More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2419 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3325  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  98.85 
 
 		 696 aa  1401    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.54373 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0887  TonB-dependent siderophore receptor  74.42 
 
 		 692 aa  1047    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2463  TonB-dependent siderophore receptor, putative  61.63 
 
 		 703 aa  855    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.302631  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2229  TonB-dependent siderophore receptor  62.27 
 
 		 703 aa  859    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.560265 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5556  outer membrane protein  57.49 
 
 		 703 aa  796    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.459514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0874  TonB-dependent siderophore receptor  62.83 
 
 		 701 aa  863    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.831709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51930  TonB-dependent siderophore receptor  53.12 
 
 		 709 aa  733    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179519  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2419  TonB-dependent siderophore receptor  100 
 
 		 696 aa  1415    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.56644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63960  putative uter membrane protein precursor  57.69 
 
 		 708 aa  794    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2232  TonB-dependent siderophore receptor  46.91 
 
 		 708 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2559  TonB-dependent siderophore receptor  45.07 
 
 		 708 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3155  outer membrane ferric siderophore receptor, putative  45.04 
 
 		 709 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.990361 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  46.5 
 
 		 710 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2891  TonB-dependent siderophore receptor  44.46 
 
 		 711 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3135  TonB-dependent siderophore receptor  44.8 
 
 		 734 aa  554  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3124  TonB-dependent siderophore receptor  44.98 
 
 		 710 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.319333  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3294  TonB-dependent siderophore receptor, putative  43.24 
 
 		 711 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1141  TonB-dependent siderophore receptor  44.13 
 
 		 736 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1202  TonB-dependent siderophore receptor  43.56 
 
 		 714 aa  536  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.534631  normal  0.117708 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1362  TonB-dependent siderophore receptor  43.48 
 
 		 732 aa  533  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.619941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5875  TonB-dependent siderophore receptor  42.06 
 
 		 689 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.18447 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6070  TonB-dependent siderophore receptor  42.53 
 
 		 738 aa  509  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537532  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3808  TonB-dependent siderophore receptor  42.61 
 
 		 741 aa  497  1e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.071582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4886  TonB-dependent siderophore receptor  42.15 
 
 		 730 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.928986 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4225  TonB-dependent siderophore receptor  42.23 
 
 		 689 aa  490  1e-137  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3406  TonB-dependent siderophore receptor  42.5 
 
 		 722 aa  488  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.155193  decreased coverage  0.0000340201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2729  putative ferrichrome-iron receptor protein  40.29 
 
 		 689 aa  482  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8274  TonB-dependent siderophore receptor  42.59 
 
 		 715 aa  477  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0140393  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3200  TonB-dependent siderophore receptor  38.98 
 
 		 701 aa  457  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.611474  normal  0.133436 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4928  TonB-dependent siderophore receptor  38.7 
 
 		 701 aa  451  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.92165  normal  0.0613128 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6317  TonB-dependent siderophore receptor  39.19 
 
 		 701 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.585153  normal  0.21494 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  39.03 
 
 		 757 aa  448  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  38.55 
 
 		 722 aa  446  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5483  TonB-dependent siderophore receptor  38.56 
 
 		 701 aa  444  1e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00706275 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6494  TonB-dependent siderophore receptor  38.9 
 
 		 701 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6729  TonB-dependent siderophore receptor  38.9 
 
 		 701 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.684633  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03023  putative ferrisiderophore receptor protein  39.58 
 
 		 703 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.269425 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2387  TonB-dependent siderophore receptor  37.7 
 
 		 712 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  40.15 
 
 		 722 aa  434  1e-120  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1120  TonB-dependent siderophore receptor  37.52 
 
 		 701 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 724 aa  391  1e-107  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  34.81 
 
 		 724 aa  389  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  34.73 
 
 		 723 aa  390  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  34.77 
 
 		 715 aa  381  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  35.72 
 
 		 710 aa  379  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0531  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 702 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3500  TonB-dependent siderophore receptor  34.74 
 
 		 702 aa  379  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  35.79 
 
 		 699 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2881  TonB-dependent siderophore receptor  33.43 
 
 		 714 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3776  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 707 aa  371  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.658574  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04088  TonB-dependent outer membrane Receptor  35.89 
 
