77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1912 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  100 
 
 
288 aa  590  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  97.88 
 
 
236 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  91.95 
 
 
236 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  85.17 
 
 
236 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  66.95 
 
 
236 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  66.1 
 
 
232 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  61.86 
 
 
236 aa  317  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  61.86 
 
 
236 aa  309  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  58.9 
 
 
236 aa  295  4e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  58.47 
 
 
236 aa  292  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  54.47 
 
 
238 aa  255  7e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
236 aa  150  3e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  38.08 
 
 
230 aa  139  4.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  32.74 
 
 
234 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.87 
 
 
224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 
236 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  37.45 
 
 
224 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  37.33 
 
 
224 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  33.48 
 
 
235 aa  123  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  36.6 
 
 
224 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  36.86 
 
 
236 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  35.22 
 
 
234 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  33.47 
 
 
229 aa  115  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  35.66 
 
 
223 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  33.9 
 
 
244 aa  114  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
223 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  33.93 
 
 
223 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  33.2 
 
 
222 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  33.78 
 
 
222 aa  112  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  33.05 
 
 
224 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  32.14 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  37 
 
 
225 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.76 
 
 
224 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  36.8 
 
 
224 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  32.91 
 
 
224 aa  107  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  36.8 
 
 
224 aa  107  3e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 
229 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 
229 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 
229 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 
229 aa  103  3e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 
224 aa  103  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  32.64 
 
 
220 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 
229 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 
229 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 
229 aa  103  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  32.48 
 
 
229 aa  103  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  32.17 
 
 
222 aa  101  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  29.24 
 
 
244 aa  101  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  30.99 
 
 
224 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  29.64 
 
 
271 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  29.11 
 
 
250 aa  100  2e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  32.66 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  30.32 
 
 
224 aa  97.8  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  36.05 
 
 
211 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  28.51 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  27.73 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  26.29 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  27.11 
 
 
203 aa  50.8  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  27.75 
 
 
211 aa  50.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5604  phosphoglycerate mutase  28 
 
 
202 aa  50.4  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.335394  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
203 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
203 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  27.23 
 
 
203 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  26.53 
 
 
223 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0245  phosphoglycerate mutase  25.69 
 
 
220 aa  46.2  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.044549 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  25.11 
 
 
209 aa  45.8  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2067  phosphoglyceromutase  37.78 
 
 
208 aa  45.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.91358  hitchhiker  0.00883059 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  40 
 
 
220 aa  45.4  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0444  phosphoglyceromutase  37.78 
 
 
208 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.114535  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  26.12 
 
 
223 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  43.06 
 
 
214 aa  43.9  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0619  phosphoglycerate mutase family protein  28.64 
 
 
224 aa  43.9  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4126  phosphoglyceromutase  26.09 
 
 
211 aa  43.5  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  26.07 
 
 
211 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2062  phosphoglycerate mutase  28.05 
 
 
229 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.792733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4440  phosphoglyceromutase  34.78 
 
 
211 aa  42.4  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.846173 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>