More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2563 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3151  aldehyde dehydrogenase family protein  98.7 
 
 		 461 aa  932    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2660  aldehyde dehydrogenase family protein  73.87 
 
 		 463 aa  688    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.349181  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2394  aldehyde dehydrogenase  72.57 
 
 		 463 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0666523  normal  0.869122 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3276  aldehyde dehydrogenase  75.32 
 
 		 463 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0875007 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2894  aldehyde dehydrogenase  94.79 
 
 		 461 aa  904    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.237665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2563  aldehyde dehydrogenase  100 
 
 		 461 aa  941    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2704  aldehyde dehydrogenase  97.61 
 
 		 461 aa  925    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598513 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01482  predicted aldehyde dehydrogenase  66.01 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2121  Aldehyde Dehydrogenase  66.01 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0323198  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1607  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  66.01 
 
 		 462 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.764255  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2133  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  66.01 
 
 		 462 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1681  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  66.01 
 
 		 462 aa  606  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.956976  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01493  hypothetical protein  66.01 
 
 		 462 aa  605  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1725  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  65.8 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.875923  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2138  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  65.8 
 
 		 462 aa  603  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.752498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1647  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  65.58 
 
 		 462 aa  602  1.0000000000000001e-171  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2005  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  66.81 
 
 		 462 aa  601  1.0000000000000001e-171  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.176912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1637  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  65.05 
 
 		 462 aa  581  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1811  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  65.27 
 
 		 462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1696  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  65.27 
 
 		 462 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.087576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1646  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  65.27 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00984812  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1629  putative succinate semialdehyde dehydrogenase  65.05 
 
 		 462 aa  579  1e-164  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1825  Aldehyde Dehydrogenase  57.24 
 
 		 461 aa  522  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.450038 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4408  Aldehyde Dehydrogenase  47.05 
 
 		 457 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1074  putative aldehyde dehydrogenase  46.44 
 
 		 454 aa  417  9.999999999999999e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000640606  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  46 
 
 		 465 aa  415  9.999999999999999e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.909574  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1926  aldehyde dehydrogenase  46.67 
 
 		 455 aa  417  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.515635  normal  0.086374 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2100  Aldehyde Dehydrogenase  46.46 
 
 		 457 aa  414  1e-114  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.773732  normal  0.123203 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4244  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 		 452 aa  414  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2453  Aldehyde Dehydrogenase  50.88 
 
 		 455 aa  410  1e-113  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3617  Aldehyde Dehydrogenase  46.29 
 
 		 470 aa  409  1e-113  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0352  aldehyde dehydrogenase family protein  44.81 
 
 		 457 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000509141  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2448  aldehyde dehydrogenase  46.89 
 
 		 452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2008  Aldehyde Dehydrogenase  45.88 
 
 		 465 aa  402  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08406  succinate-semialdehyde dehydrogenase  43.43 
 
 		 449 aa  403  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1725  succinic semialdehyde dehydrogenase  45.7 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.450617  decreased coverage  0.000946553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2318  Aldehyde Dehydrogenase  46.77 
 
 		 452 aa  403  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.170105  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1541  hypothetical protein  43.97 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1442  hypothetical protein  44.2 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2321  Aldehyde Dehydrogenase  43.96 
 
 		 466 aa  398  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1159  Aldehyde Dehydrogenase  44.03 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6328  Aldehyde Dehydrogenase  45.33 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0373532  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2070  aldehyde dehydrogenase  45.35 
 
 		 475 aa  395  1e-109  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0905776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1742  succinic semialdehyde dehydrogenase  44.47 
 
 		 470 aa  395  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.847315  normal  0.737233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1346  Aldehyde Dehydrogenase  44.87 
 
 		 454 aa  394  1e-108  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.211595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1956  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.93 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2737  Aldehyde Dehydrogenase  43.88 
 
 		 454 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4169  Aldehyde Dehydrogenase  44.89 
 
 		 455 aa  389  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1989  aldehyde dehydrogenase family protein  42.63 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00344108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0914  aldehyde dehydrogenase  42.16 
 
 		 457 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.929249 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0333  Aldehyde Dehydrogenase  47.57 
 
 		 452 aa  387  1e-106  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.909996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3924  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  44.47 
 
