More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2610 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2752  major facilitator transporter  96.1 
 
 
436 aa  843    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.419621  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1292  general substrate transporter  92.2 
 
 
436 aa  813    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0857643  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2550  major facilitator transporter  93.12 
 
 
436 aa  819    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2610  major facilitator transporter  100 
 
 
436 aa  870    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.241341 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56470  putative MFS transporter  76.39 
 
 
439 aa  626  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4913  MFS family transporter  74.71 
 
 
439 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3935  major facilitator transporter  67.38 
 
 
440 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4149  general substrate transporter  70.07 
 
 
433 aa  568  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.65199  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1015  major facilitator transporter  67.96 
 
 
438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.210146  normal  0.25422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0238  major facilitator transporter  51.91 
 
 
437 aa  429  1e-119  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4332  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  49.88 
 
 
430 aa  423  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0389  General substrate transporter  49.88 
 
 
430 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0253  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
430 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.262209  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3041  general substrate transporter  49.75 
 
 
435 aa  411  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2122  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
430 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.443931  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0109  general substrate transporter  48.17 
 
 
440 aa  411  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.942057  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3299  major facilitator family transporter  50.87 
 
 
417 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0436  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
430 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.23524  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2967  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
430 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0219  major facilitator family transporter  49.16 
 
 
430 aa  408  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.562064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3380  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
430 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0241  major facilitator family transporter  50.24 
 
 
430 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.715171  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2384  major facilitator superfamily MFS_1  47.88 
 
 
443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.210469  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3046  general substrate transporter  48.68 
 
 
435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6393  major facilitator transporter  48.76 
 
 
435 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3065  general substrate transporter  48.68 
 
 
435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2432  general substrate transporter  48.68 
 
 
435 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3091  general substrate transporter  49.13 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2957  general substrate transporter  49.13 
 
 
435 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.803782 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2791  major facilitator superfamily MFS_1  47.86 
 
 
443 aa  396  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3403  major facilitator transporter  49.87 
 
 
461 aa  385  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0889  major facilitator transporter  48.06 
 
 
447 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.242663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3781  major facilitator transporter  46.88 
 
 
438 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.243933  decreased coverage  0.00125466 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2353  major facilitator transporter  47.12 
 
 
438 aa  366  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3029  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  46.51 
 
 
435 aa  364  2e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.086434  normal  0.0267794 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3742  major facilitator transporter  46.63 
 
 
438 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0201656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4621  major facilitator transporter  46.63 
 
 
438 aa  362  5.0000000000000005e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2363  major facilitator superfamily MFS_1  45.32 
 
 
438 aa  355  8.999999999999999e-97  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.571173 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2767  major facilitator superfamily MFS_1  45.34 
 
 
438 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.527075  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2802  proline/betaine transporter  44.6 
 
 
438 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0404064  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4993  major facilitator transporter  45.17 
 
 
438 aa  350  2e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.657655  normal  0.955578 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2530  major facilitator transporter  44.84 
 
 
436 aa  350  3e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.969738 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7600  major facilitator transporter  43.88 
 
 
442 aa  345  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.618888  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5664  major facilitator transporter  45.22 
 
 
431 aa  343  2.9999999999999997e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3994  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  45.57 
 
 
425 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0178094  normal  0.374978 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0703  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 
425 aa  343  5e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.406001  normal  0.691513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3314  major facilitator superfamily MFS_1  43.66 
 
 
457 aa  342  8e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127085  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2529  major facilitator transporter  44.67 
 
 
425 aa  340  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0645  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  42.63 
 
 
454 aa  339  5e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.27253 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2668  major facilitator transporter  44.39 
 
 
425 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.471807  normal  0.918388 
 
 
-
 
NC_003296  RS00416  sugar-proton symporter transmembrane protein  44.6 
 
 
441 aa  337  2.9999999999999997e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0632  major facilitator transporter  43.84 
 
 
425 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0608  major facilitator transporter  43.84 
 
 
425 aa  335  1e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0717  major facilitator transporter  43.13 
 
 
425 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0684  major facilitator transporter  43.13 
 
 
425 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.532033  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3017  major facilitator transporter  44.47 
 
 
440 aa  332  1e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.615257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0233  major facilitator transporter  43.13 
 
 
425 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2695  major facilitator transporter  44.12 
 
 
442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2715  major facilitator family transporter  41.08 
 
 
428 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2044  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  45.34 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2186  major facilitator family transporter  45.34 
 
 
440 aa  325  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3805  major facilitator transporter  43.69 
 
 
425 aa  323  4e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1160  major facilitator transporter  41.12 
 
 
440 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1274  major facilitator family transporter  42.68 
 
 
427 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5120  major facilitator superfamily MFS_1  42.5 
 
 
429 aa  319  6e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3535  major facilitator transporter  42.11 
 
 
449 aa  319  6e-86  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3518  major facilitator transporter  42.29 
 
 
447 aa  317  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1763  major facilitator superfamily MFS_1  40.69 
 
 
427 aa  317  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0782222  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1520  General substrate transporter  40.57 
 
 
453 aa  315  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817393  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0835  major facilitator superfamily MFS_1  42.27 
 
 
439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.554079  normal  0.519033 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5813  major facilitator transporter  44.36 
 
 
440 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0625628  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0906  major facilitator superfamily MFS_1  41.61 
 
 
439 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3359  major facilitator transporter  41.83 
 
 
440 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585517  normal  0.0285319 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4727  major facilitator transporter  41.9 
 
 
428 aa  311  1e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192951  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2605  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  39.51 
 
 
452 aa  311  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.758058  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5934  major facilitator superfamily MFS_1  41.59 
 
 
433 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.3101  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6616  major facilitator superfamily MFS_1  39.19 
 
 
452 aa  311  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.142265  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5373  major facilitator transporter  40.71 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4897  major facilitator transporter  40.71 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165867  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2993  major facilitator transporter  40.71 
 
 
443 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0897  major facilitator transporter  41.06 
 
 
432 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.924021  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3376  major facilitator family transporter  43.83 
 
 
499 aa  310  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0442  major facilitator superfamily MFS_1  39.86 
 
 
444 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.327112  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0253  major facilitator transporter  40.48 
 
 
443 aa  309  5.9999999999999995e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.610074 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2954  major facilitator transporter  40.23 
 
 
466 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.574256  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1667  gp59  42.2 
 
 
444 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00012359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1824  major facilitator transporter  39.57 
 
 
448 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.350034  hitchhiker  0.00988638 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1809  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
445 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1109  major facilitator transporter  41.4 
 
 
428 aa  305  7e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1589  major facilitator transporter  41.4 
 
 
428 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389465  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1648  major facilitator transporter  41.5 
 
 
428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0380  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.420332  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1493  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
420 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342627  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2112  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0795  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
445 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0478  major facilitator family transporter  40.87 
 
 
445 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138863  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5418  major facilitator protein family permease  44.91 
 
 
434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.540224  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1566  major facilitator transporter  41.15 
 
 
428 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1505  major facilitator transporter  42.54 
 
 
428 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2996  major facilitator transporter  40.67 
 
 
433 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.271761 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>