More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2513 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2513  aldo/keto reductase  100 
 
 		 303 aa  617  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2644  aldo/keto reductase  90.76 
 
 		 303 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.077473  normal  0.480296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3249  aldo/keto reductase  98.16 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.492949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2662  aldo/keto reductase  84.82 
 
 		 302 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1798  twin-arginine translocation pathway signal  55.59 
 
 		 308 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.116127  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26350  Aldo/keto reductase protein  56.99 
 
 		 307 aa  315  5e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4003  aldo/keto reductase  52.03 
 
 		 271 aa  281  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.444769  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0376  aldo/keto reductase  46.73 
 
 		 306 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2106  aldo/keto reductase  47.06 
 
 		 314 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49120  Aldo/keto reductase  45.6 
 
 		 305 aa  266  4e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0384545  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4782  putative aldo/keto reductase  52 
 
 		 307 aa  262  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.476662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7084  aldo/keto reductase  48.26 
 
 		 301 aa  252  5.000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.881605  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6222  aldo/keto reductase  47.2 
 
 		 302 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2471  aldo/keto reductase  42.91 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.367665 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1266  aldo/keto reductase  43.09 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5330  aldo/keto reductase  46.27 
 
 		 333 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.685362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5422  aldo/keto reductase  42.47 
 
 		 316 aa  237  2e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0310  aldo/keto reductase  43.06 
 
 		 309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.66643  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3208  aldo/keto reductase  47.95 
 
 		 323 aa  226  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00561471  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1231  aldo/keto reductase  43.97 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0028  aldo/keto reductase  43.02 
 
 		 311 aa  222  6e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.277769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1371  aldo/keto reductase  41.64 
 
 		 304 aa  218  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0625876 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3859  aldo/keto reductase  42.05 
 
 		 309 aa  217  2e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.665179  normal  0.078293 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4168  aldo/keto reductase  41.7 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.528392 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1065  aldo/keto reductase  40.58 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4332  aldo/keto reductase  41.84 
 
 		 305 aa  213  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00722247 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0446  aldo/keto reductase  40.52 
 
 		 301 aa  209  4e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4318  aldo/keto reductase  41.18 
 
 		 317 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.443363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2819  aldo/keto reductase  36.99 
 
 		 317 aa  199  3e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.842326  normal  0.173648 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0575  twin-arginine translocation pathway signal  37.76 
 
 		 345 aa  199  3.9999999999999996e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.451662  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1200  putative oxidoreductase protein  41.83 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0777  aldo/keto reductase  38.58 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0409977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1310  putative oxidoreductase protein  38.46 
 
 		 277 aa  177  2e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.679533  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5296  aldo/keto reductase  34.48 
 
 		 271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  37.06 
 
 		 286 aa  74.3  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2769  aldo/keto reductase  29.63 
 
 		 329 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  29.03 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  26.27 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0536  putative aldose reductase  25.79 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0284216  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1681  aldo/keto reductase  29.41 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  24.37 
 
 		 408 aa  67.4  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2739  aldo/keto reductase  28.98 
 
 		 352 aa  67.4  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.8158 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1801  aldo/keto reductase  27.78 
 
 		 338 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  30.37 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0681  twin-arginine translocation pathway signal  27.68 
 
 		 345 aa  66.2  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.864025 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3355  aldo/keto reductase  28.92 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1355  aldo/keto reductase  28.36 
 
 		 369 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.630343  normal  0.0541825 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  23.97 
 
 		 396 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  24.44 
 
 		 400 aa  64.3  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4055  aldo/keto reductase  25.49 
 
 		 280 aa  64.7  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2484  aldo/keto reductase  28.27 
 
 		 352 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.797379  normal  0.441954 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  26.77 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3802  aldo/keto reductase  31.21 
 
 		 386 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2446  aldo/keto reductase  28.42 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.05241 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  26.64 
 
 		 343 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  30.12 
 
 		 285 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  27.03 
 
 		 406 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1871  aldo/keto reductase  27.18 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202934  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1417  aldo/keto reductase  28.33 
 
 		 349 aa  63.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.479026  normal  0.0673448 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2034  aldo/keto reductase  30 
 
 		 357 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1537  aldo/keto reductase  26.53 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499861 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1995  aldo/keto reductase family oxidoreductase  27.18 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0490  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.07 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  29.67 
 
 		 328 aa  63.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3173  aldo/keto reductase  27.8 
 
 		 279 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1459  aldo/keto reductase  26.37 
 
 		 350 aa  63.2  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.209744  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3663  aldo/keto reductase  27.05 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4757  aldo/keto reductase  25.78 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.468668  normal  0.0354493 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00367  predicted oxidoreductase, NAD(P)-binding  26.07 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3190  aldo/keto reductase  26.07 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0450  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.07 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2798  aldo/keto reductase  25.4 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.503233  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0455  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.07 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3214  aldo/keto reductase  26.07 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000166082 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00371  hypothetical protein  26.07 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0340  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.07 
 
 		 324 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0502  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  26.07 
 
 		 324 aa  62.8  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1556  aldo/keto reductase  26.62 
 
 		 349 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206898  normal  0.568157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3225  aldo/keto reductase  28.92 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.779629  normal  0.443318 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0928  aldo/keto reductase  27.24 
 
 		 339 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.339617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0488  aldo/keto reductase  30.51 
 
 		 368 aa  62.4  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.807596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  24.81 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  24.83 
 
 		 398 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3201  putative oxidoreductase  27.76 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.448174  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1644  aldo/keto reductase  24.75 
 
 		 323 aa  62  0.00000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.539861  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  26.27 
 
 		 413 aa  62  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1420  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.7 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0108  aldo/keto reductase  25.95 
 
 		 345 aa  62  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0196191  hitchhiker  0.00894917 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1880  aldo/keto reductase  25.9 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3940  aldo/keto reductase  27.76 
 
 		 339 aa  62  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.336434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  25 
 
 		 410 aa  62  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01616  conserved hypothetical protein  27.07 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.178655 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01740  predicted oxidoreductase  26.7 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3467  aldo/keto reductase  26.83 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.648507  normal  0.107464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1335  aldo/keto reductase  28.73 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.546872 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3594  aldo/keto reductase  27.05 
 
 		 344 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1762  aldo/keto reductase  28.44 
 
 		 327 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.385791 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  30.72 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01728  hypothetical protein  26.7 
 
 		 326 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2006  aldo/keto reductase  27.36 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>