 		 457 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.292623  decreased coverage  0.00345047 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2399  Aldehyde Dehydrogenase  42.67 
 
 		 460 aa  385  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2056  Aldehyde Dehydrogenase  42.73 
 
 		 457 aa  388  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0119311 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0352  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 459 aa  385  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.491139  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2711  Aldehyde Dehydrogenase  44.88 
 
 		 464 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.275428  hitchhiker  0.000000324245 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4209  Aldehyde Dehydrogenase  44.89 
 
 		 455 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2797  Aldehyde Dehydrogenase  46.46 
 
 		 457 aa  385  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00921996  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0391  aldehyde dehydrogenase  44.1 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.641534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1188  aldehyde dehydrogenase  46.46 
 
 		 461 aa  382  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.417271  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0388  Aldehyde Dehydrogenase_  43.74 
 
 		 458 aa  379  1e-104  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.0000000000227501  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1887  aldehyde dehydrogenase  44.35 
 
 		 456 aa  380  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0821  aldehyde dehydrogenase  44 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.376923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10236  succinic semialdehyde dehydrogenase  46.24 
 
 		 511 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03968  succinate-semialdehyde dehydrogenase  42.67 
 
 		 462 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1292  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+]  41.91 
 
 		 458 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3122  Aldehyde Dehydrogenase_  46.1 
 
 		 469 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0781135  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15470  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  44.42 
 
 		 458 aa  378  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.580059  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1858  Aldehyde Dehydrogenase  42.92 
 
 		 457 aa  375  1e-103  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0377  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  42.44 
 
 		 454 aa  375  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4057  Aldehyde Dehydrogenase  40.35 
 
 		 457 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2216  Aldehyde Dehydrogenase  43.36 
 
 		 474 aa  374  1e-102  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.273207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3223  Aldehyde Dehydrogenase  45.88 
 
 		 469 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.989475  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00454  aldehyde-dehydrogenase like protein YneI  47.23 
 
 		 454 aa  370  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0760178  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0222  aldehyde dehydrogenase  42.98 
 
 		 456 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1620  aldehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 454 aa  365  1e-100  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3025  aldehyde dehydrogenase  45.88 
 
 		 469 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0175  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  39.16 
 
 		 455 aa  365  1e-100  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0839  aldehyde Dehydrogenase  42.22 
 
 		 455 aa  366  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0330  aldehyde dehydrogenase family protein  40.71 
 
 		 457 aa  365  1e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0316513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1940  aldehyde dehydrogenase  41.76 
 
 		 454 aa  365  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.613178  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3003  aldehyde dehydrogenase  44.3 
 
 		 469 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000280927  normal  0.841466 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4876  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.7 
 
 		 456 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.570732 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1608  aldehyde dehydrogenase  41.9 
 
 		 443 aa  360  4e-98  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4853  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.7 
 
 		 456 aa  360  4e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2542  aldehyde dehydrogenase  39.47 
 
 		 454 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4194  Aldehyde Dehydrogenase  41.87 
 
 		 487 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4778  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  42.26 
 
 		 456 aa  357  2.9999999999999997e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.26 
 
 		 456 aa  356  5.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.515013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1858  aldehyde dehydrogenase  39.25 
 
 		 459 aa  355  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0838083 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4926  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  42.04 
 
 		 456 aa  353  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1911  aldehyde dehydrogenase  40.35 
 
 		 458 aa  353  5e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3534  aldehyde dehydrogenase  43.33 
 
 		 455 aa  351  1e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.46589 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10478  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  37.83 
 
 		 473 aa  351  1e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.128776  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4111  Aldehyde Dehydrogenase  45.09 
 
 		 461 aa  351  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11010  NAD-dependent aldehyde dehydrogenase  43.83 
 
 		 458 aa  350  2e-95  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.148552  normal  0.0213171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0508  aldehyde dehydrogenase  39.96 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.143875 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0462  aldehyde dehydrogenase  41.16 
 
 		 526 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.433916  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2363  putative aldehyde dehydrogenase  41.74 
 
 		 460 aa  348  1e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.97252  normal  0.760818 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2202  Aldehyde Dehydrogenase  43.36 
 
 		 456 aa  348  1e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>