More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2268 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  98.88 
 
 		 355 aa  663    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  98.04 
 
 		 355 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  95.81 
 
 		 355 aa  647    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  100 
 
 		 358 aa  720    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  87.68 
 
 		 354 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3016  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis protein/P47K  89.83 
 
 		 354 aa  592  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0521997  normal  0.178415 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3099  cobalamin synthesis protein/P47K  87.64 
 
 		 357 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4587  cobalamin biosynthesis protein CobW  80.11 
 
 		 349 aa  555  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00207896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25960  putative cobalamin biosynthesis protein cobW  79.27 
 
 		 375 aa  543  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0063336  normal  0.0651392 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2218  cobalamin biosynthesis protein CobW  78.15 
 
 		 350 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.718748  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2408  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  63.31 
 
 		 386 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0519284  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0278  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.22 
 
 		 357 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.141635  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1171  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  63.22 
 
 		 357 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0664593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1953  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.22 
 
 		 357 aa  422  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.891813  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1616  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.22 
 
 		 357 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.877521  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0882  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.22 
 
 		 357 aa  421  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.116066  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2097  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.22 
 
 		 390 aa  420  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1937  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.93 
 
 		 357 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.176615  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5747  cobalamin biosynthesis protein CobW  67.88 
 
 		 349 aa  418  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000222169 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5000  cobalamin biosynthesis protein CobW  60.83 
 
 		 363 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287496  hitchhiker  0.0000190574 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1630  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.78 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.893644  normal  0.0183508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1575  cobalamin biosynthesis protein CobW  63.64 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.467386 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1647  CobW  61.11 
 
 		 367 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0505719  normal  0.0706509 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1176  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  62.78 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.129862  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1656  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.78 
 
 		 362 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1556  cobalamin biosynthesis protein CobW  62.78 
 
 		 362 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0295518  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1583  cobalamin biosynthesis protein CobW  61.02 
 
 		 369 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4805  cobalamin synthesis protein/P47K  61.93 
 
 		 362 aa  397  1e-109  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.918166  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3153  cobalamin biosynthesis protein CobW  60.5 
 
 		 369 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1876  cobalamin biosynthesis protein CobW  53.95 
 
 		 349 aa  366  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2671  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.97 
 
 		 349 aa  365  1e-100  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1376  cobalamin biosynthesis protein CobW  56.79 
 
 		 360 aa  357  9.999999999999999e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0540788 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2372  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.84 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0653093  normal  0.0136743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2132  cobalamin biosynthesis protein CobW  52 
 
 		 349 aa  353  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00697159  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1760  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.38 
 
 		 354 aa  346  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0805096  normal  0.0884735 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2648  cobalamin biosynthesis protein CobW  55.04 
 
 		 357 aa  343  2e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0237696  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1307  cobW protein, putative  53.12 
 
 		 349 aa  342  4e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1270  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.84 
 
 		 349 aa  339  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4328  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.51 
 
 		 358 aa  339  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.559643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1027  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.72 
 
 		 348 aa  339  5e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.959481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1438  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.97 
 
 		 344 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.481567 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1591  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.85 
 
 		 344 aa  333  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0216526 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3407  cobalamin synthesis protein/P47K  54.42 
 
 		 346 aa  332  6e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00803812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3114  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.63 
 
 		 344 aa  328  7e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00643978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0827  cobalamin synthesis protein cobW-like  50.57 
 
 		 348 aa  328  8e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2448  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.71 
 
 		 343 aa  328  8e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3662  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.43 
 
 		 343 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.419795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1716  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.81 
 
 		 344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0702556  decreased coverage  0.00438103 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1441  cobalamin biosynthesis protein CobW  52.81 
 
 		 344 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.371847  normal  0.394564 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3143  putative cobalamin synthesis protein cobW  50.57 
 
 		 345 aa  322  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2148  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.03 
 
 		 344 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3506  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.44 
 
 		 348 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0380718  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2531  cobalamin biosynthesis protein CobW  50.14 
 
 		 344 aa  319  3.9999999999999996e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4489  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.27 
 
 		 348 aa  317  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0600859 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1890  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  51.76 
 
 		 343 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.91966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3287  cobalamin biosynthesis protein CobW  54.26 
 
 		 344 aa  311  1e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.0071849  normal  0.760489 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2436  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.61 
 
 		 344 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11085 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3269  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.03 
 
 		 349 aa  298  7e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0139485 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0160  cobalamin biosynthesis protein CobW  51.87 
 
 		 359 aa  292  6e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.765545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2933  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  49.15 
 
 		 350 aa  292  7e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0128514  hitchhiker  0.00376638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2209  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  47.19 
 
 		 344 aa  290  3e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.859835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1517  cobalamin biosynthesis protein CobW  48.61 
 
 		 345 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0241447  normal  0.0776458 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0343  cobalamin biosynthesis CobW  51.91 
 
 		 350 aa  279  6e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2828  cobalamin synthesis protein CobW  49.31 
 
 		 345 aa  278  8e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1467  cobalamin biosynthesis protein CobW  49.31 
 
 		 345 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0356377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0671  cobalamin synthesis CobW protein  47.43 
 
 		 350 aa  269  7e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0786  cobalamin biosynthesis protein CobW  45.59 
 
 		 334 aa  268  8e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0739  cobalamin biosynthesis CobW  45.29 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0782025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09841  putative cobalamin synthesis protein  41.81 
 
 		 344 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.201772 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08161  putative cobalamin synthesis protein  44.05 
 
 		 351 aa  257  3e-67  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.615787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0637  cobalamin (vitamin B12) biosynthesis CobW  44.51 
 
 		 335 aa  250  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1264  putative cobalamin synthesis protein  43.33 
 
 		 371 aa  248  1e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1218  putative cobalamin synthesis protein  40.65 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0184  putative cobalamin synthesis protein  43.75 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16961  putative cobalamin synthesis protein  39.6 
 
 		 381 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08401  putative cobalamin synthesis protein  33.72 
 
 		 354 aa  211  1e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.807692  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08381  putative cobalamin synthesis protein  33.72 
 
 		 354 aa  209  6e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0786  putative cobalamin synthesis protein  34.02 
 
 		 354 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.627356  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  37.05 
 
 		 375 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  37.23 
 
 		 337 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08051  putative cobalamin synthesis protein  33.43 
 
 		 350 aa  184  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  37.01 
 
 		 347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  33.52 
 
 		 323 aa  181  2e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  34.87 
 
 		 323 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  35.14 
 
 		 320 aa  180  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  33.97 
 
 		 394 aa  180  4e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  34.75 
 
 		 335 aa  179  8e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  32.32 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  32.32 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  36.84 
 
 		 329 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  32.02 
 
 		 323 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  36.12 
 
 		 360 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  36 
 
 		 369 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  34.81 
 
 		 343 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  36.55 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  36.55 
 
 		 328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  35.2 
 
 		 346 aa  173  5e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3375  predicted protein  33.81 
 
 		 388 aa  171  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  32.4 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  31.49 
 
 		 316 aa  169  9e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>