43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2121 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_2121  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.492075  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2618  hypothetical protein  96.98 
 
 		 265 aa  498  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.890059  normal  0.147502 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3230  hypothetical protein  83.02 
 
 		 265 aa  444  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4079  hypothetical protein  74.23 
 
 		 265 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.185425  hitchhiker  0.000116946 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0025  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 158 aa  84  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.567085  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0051  hypothetical protein  34.26 
 
 		 190 aa  77.8  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2523  hypothetical protein  35.85 
 
 		 176 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.365008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1202  hypothetical protein  30.77 
 
 		 163 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3249  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  35.14 
 
 		 173 aa  72.8  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2801  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  34.26 
 
 		 178 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1076  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  34.23 
 
 		 174 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.556943  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3727  hypothetical protein  35.4 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.161314  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0318  type VI secretion lipoprotein, family  27.27 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0341521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0306  type VI secretion lipoprotein  27.27 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.157499  normal  0.0453584 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0301  SciN protein  27.27 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.589759 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0312  type VI secretion lipoprotein, family  27.27 
 
 		 163 aa  55.5  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.544183 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00960  putative lipoprotein  30.23 
 
 		 154 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0194597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0151  putative lipoprotein  30.77 
 
 		 154 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2487  hypothetical protein  35.29 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2585  hypothetical protein  35.29 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.788173  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2995  hypothetical protein  35.29 
 
 		 193 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000478166 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0240  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  28.23 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2808  hypothetical protein  31.43 
 
 		 154 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000258047  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1676  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  23.33 
 
 		 172 aa  50.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.973088  hitchhiker  0.0062275 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2997  putative lipoprotein  30.95 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0234  type VI secretion lipoprotein  25.5 
 
 		 174 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0232  type VI secretion lipoprotein  28.23 
 
 		 174 aa  49.7  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1105  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  25 
 
 		 177 aa  49.7  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0983  hypothetical protein  32.56 
 
 		 167 aa  49.3  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1224  type VI secretion lipoprotein family protein  25 
 
 		 177 aa  48.9  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.804985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3025  putative lipoprotein  31.07 
 
 		 180 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6676  putative lipoprotein  30.48 
 
 		 179 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.915611  normal  0.974139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0802  hypothetical protein  34.12 
 
 		 193 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3910  hypothetical protein  31.4 
 
 		 167 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.374434  normal  0.782471 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1116  putative type VI secretion protein VasD  28.16 
 
 		 162 aa  46.6  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1802  hypothetical protein  29.07 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.56234  normal  0.0484163 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1595  hypothetical protein  29.79 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.204412  normal  0.501762 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4054  hypothetical protein  27.5 
 
 		 197 aa  43.9  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000378046 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2467  type VI secretion lipoprotein, VC_A0113 family  24.42 
 
 		 164 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0124  putative lipoprotein  27.06 
 
 		 180 aa  43.5  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2319  hypothetical protein  23.08 
 
 		 155 aa  43.1  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00471412  hitchhiker  0.00131937 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3477  hypothetical protein  31.4 
 
 		 168 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.95967 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2376  hypothetical protein  26.14 
 
 		 156 aa  42  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>