295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2011 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_2011  alkylhydroperoxidase  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.500681 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2151  alkylhydroperoxidase  94.48 
 
 
145 aa  286  8e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0187774 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03490  hypothetical protein  68.06 
 
 
145 aa  209  9e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000374468 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0347  hypothetical protein  67.36 
 
 
145 aa  205  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1084  alkylhydroperoxidase  67.63 
 
 
143 aa  204  3e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.359651 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1207  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.48 
 
 
145 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1683  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  55.17 
 
 
145 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1601  transposase  55.17 
 
 
149 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.349385  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1806  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.03 
 
 
145 aa  171  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2244  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.72 
 
 
145 aa  169  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0194  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  54.48 
 
 
145 aa  169  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.401663  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4060  alkylhydroperoxidase  51.03 
 
 
145 aa  167  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.756303  normal  0.576923 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4317  alkylhydroperoxidase AhpD  52.41 
 
 
145 aa  167  4e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1427  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.41 
 
 
145 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0475888 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3128  alkylhydroperoxidase AhpD core  55 
 
 
163 aa  164  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0304479  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3612  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.72 
 
 
145 aa  163  9e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1010  alkylhydroperoxidase AhpD core  52.11 
 
 
153 aa  161  2.0000000000000002e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3290  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.03 
 
 
145 aa  159  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3795  alkylhydroperoxidase AhpD core  50 
 
 
146 aa  158  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.154447  normal  0.354415 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3146  alkylhydroperoxidase  51.03 
 
 
157 aa  158  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0155  alkylhydroperoxidase  50.69 
 
 
153 aa  157  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.804329 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4325  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
145 aa  157  5e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.964091  normal  0.208181 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3236  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.86 
 
 
163 aa  156  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.210156  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0199  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  50 
 
 
153 aa  155  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.149358  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3323  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.14 
 
 
163 aa  155  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.320145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3693  alkylhydroperoxidase  47.92 
 
 
145 aa  155  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.333462  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0229  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  49.29 
 
 
153 aa  154  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4101  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.61 
 
 
145 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.460004  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4265  alkylhydroperoxidase  48.61 
 
 
145 aa  154  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168811  normal  0.30488 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3252  alkylhydroperoxidase  49.31 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.654537  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4166  alkylhydroperoxidase  47.92 
 
 
145 aa  154  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.162158  normal  0.748231 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3729  alkylhydroperoxidase  47.59 
 
 
162 aa  152  1e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.99808  normal  0.831943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1741  alkylhydroperoxidase AhpD core  47.92 
 
 
145 aa  152  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.123703  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3703  alkylhydroperoxidase-like protein, AhpD family  53.79 
 
 
154 aa  151  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.56916  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3201  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.14 
 
 
146 aa  151  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601606  hitchhiker  0.00337027 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3401  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  53.79 
 
 
154 aa  150  4e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900617  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3277  alkylhydroperoxidase AhpD core  49.29 
 
 
152 aa  149  8.999999999999999e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.880683  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1807  alkylhydroperoxidase  53.17 
 
 
155 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.361434  normal  0.468066 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0152  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.57 
 
 
153 aa  147  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2786  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
159 aa  147  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5396  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.07 
 
 
159 aa  146  9e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.598481  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5162  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.55 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.434991  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2344  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1306  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  52.38 
 
 
155 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2772  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.262116  normal  0.36621 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5258  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.14 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5601  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 
159 aa  144  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.432022 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4627  alkylhydroperoxidase  44.14 
 
 
159 aa  144  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000476695 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2516  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.76 
 
 
159 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.612062  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5435  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
159 aa  141  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0133  alkylhydroperoxidase  49.24 
 
 
159 aa  141  4e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3133  alkylhydroperoxidase  49.3 
 
 
158 aa  140  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.785317 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2121  alkylhydroperoxidase AhpD  47.52 
 
 
158 aa  140  6e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.930524  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2014  alkylhydroperoxidase AhpD family core domain protein  47.26 
 
 
159 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1680  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  47.26 
 
 
159 aa  140  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.581321  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0093  alkylhydroperoxidase AhpD core  41.38 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5577  alkylhydroperoxidase  40.69 
 
 
159 aa  137  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5794  alkylhydroperoxidase  40.69 
 
 
159 aa  137  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.336634  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2419  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  40.69 
 
 
159 aa  138  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.797852 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2658  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  46.58 
 
 
151 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764156  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6640  alkylhydroperoxidase  42.07 
 
 
159 aa  137  7e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000966542  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2921  alkylhydroperoxidase AhpD core  46.85 
 
 
152 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.633794  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2657  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.61 
 
 
149 aa  135  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0722342  normal  0.0242397 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2269  alkylhydroperoxidase  48.48 
 
 
157 aa  134  5e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.608052  normal  0.394393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3108  alkylhydroperoxidase  42.76 
 
 
159 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.248752  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0201  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  48.23 
 
 
150 aa  133  8e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0606  putative redox protein  47.73 
 
 
157 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2923  alkylhydroperoxidase AhpD core  44.2 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2053  alkylhydroperoxidase  42.66 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.375991  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4773  alkylhydroperoxidase  50 
 
 
157 aa  131  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.792481  normal  0.557734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2237  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  45.39 
 
 
151 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.887416  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2061  alkylhydroperoxidase AhpD core  48.48 
 
 
151 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.320291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7113  hypothetical protein  50 
 
 
154 aa  130  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5468  alkylhydroperoxidase AhpD core  51.52 
 
 
156 aa  130  6.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5230  alkylhydroperoxidase  44.68 
 
 
150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2370  alkylhydroperoxidase  43.38 
 
 
146 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0155625  normal  0.106915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5297  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.57 
 
 
155 aa  128  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157672  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1746  alkylhydroperoxidase  37.59 
 
 
147 aa  128  2.0000000000000002e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0138346  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4069  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.52 
 
 
165 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3956  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  51.52 
 
 
165 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.405644  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2411  alkylhydroperoxidase  36.17 
 
 
147 aa  127  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000858188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8728  alkylhydroperoxidase  52.76 
 
 
152 aa  127  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3720  alkylhydroperoxidase  40 
 
 
143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1215  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  43.36 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4099  alkylhydroperoxidase  47.18 
 
 
157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751182  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4737  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  42.25 
 
 
152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223994  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3843  putative peroxidase  47.18 
 
 
167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1998  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  38.19 
 
 
159 aa  125  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0498  alkylhydroperoxidase  38.89 
 
 
159 aa  124  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.22674 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0013  alkylhydroperoxidase  48.12 
 
 
158 aa  124  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1929  alkylhydroperoxidase  42.54 
 
 
149 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1874  alkylhydroperoxidase  42.54 
 
 
149 aa  124  5e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3916  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  44.7 
 
 
143 aa  124  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0761488 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3196  alkylhydroperoxidase  42.18 
 
 
167 aa  123  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2747  alkylhydroperoxidase  43.26 
 
 
151 aa  124  6e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.201344  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2104  alkylhydroperoxidase  42.54 
 
 
149 aa  123  7e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2794  carboxymuconolactone decarboxylase family protein  43.94 
 
 
143 aa  123  8.000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0548302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0021  alkylhydroperoxidase  50.85 
 
 
158 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.106747  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3517  alkylhydroperoxidase like protein, AhpD family  41.91 
 
 
143 aa  122  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0791  alkylhydroperoxidase  43.48 
 
 
167 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>