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  27.91 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  30.38 
 
 
309 aa  128  2.0000000000000002e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0211  2-dehydropantoate 2-reductase  31.46 
 
 
324 aa  127  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.817769  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1541  2-dehydropantoate 2-reductase  30.19 
 
 
311 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  28.03 
 
 
316 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0480  2-dehydropantoate 2-reductase  29.38 
 
 
346 aa  125  7e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  32.2 
 
 
314 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  35.25 
 
 
310 aa  125  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  32.44 
 
 
312 aa  124  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2525  2-dehydropantoate 2-reductase  31.5 
 
 
326 aa  124  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
307 aa  122  6e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  31.09 
 
 
311 aa  122  7e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  31.93 
 
 
337 aa  122  8e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3431  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 
324 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.990914  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4356  2-dehydropantoate 2-reductase  29.94 
 
 
335 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.484695 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  31.1 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  29.74 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2259  2-dehydropantoate 2-reductase  29.54 
 
 
325 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  29.74 
 
 
311 aa  121  1.9999999999999998e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  28.43 
 
 
316 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4479  2-dehydropantoate 2-reductase  28.96 
 
 
337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5461  2-dehydropantoate 2-reductase  31.36 
 
 
315 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.853784  normal  0.141843 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5870  2-dehydropantoate 2-reductase  32.93 
 
 
348 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.166245  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2563  2-dehydropantoate 2-reductase  32.62 
 
 
351 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0895867  normal  0.0341922 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6024  2-dehydropantoate 2-reductase  29.23 
 
 
325 aa  119  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.578091  normal  0.113365 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1216  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
325 aa  119  6e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.192364  normal  0.954067 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4344  2-dehydropantoate 2-reductase  30.18 
 
 
332 aa  119  7.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.244617  decreased coverage  0.000830744 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0713  2-dehydropantoate 2-reductase  29.17 
 
 
306 aa  119  9e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2023  2-dehydropantoate 2-reductase  30.09 
 
 
324 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.607439  normal  0.396245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2153  2-dehydropantoate 2-reductase  29.7 
 
 
326 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.998843  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3545  2-dehydropantoate 2-reductase  31.36 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  29.65 
 
 
351 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3234  2-dehydropantoate 2-reductase  30.41 
 
 
325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4822  2-dehydropantoate 2-reductase  31.36 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.117223 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3558  2-dehydropantoate 2-reductase  30.72 
 
 
325 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1724  2-dehydropantoate 2-reductase  31.07 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  34.06 
 
 
314 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3569  2-dehydropantoate 2-reductase  35.27 
 
 
296 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>