155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2626 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3096  hypothetical protein  99.72 
 
 
356 aa  725    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.912752  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2768  type VI secretion protein  95.22 
 
 
356 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0620169  normal  0.565386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2626  hypothetical protein  100 
 
 
356 aa  728    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2506  type VI secretion protein  94.1 
 
 
356 aa  680    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.166907  normal  0.89718 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4957  hypothetical protein  83.15 
 
 
356 aa  617  1e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2272  hypothetical protein  59.88 
 
 
330 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2172  hypothetical protein  35.71 
 
 
354 aa  201  9.999999999999999e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17033  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01960  hypothetical protein  35.06 
 
 
363 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.362822  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02050  hypothetical protein  35.82 
 
 
363 aa  199  9e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.481196  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0055  hypothetical protein  34.63 
 
 
366 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2831  hypothetical protein  34.63 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3639  hypothetical protein  34.63 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1712  hypothetical protein  34.63 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3630  hypothetical protein  34.63 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.544301  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3655  hypothetical protein  34.63 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3146  hypothetical protein  34.63 
 
 
366 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3038  type VI secretion protein, VC_A0111 family  34.32 
 
 
343 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2925  type VI secretion protein  34.44 
 
 
366 aa  189  7e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.823082  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2959  hypothetical protein  34.17 
 
 
366 aa  189  8e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0472  hypothetical protein  34.72 
 
 
366 aa  187  2e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4918  type VI secretion protein, VC_A0111 family  33.72 
 
 
364 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0191108 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0386  hypothetical protein  34.17 
 
 
366 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3564  hypothetical protein  34.72 
 
 
366 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0407  type VI secretion protein  33.91 
 
 
366 aa  186  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0450  type VI secretion protein  33.89 
 
 
366 aa  185  9e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.969906 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1212  type VI secretion protein, VC_A0111 family  37.58 
 
 
344 aa  181  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1481  hypothetical protein  35.89 
 
 
388 aa  170  4e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3860  type VI secretion protein  34.97 
 
 
366 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.818358  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1535  hypothetical protein  33.93 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00260  hypothetical protein  33.73 
 
 
336 aa  162  9e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.439095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4085  type VI secretion protein  36.21 
 
 
377 aa  161  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000191474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2634  hypothetical protein  34.54 
 
 
338 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3468  hypothetical protein  33.13 
 
 
357 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0974  hypothetical protein  33.73 
 
 
351 aa  156  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0263  hypothetical protein  34.02 
 
 
427 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26620  hypothetical protein  34.57 
 
 
337 aa  151  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.389364  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3077  hypothetical protein  33.72 
 
 
369 aa  150  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0199  type VI secretion protein, VC_A0111 family  32.21 
 
 
388 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2330  hypothetical protein  31.78 
 
 
328 aa  149  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0196244  normal  0.0188042 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2363  hypothetical protein  32.21 
 
 
335 aa  149  7e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0161  hypothetical protein  32.62 
 
 
348 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.568465  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01080  hypothetical protein  32.42 
 
 
348 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.426308  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1583  hypothetical protein  33.13 
 
 
367 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.314099 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7015  type VI secretion protein  32.83 
 
 
358 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6120  type VI secretion protein  30.77 
 
 
362 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.677953  normal  0.349005 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1332  hypothetical protein  31.67 
 
 
361 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.010268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3012  hypothetical protein  32.18 
 
 
357 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.793023  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0528  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.91 
 
 
359 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3902  type VI secretion protein  33.23 
 
 
358 aa  142  9e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2450  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.86 
 
 
349 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0218229  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05859  hypothetical protein  27.3 
 
 
332 aa  136  4e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0947  type VI secretion protein, VC_A0111 family  30.67 
 
 
370 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2955  hypothetical protein  29.86 
 
 
488 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1195  hypothetical protein  29.81 
 
 
492 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000437  uncharacterized protein ImpH/VasB  26.71 
 
 
332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.594996  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1691  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.19 
 
 
346 aa  134  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.623686  normal  0.90848 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0135  putative cytoplasmic protein  31.42 
 
 
349 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3037  type VI secretion protein, VC_A0111 family  31.97 
 
 
385 aa  133  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.663953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0292  type VI secretion protein  31.55 
 
 
331 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0831142  normal  0.923003 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0305  type VI secretion protein, family  31.55 
 
 
331 aa  133  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2830  hypothetical protein  29.54 
 
 
481 aa  132  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0297  type VI secretion protein, family  31.55 
 
 
331 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.267723  normal  0.456236 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1605  hypothetical protein  29.22 
 
 
492 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1788  hypothetical protein  29.22 
 
 
492 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.405643  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0458  hypothetical protein  29.22 
 
 
492 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1620  hypothetical protein  30.3 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0171  hypothetical protein  30.3 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.966591  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0149  hypothetical protein  30.3 
 
 
349 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1074  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.32 
 
 
332 aa  129  7.000000000000001e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3411  hypothetical protein  30.84 
 
 
341 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3251  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.03 
 
 
332 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0432  hypothetical protein  30.54 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1701  SciB protein  30.79 
 
 
361 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0914  hypothetical protein  30.79 
 
 
361 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1201  hypothetical protein  30.79 
 
 
361 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0340  hypothetical protein  30.79 
 
 
361 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0249  hypothetical protein  30.79 
 
 
361 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2176  SciB protein  30.79 
 
 
361 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.715088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2365  type VI secretion protein, VC_A0111 family  29.28 
 
 
349 aa  125  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3228  type VI secretion protein  28.95 
 
 
338 aa  122  9e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0290  SciB protein  35.97 
 
 
311 aa  122  9.999999999999999e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.718138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3013  type VI secretion protein  31.02 
 
 
353 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.695599  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3729  hypothetical protein  30.42 
 
 
338 aa  120  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2803  type VI secretion protein, VC_A0111 family  28.37 
 
 
337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6688  type VI secretion protein  30.3 
 
 
353 aa  119  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.355803  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3314  hypothetical protein  29.43 
 
 
329 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50850  hypothetical protein  31.85 
 
 
340 aa  118  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0823811  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0390  type VI secretion protein  28.27 
 
 
356 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0317  hypothetical protein  28.27 
 
 
343 aa  116  5e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3611  hypothetical protein  28.9 
 
 
335 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42990  hypothetical protein  28.94 
 
 
335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0242  hypothetical protein  27.91 
 
 
360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.842784 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0234  hypothetical protein  27.91 
 
 
360 aa  114  3e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4078  hypothetical protein  27.43 
 
 
338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0252169  hitchhiker  0.00001492 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2525  type VI secretion protein  27.01 
 
 
335 aa  113  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0236  hypothetical protein  27.91 
 
 
360 aa  113  6e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2620  hypothetical protein  27.51 
 
 
338 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2698  hypothetical protein  30.48 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.010713  normal  0.0127027 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1120  putative type VI secretion protein VasG  30.68 
 
 
309 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0273687  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1728  hypothetical protein  31.05 
 
 
354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.269335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>