 		 713 aa  372  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2950  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 720 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3465  TonB-dependent siderophore receptor  33.24 
 
 		 720 aa  360  5e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.47616  normal  0.0124574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3329  TonB-dependent siderophore receptor  33.53 
 
 		 720 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3287  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 720 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1080  TonB-dependent siderophore receptor  33.1 
 
 		 720 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000210628 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2399  TonB-dependent siderophore receptor  33.94 
 
 		 726 aa  336  7.999999999999999e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2122  TonB-dependent siderophore receptor  33.99 
 
 		 726 aa  336  1e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.892393  normal  0.0378186 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  34.62 
 
 		 860 aa  336  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01528  TonB-dependent receptor  31.34 
 
 		 720 aa  335  2e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2076  TonB-dependent siderophore receptor  33.48 
 
 		 743 aa  323  5e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0010  TonB-dependent siderophore receptor  32.98 
 
 		 864 aa  322  9.999999999999999e-87  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.144404  decreased coverage  0.00213669 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2414  TonB-dependent siderophore receptor  34.68 
 
 		 817 aa  317  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.281451 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0148  TonB-dependent siderophore receptor  32.52 
 
 		 862 aa  317  7e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732956  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0217  TonB-dependent siderophore receptor  33.54 
 
 		 850 aa  316  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1780  TonB-dependent siderophore receptor  33 
 
 		 726 aa  310  5e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.276971 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0150  TonB-dependent siderophore receptor  32.65 
 
 		 843 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.13947  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0218  TonB-dependent siderophore receptor  33.39 
 
 		 859 aa  300  9e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  33.61 
 
 		 795 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3001  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 721 aa  292  1e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.463402  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  33.47 
 
 		 795 aa  292  1e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4752  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 799 aa  292  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0186383  normal  0.142458 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  31.94 
 
 		 815 aa  291  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1016  TonB-dependent siderophore receptor  32.75 
 
 		 707 aa  291  4e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.846104 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3082  TonB-dependent siderophore receptor  31.66 
 
 		 825 aa  290  6e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4588  TonB-dependent siderophore receptor  33.77 
 
 		 796 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3039  TonB-dependent siderophore receptor  31.51 
 
 		 825 aa  288  2e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2410  TonB-dependent siderophore receptor  31.6 
 
 		 837 aa  287  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.110935  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4606  TonB-dependent siderophore receptor  34.3 
 
 		 796 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6052  putative TonB-dependent siderophore receptor  32.5 
 
 		 766 aa  281  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0858  TonB-dependent siderophore receptor  32.45 
 
 		 796 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4465  TonB-dependent siderophore receptor  34.01 
 
 		 796 aa  281  4e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0293  TonB-dependent siderophore receptor  32.54 
 
 		 698 aa  280  9e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0815  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 714 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.806497  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0815  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 714 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2953  TonB-dependent siderophore receptor  32.55 
 
 		 792 aa  278  2e-73  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0155  TonB-dependent siderophore receptor  30.65 
 
 		 677 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000133249 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1126  TonB-dependent siderophore receptor  32.67 
 
 		 708 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.984983  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0931  TonB-dependent siderophore receptor  31.77 
 
 		 809 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.79278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0283  TonB-dependent siderophore receptor  32.21 
 
 		 689 aa  273  7e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1057  TonB-dependent siderophore receptor  33.28 
 
 		 719 aa  271  2e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  29.44 
 
 		 707 aa  266  7e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0293  TonB-dependent siderophore receptor  31.52 
 
 		 700 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0576  putative hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  30.47 
 
 		 806 aa  266  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.708306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3324  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  31.85 
 
 		 713 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.992566  normal  0.497085 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0267  TonB-dependent siderophore receptor  32.08 
 
 		 689 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0216741 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0718  hydroxamate-type ferrisiderophore receptor  31.68 
 
 		 724 aa  264  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4343  TonB-dependent outer membrane ferric coprogen receptor FitA  31.85 
 
 		 713 aa  264  4e-69  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10440  TonB-dependent siderophore receptor  31.03 
 
 		 810 aa  263  6.999999999999999e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0438512  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3612  TonB-dependent siderophore receptor  29.79 
 
 		 770 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565753  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>