More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2167 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2659  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 279 aa  543  1e-154  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.624906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2167  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 261 aa  542  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3144  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  99.62 
 
 		 262 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  79.61 
 
 		 272 aa  436  1e-121  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.676942 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3292  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.41 
 
 		 273 aa  341  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.41 
 
 		 273 aa  341  7e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.830296 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2358  phosphate transporter ATP-binding protein  60.62 
 
 		 273 aa  339  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2807  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  63.01 
 
 		 268 aa  338  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.377161 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3638  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  62.02 
 
 		 267 aa  335  5e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000916154  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2480  phosphate transporter ATP-binding protein  61.38 
 
 		 268 aa  331  7.000000000000001e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2334  phosphate ABC transporter ATPase subunit  62.35 
 
 		 268 aa  331  9e-90  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2214  phosphate ABC transporter ATPase subunit  62.11 
 
 		 304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  normal  0.200846 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0333  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 306 aa  325  6e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4000  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  61.45 
 
 		 265 aa  322  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0289  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60 
 
 		 288 aa  322  6e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  0.242396 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1399  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 		 273 aa  320  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.5206 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1089  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.73 
 
 		 272 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.745288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2808  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.85 
 
 		 265 aa  319  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.325814 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4154  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.24 
 
 		 272 aa  319  3e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.914841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08631  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.48 
 
 		 270 aa  319  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.296362  hitchhiker  0.00137214 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07771  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.53 
 
 		 269 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.71775  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5391  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.24 
 
 		 290 aa  317  2e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08641  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.89 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0586  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  60.08 
 
 		 272 aa  316  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.518906 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0309  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.27 
 
 		 267 aa  315  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.273467  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0729  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.14 
 
 		 269 aa  315  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09821  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.27 
 
 		 267 aa  315  4e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.77001  normal  0.371383 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15211  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 		 272 aa  315  4e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.461543 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3291  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.54 
 
 		 264 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2832  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.54 
 
 		 264 aa  315  7e-85  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.814332 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3540  response regulator receiver protein  58.23 
 
 		 273 aa  314  7e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07771  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  59.14 
 
 		 269 aa  314  7e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.263903  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1902  phosphate ABC transporter permease  53.88 
 
 		 289 aa  313  1.9999999999999998e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.462595  decreased coverage  0.00664679 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0048  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.7 
 
 		 275 aa  312  2.9999999999999996e-84  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.240899  normal  0.357685 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2441  phosphate transporter ATP-binding protein  56.08 
 
 		 264 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.593551  normal  0.0208072 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4262  phosphate transporter ATP-binding protein  59.92 
 
 		 258 aa  303  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0355  phosphate transporter ATP-binding protein  60.32 
 
 		 258 aa  302  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.584479  normal  0.0138641 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0590  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.51 
 
 		 258 aa  300  2e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21550  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.54 
 
 		 253 aa  299  4e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0505  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 		 276 aa  298  7e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.497855 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0661  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  59.04 
 
 		 259 aa  297  1e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.493036  hitchhiker  0.000268199 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48570  phosphate transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 277 aa  296  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1928  phosphate transporter ATP-binding protein  56.42 
 
 		 251 aa  296  2e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333841  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2222  phosphate transporter ATP-binding protein  55.64 
 
 		 264 aa  295  4e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.150141 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3423  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.4 
 
 		 259 aa  295  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4145  phosphate transporter ATP-binding protein  57.09 
 
 		 262 aa  294  8e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0872  phosphate transporter ATP-binding protein  57.25 
 
 		 258 aa  294  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.127902  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0224  phosphate ABC transporter, ATP-binding protein  57.81 
 
 		 259 aa  294  1e-78  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4148  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.3 
 
 		 286 aa  294  1e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0621  phosphate transporter ATP-binding protein  52.49 
 
 		 261 aa  293  1e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0365  phosphate transporter ATP-binding protein  56.64 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4003  phosphate transporter ATP-binding protein  56.69 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0491  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.73 
 
 		 345 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1790  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  54.55 
 
 		 297 aa  293  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.530432  decreased coverage  0.00975681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0205  phosphate transporter ATP-binding protein  56.25 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2079  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.4 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4260  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.83 
 
 		 259 aa  293  2e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4651  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.57 
 
 		 259 aa  292  3e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0821  phosphate ABC transporter permease  57.09 
 
 		 286 aa  292  4e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4119  phosphate transporter ATP-binding protein  56.69 
 
 		 262 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0421  phosphate transporter ATP-binding protein  55.04 
 
 		 260 aa  290  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0744  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56 
 
 		 254 aa  290  2e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000121752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2890  phosphate transporter ATP-binding protein  55.28 
 
 		 252 aa  290  2e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0597569 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8263  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.66 
 
 		 258 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2267  phosphate transporter ATP-binding protein  56.5 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1781  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 258 aa  289  4e-77  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8334  phosphate ABC transporter permease  58.3 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1069  phosphate transporter ATp-binding protein  55.47 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37650  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  58.4 
 
 		 259 aa  288  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0806666 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1963  phosphate transporter ATP-binding protein  55.47 
 
 		 253 aa  288  7e-77  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4495  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  54.12 
 
 		 301 aa  288  7e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.583494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0354  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  55.87 
 
 		 301 aa  288  8e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0142036  normal  0.246241 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31840  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  56 
 
 		 259 aa  287  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4978  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.86 
 
 		 259 aa  286  2e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1236  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  57.26 
 
 		 286 aa  286  2.9999999999999996e-76  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.534632  normal  0.227488 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  55.65 
 
 		 265 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2601  phosphate transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1259  phosphate transporter ATP-binding protein  54.75 
 
 		 265 aa  285  4e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1602  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 		 249 aa  285  4e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00468848  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5326  phosphate transporter ATP-binding protein  54.79 
 
 		 281 aa  285  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal  0.0105558 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1929  phosphate transporter ATP-binding protein  56.1 
 
 		 305 aa  285  5e-76  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0381146  normal  0.0357892 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2831  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  54.03 
 
 		 252 aa  285  5e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4149  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56.45 
 
 		 267 aa  285  5e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.754485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1826  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.61 
 
 		 275 aa  285  5e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.646209  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5234  phosphate transporter ATP-binding protein  54.79 
 
 		 277 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.634569  normal  0.16068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0881  phosphate transporter ATP-binding protein  56.91 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0092  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  57.09 
 
 		 255 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5373  phosphate transporter ATP-binding protein  54.79 
 
 		 277 aa  284  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2279  phosphate transporter ATP-binding protein  53.46 
 
 		 275 aa  284  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0589752  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1992  phosphate transporter ATP-binding protein  55.06 
 
 		 249 aa  283  1.0000000000000001e-75  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0709  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  56.28 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0954  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  54.79 
 
 		 276 aa  283  2.0000000000000002e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.222469  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3540  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  58.04 
 
 		 258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.702552  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0572  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.88 
 
 		 251 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2361  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  55.06 
 
 		 295 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.461445  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2743  phosphate ABC transporter permease  55.42 
 
 		 259 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00299446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2936  phosphate ABC transporter ATPase subunit  57.89 
 
 		 258 aa  282  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1483  phosphate ABC transporter, ATPase subunit  53.52 
 
 		 249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00537874  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1569  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  53.52 
 
 		 251 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0638  phosphate transporter ATP-binding protein  53.28 
 
 		 272 aa  282  4.0000000000000003e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>