58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2512 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3250  major facilitator transporter  96.49 
 
 		 427 aa  769    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.840395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2512  major facilitator transporter  100 
 
 		 427 aa  834    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2643  major facilitator transporter  92.74 
 
 		 427 aa  750    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.268366  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2661  major facilitator transporter  86.26 
 
 		 439 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26360  Major facilitator family protein  69.65 
 
 		 435 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1799  major facilitator transporter  70.49 
 
 		 429 aa  555  1e-157  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0377  ATP/ADP translocase-like protein  56.53 
 
 		 430 aa  436  1e-121  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1530  major facilitator transporter  55.8 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.749699  normal  0.343883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2784  transporter, putative  57.32 
 
 		 436 aa  421  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1331  major facilitator superfamily MFS_1  54.5 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.865021  normal  0.03557 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4783  putative MFS superfamily transport protein  53.16 
 
 		 453 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127813  normal  0.486857 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4002  major facilitator transporter  53.08 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0029  major facilitator transporter  49.76 
 
 		 448 aa  360  3e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0641866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4166  hypothetical protein  43.91 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.221707 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3857  hypothetical protein  43.91 
 
 		 458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862287 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4316  hypothetical protein  44.6 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0448  hypothetical protein  41.98 
 
 		 457 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1229  hypothetical protein  46.09 
 
 		 450 aa  300  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1369  hypothetical protein  43.74 
 
 		 442 aa  297  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0720055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1896  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 449 aa  276  7e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.183614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3067  hypothetical protein  35.65 
 
 		 441 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.179764 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01661  hypothetical protein  33.7 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.450943  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09318  hypothetical protein  27.82 
 
 		 939 aa  84.3  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3730  ATP/ADP translocase-like protein  29.97 
 
 		 400 aa  80.9  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.374188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1797  major facilitator transporter  57.63 
 
 		 73 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000398276  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0335  ADP, ATP carrier protein  24.07 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00666368  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1256  ATP/ADP translocase-like  24.77 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0782  ADP, ATP carrier protein  21.67 
 
 		 543 aa  54.7  0.000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  unclonable  0.00645947  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0237  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.75 
 
 		 621 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3226  major facilitator superfamily MFS_1  23.64 
 
 		 392 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  28.31 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1488  ATP/ADP translocase-like protein  24.8 
 
 		 803 aa  47.4  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45145  nucleotide transporter 2  22.13 
 
 		 575 aa  47  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0739731  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3792  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.25 
 
 		 509 aa  46.6  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0929  HEAT repeat-containing PBS lyase  21.13 
 
 		 1010 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1099  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.62 
 
 		 519 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54110  nucleotide transporter 5  24.6 
 
 		 547 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.779323  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0054  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.69 
 
 		 539 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0098  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.05 
 
 		 508 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.700736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4262  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.83 
 
 		 515 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3530  major facilitator transporter  40.24 
 
 		 469 aa  43.9  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.229516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2351  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.67 
 
 		 504 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500074  normal  0.144653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2894  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.67 
 
 		 511 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0578631  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5025  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.53 
 
 		 1056 aa  43.9  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00524189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6232  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.87 
 
 		 535 aa  43.9  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2685  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.53 
 
 		 511 aa  43.5  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0846353  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2683  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.67 
 
 		 511 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000215764  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0039  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 537 aa  43.9  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.677272  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2877  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.67 
 
 		 511 aa  43.9  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0363154  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2880  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24.67 
 
 		 511 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00104329 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  24.67 
 
 		 511 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0905383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2928  drug resistance transporter, EmrB/QacA family  24 
 
 		 511 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000585053  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0093  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.07 
 
 		 523 aa  43.5  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2608  multidrug resistance protein B  24.67 
 
 		 511 aa  43.5  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000057385  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50189  nucleotide transporter 3  28.7 
 
 		 666 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.384013  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0068  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  26.98 
 
 		 528 aa  43.5  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0062  major facilitator transporter  28.69 
 
 		 482 aa  43.1  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2504  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.87 
 
 		 501 aa  43.1  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.300835 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>