More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2492 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2492  NUDIX hydrolase  100 
 
 		 132 aa  269  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3268  MutT/nudix family protein  93.18 
 
 		 132 aa  257  3e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2696  mutT/nudix family protein  44.07 
 
 		 128 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0531307  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2430  NUDIX hydrolase  50.52 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0238883 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2090  NUDIX hydrolase  41.44 
 
 		 141 aa  89  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.147471  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3914  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 140 aa  89.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3290  NUDIX hydrolase  45.63 
 
 		 120 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3407  NUDIX hydrolase  42.34 
 
 		 140 aa  88.6  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.107532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4365  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4001  NUDIX hydrolase  39.64 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.543097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1184  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1638  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 140 aa  85.9  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0477053 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1664  NUDIX hydrolase  40.91 
 
 		 140 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1582  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 142 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.4234  normal  0.299083 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1563  NUDIX hydrolase  40 
 
 		 142 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3522  NUDIX hydrolase  37.84 
 
 		 141 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.478841 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4812  NUDIX hydrolase  38.18 
 
 		 140 aa  80.9  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2939  NUDIX hydrolase  37.4 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1577  NUDIX hydrolase  41.18 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479976  normal  0.0612307 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2082  NUDIX hydrolase  35.43 
 
 		 146 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.494024 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3967  MutT/nudix family protein  39.47 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.447658  normal  0.0696331 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5852  NUDIX hydrolase  39.81 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4233  NUDIX hydrolase  41.05 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.257262  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2944  NUDIX hydrolase  42.11 
 
 		 140 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.948773 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5518  NUDIX hydrolase  38.83 
 
 		 183 aa  67  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1285  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 185 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.270966  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6153  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 185 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.292779 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6546  NUDIX hydrolase  42.72 
 
 		 185 aa  67  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5170  NUDIX hydrolase  40.62 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.140908  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6007  NUDIX hydrolase  38.1 
 
 		 165 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4759  NUDIX hydrolase  40.21 
 
 		 203 aa  62  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.420324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5533  NUDIX hydrolase  36.56 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00579175 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1837  MutT/NUDIX family hydrolase  32.17 
 
 		 158 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.158104  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1656  NUDIX hydrolase  34.31 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.632067  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2076  NUDIX hydrolase  39.18 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.963545 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2614  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 152 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.349258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4483  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0924  NUDIX hydrolase  35.56 
 
 		 133 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4397  NUDIX hydrolase  40.82 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0874525  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0027  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.130084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0710  NUDIX hydrolase  38.36 
 
 		 154 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0620  NUDIX hydrolase  46.38 
 
 		 282 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.253457 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1678  hypothetical protein  52.17 
 
 		 306 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.552334  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1261  NUDIX hydrolase  38.53 
 
 		 147 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.394929  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1264  putative MutT/Nudix family protein  34.55 
 
 		 132 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0696899 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2439  NUDIX hydrolase  39.29 
 
 		 181 aa  51.6  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000635517  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2044  NUDIX hydrolase  32.08 
 
 		 147 aa  52  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490099 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2381  putative Nudix hydrolase family protein  36.22 
 
 		 139 aa  51.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1496  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 		 174 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.174494 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3377  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  53.19 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0382964  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3508  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  53.19 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.116101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2908  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  53.19 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0055236  normal  0.908985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1047  NUDIX hydrolase  52.08 
 
 		 158 aa  51.2  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4908  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4942  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0330  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0672  MutT/nudix family protein  46.77 
 
 		 147 aa  50.8  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.959271  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4683  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4928  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4522  MutT family pyrophosphohydrolase  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.986145  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4541  MutT/NUDIX family pyrophosphohydrolase  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5043  mutT/nudix family protein  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.672649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4907  antimutator 8-oxo-(dGTP/GTP)ase  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4620  nucleoside triphosphatase YtkD  41.27 
 
 		 159 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7955  hypothetical protein  51.61 
 
 		 172 aa  50.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3562  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 135 aa  50.4  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3464  NUDIX hydrolase  37.21 
 
 		 188 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.918471  hitchhiker  0.00303424 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4976  NUDIX hydrolase  61.11 
 
 		 197 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0467  NUDIX hydrolase  34.88 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1428  NUDIX hydrolase  36.36 
 
 		 170 aa  50.4  0.000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.516023  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0299  mutator mutT protein  35.48 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0361617  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0058  NUDIX hydrolase  47.37 
 
 		 183 aa  49.7  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.993982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0415  NUDIX hydrolase  32.53 
 
 		 154 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2607  NUDIX hydrolase  50 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0976086 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1020  NUDIX hydrolase  42.62 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.720434  hitchhiker  0.00107083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7346  hypothetical protein  37.36 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2976  NUDIX hydrolase  38.96 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.505456  normal  0.467098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1350  NUDIX hydrolase  63.64 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0771  nucleoside triphosphate pyrophosphohydrolase  51.06 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.012976  normal  0.720455 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1033  mutT/nudix family protein  34.86 
 
 		 179 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.851694  normal  0.721154 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0237  NUDIX hydrolase  48.28 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.135862 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0251  mutator mutT protein  33.94 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0088  NUDIX hydrolase  44.26 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.856049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0463  NUDIX hydrolase  33.72 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0069  NUDIX hydrolase  49.12 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.806669  hitchhiker  0.0000000185063 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1757  NUDIX hydrolase  40.43 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.207601  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1466  ADP-Ribose Pyrophosphatase  41.79 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0513  NUDIX hydrolase  36.76 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.117627  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3208  NUDIX hydrolase  39.53 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0207  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000107343 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0575  NUDIX hydrolase  45.45 
 
 		 161 aa  48.5  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1221  NUDIX hydrolase  46.3 
 
 		 221 aa  48.5  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2616  NUDIX hydrolase  43.66 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5641  NUDIX hydrolase  46.15 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1501  NUDIX hydrolase  37.29 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0954993  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1932  NUDIX hydrolase  48.15 
 
 		 221 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2957  MutT/nudix family protein  38.16 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2640  MutT/nudix family protein  38.16 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0434568  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1856  NUDIX hydrolase  31.58 
 
 		 166 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.015208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3459  nucleoside triphosphatase YtkD  39.68 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.160983  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>