61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2635 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3088  hypothetical protein  98.89 
 
 		 361 aa  728    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2635  ImpA domain-containing protein  100 
 
 		 361 aa  738    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.571143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2777  ImpA family type VI secretion-associated protein  90.3 
 
 		 365 aa  648    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.30494  normal  0.238227 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2497  ImpA family type VI secretion-associated protein  83.1 
 
 		 364 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4966  ImpA, N-terminal  72.58 
 
 		 364 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.361241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2257  ImpA-like protein  55.16 
 
 		 371 aa  383  1e-105  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146099  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04699  ImpA, N-terminal  33.89 
 
 		 357 aa  176  4e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.494235  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0409  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.81 
 
 		 373 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0388  ImpA domain-containing protein  31.81 
 
 		 373 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0711605  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3566  ImpA-like  31.72 
 
 		 373 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2829  hypothetical protein  32.44 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3148  ImpA-related N-terminal family protein  32.44 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1714  hypothetical protein  32.44 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0053  hypothetical protein  32.44 
 
 		 373 aa  170  3e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2957  ImpA-like N-terminal family protein  32.15 
 
 		 369 aa  170  4e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01949  hypothetical protein  32.64 
 
 		 337 aa  169  8e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.532888 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3653  ImpA-related N-terminal family protein  31.34 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3628  ImpA-related N-terminal family protein  31.34 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.364334  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3636  hypothetical protein  32.17 
 
 		 373 aa  169  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2185  ImpA, N-terminal  29.6 
 
 		 365 aa  166  5e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.439464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2923  ImpA family type VI secretion-associated protein  31.81 
 
 		 373 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2631  ImpA-like  30.61 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.896007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0474  ImpA domain-containing protein  30.61 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0452  ImpA family type VI secretion-associated protein  30.61 
 
 		 373 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4920  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.6 
 
 		 369 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.662122  normal  0.0188154 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2902  hypothetical protein  32.43 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34140  hypothetical protein  32.43 
 
 		 366 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0156916  normal  0.284898 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1714  ImpA, N-terminal  27.67 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3401  ImpA-like  28.37 
 
 		 362 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.840642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5997  ImpA family type VI secretion-associated protein  27.47 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3044  type VI secretion-associated protein, ImpA family  30.65 
 
 		 439 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50750  ImpA-related protein  28.69 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.261884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1528  hypothetical protein  24.52 
 
 		 371 aa  109  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1206  type VI secretion-associated protein, ImpA family  29.68 
 
 		 439 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000019  uncharacterized protein ImpA  24.57 
 
 		 372 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2370  ImpA domain-containing protein  24.31 
 
 		 368 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3070  ImpA domain-containing protein  24.73 
 
 		 372 aa  76.3  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1475  ImpA domain-containing protein  27.95 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.461587  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3167  hypothetical protein  25.4 
 
 		 789 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3848  ImpA family type VI secretion-associated protein  25.51 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0120503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0275  ImpA-like  38 
 
 		 790 aa  64.7  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3024  ImpA-like  25.17 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.504865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2462  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.15 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6052  hypothetical protein  23.26 
 
 		 358 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1169  putative type VI secretion protein VasJ-1  24.06 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.336401  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3002  ImpA domain-containing protein  23.27 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2442  ImpA domain-containing protein  25.92 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0089  ImpA domain-containing protein  31.34 
 
 		 520 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0551  type VI secretion-associated protein, ImpA family  26.45 
 
 		 343 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2321  ImpA domain-containing protein  24.72 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00990234  hitchhiker  0.00936669 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5434  hypothetical protein  29.13 
 
 		 518 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00990  hypothetical protein  23.42 
 
 		 344 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0192  type VI secretion-associated protein, ImpA family  21.59 
 
 		 363 aa  47.4  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0154  hypothetical protein  26.39 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.166526  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3476  hypothetical protein  29.91 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.884704  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3120  ImpA domain-containing protein  29.91 
 
 		 357 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0455856 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2358  hypothetical protein  37.74 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0645311 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1692  type VI secretion-associated protein, ImpA family  24.08 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.376241  normal  0.67881 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000442  uncharacterized protein ImpA  29.7 
 
 		 522 aa  44.3  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.859338  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5272  ImpA, N-terminal  28.31 
 
 		 524 aa  43.9  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0296  ImpA-related N- family protein  25.81 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.153181  normal  0.644226 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>