208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2331 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2331  ThiJ/PfpI domain-containing protein  100 
 
 
228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3431  ThiJ/PfpI domain protein  96.05 
 
 
228 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2504  ThiJ/PfpI domain-containing protein  88.55 
 
 
228 aa  418  1e-116  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2442  ThiJ/PfpI domain-containing protein  78.32 
 
 
227 aa  373  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.197595  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4591  thiJ/pfpI family protein  64.6 
 
 
229 aa  317  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.526162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4606  thiJ/pfpI family protein  64.16 
 
 
227 aa  317  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.62662  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4381  thiJ/pfpI family protein  64.6 
 
 
227 aa  315  3e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154289  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4222  thiJ/PfpI family protein  64.04 
 
 
229 aa  315  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4720  thiJ/pfpI family protein  64.6 
 
 
227 aa  315  3e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.122837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4625  thiJ/pfpI family protein  64.6 
 
 
229 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.904253  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4576  thiJ/pfpI family protein  64.6 
 
 
227 aa  314  7e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0629  thiJ/pfpI family protein  58.79 
 
 
166 aa  215  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.2762  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0433  ThiJ/PfpI domain protein  45.05 
 
 
230 aa  214  9.999999999999999e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781813  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2992  hypothetical protein  43.16 
 
 
273 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.152511  normal  0.155125 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1134  ThiJ/PfpI  46.58 
 
 
250 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2964  ThiJ/PfpI domain protein  43.24 
 
 
226 aa  202  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3475  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.96 
 
 
232 aa  202  5e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0419  ThiJ/PfpI  45.81 
 
 
234 aa  201  6e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl402  putative PFPI-like cystiene protease  44.25 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.09 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3087  ThiJ/PfpI domain protein  44.69 
 
 
230 aa  196  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00619766  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29000  hypothetical protein  45.98 
 
 
228 aa  193  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000723683 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0227  ThiJ/PfpI family protein  43.67 
 
 
235 aa  192  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4305  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.05 
 
 
231 aa  191  1e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.377734  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2821  ThiJ/PfpI domain protein  44.2 
 
 
227 aa  189  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5679  ThiJ/PfpI  43.86 
 
 
260 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6043  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.86 
 
 
260 aa  187  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0569087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0152  ThiJ/PfpI domain protein  42.54 
 
 
230 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5530  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.19 
 
 
227 aa  182  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.383076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0311  ThiJ/PfpI domain protein  41.78 
 
 
232 aa  181  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.0186546 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7474  ThiJ/PfpI family protein  41.85 
 
 
227 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4674  ThiJ/PfpI domain protein  41.23 
 
 
227 aa  175  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6314  ThiJ/PfpI domain protein  39.91 
 
 
230 aa  174  7e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3997  hypothetical protein  45.54 
 
 
228 aa  174  9e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0116  ThiJ/PfpI domain protein  39.46 
 
 
228 aa  172  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2424  ThiJ/PfpI domain-containing protein  40.36 
 
 
232 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0627  ThiJ/PfpI domain protein  40.71 
 
 
223 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1995  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.36 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5032  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.21 
 
 
237 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.848966 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0933  ThiJ/PfpI family protein  36.05 
 
 
229 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3360  ThiJ/PfpI domain protein  42.41 
 
 
226 aa  157  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00683077  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3190  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.79 
 
 
237 aa  155  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.687105  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2975  ThiJ/PfpI domain protein  38.86 
 
 
230 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.420811 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1577  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.22 
 
 
235 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2067  ThiJ/PfpI domain protein  38.5 
 
 
261 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0425757  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3106  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.22 
 
 
223 aa  153  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.424885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3144  ThiJ/PfpI domain protein  38.86 
 
 
230 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2650  ThiJ/PfpI  37.5 
 
 
224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0683  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.55 
 
 
229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1700  DJ-1/PfpI family protein  40 
 
 
227 aa  151  8.999999999999999e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.600879  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0774  ThiJ/PfpI domain protein  41.52 
 
 
254 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.561024  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3350  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.73 
 
 
231 aa  149  4e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.097714  normal  0.411486 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2637  ThiJ/PfpI domain protein  39.65 
 
 
221 aa  149  4e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0944  ThiJ/PfpI family protein  37.17 
 
 
219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1352  ThiJ/PfpI domain protein  38.84 
 
 
225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3911  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.67 
 
 
224 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1406  DJ-1/PfpI family protein  39.56 
 
 
226 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2295  peptidase  39.56 
 
 
226 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0524  DJ-1/PfpI family protein  39.56 
 
 
226 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0124  DJ-1/PfpI family protein  39.56 
 
 
226 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1062  DJ-1/PfpI family protein  39.56 
 
 
226 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0976  DJ-1/PfpI family protein  39.56 
 
 
226 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1490  DJ-1/PfpI family protein  39.56 
 
 
226 aa  146  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2826  intracellular protease/amidase, putative  37.33 
 
 
227 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.410637  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1174  ThiJ/PfpI domain protein  37.78 
 
 
227 aa  145  5e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10123  ThiJ/PfpI  36.4 
 
 
267 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.882112  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6748  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.73 
 
 
230 aa  145  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0854  ThiJ/PfpI domain protein  36.36 
 
 
224 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4294  ThiJ/PfpI domain protein  36.61 
 
 
224 aa  143  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3383  ThiJ/PfpI domain protein  37.5 
 
 
225 aa  142  3e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0349  ThiJ/PfpI domain protein  38.26 
 
 
225 aa  143  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1296  putative intracellular protease/amidase  40 
 
 
175 aa  142  3e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1011  ThiJ/PfpI  38.86 
 
 
225 aa  142  4e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2247  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.53 
 
 
227 aa  142  4e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.369253 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0431  ThiJ/PfpI domain protein  38.67 
 
 
227 aa  141  7e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0376  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.09 
 
 
230 aa  141  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0266  ThiJ/PfpI domain protein  35.65 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0026  ThiJ/PfpI  38.86 
 
 
245 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389773  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1380  ThiJ/PfpI domain protein  36.8 
 
 
257 aa  140  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0324  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36 
 
 
227 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0285  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.09 
 
 
225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246139 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1370  ThiJ/PfpI  39.45 
 
 
229 aa  139  3e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0019  ThiJ/PfpI  38.05 
 
 
230 aa  139  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00734  DJ-1/PfpI family protein  35.71 
 
 
223 aa  139  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4361  ThiJ/PfpI domain-containing protein  38.84 
 
 
228 aa  139  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.22 
 
 
230 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3319  ThiJ/PfpI  38.53 
 
 
227 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.262803  normal  0.267473 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0819  ThiJ/PfpI domain protein  38.7 
 
 
221 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0634  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.65 
 
 
258 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0270  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.22 
 
 
232 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0262  ThiJ/PfpI domain-containing protein  35.22 
 
 
230 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1353  ThiJ/PfpI family protein  38.43 
 
 
225 aa  138  6e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3545  ThiJ/PfpI family protein  40.26 
 
 
225 aa  138  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.809418  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  37.33 
 
 
231 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3509  DJ-1/PfpI family protein  37.75 
 
 
270 aa  138  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.962862  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2068  ThiJ/PfpI domain-containing protein  36.44 
 
 
228 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0479  NonF-related protein  34.96 
 
 
229 aa  136  2e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0791  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.17 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.196046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3926  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.36 
 
 
225 aa  135  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2491  ThiJ/PfpI family protein  37.99 
 
 
225 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>