More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1848 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1848  major facilitator transporter  100 
 
 
447 aa  896    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0276958 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0374  major facilitator transporter  38.46 
 
 
433 aa  317  2e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1587  major facilitator transporter  41 
 
 
450 aa  317  4e-85  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.891359  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2798  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  39.34 
 
 
437 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.606232  normal  0.0553764 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5329  major facilitator superfamily MFS_1  38.26 
 
 
440 aa  309  5.9999999999999995e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7815  major facilitator superfamily MFS_1  38.41 
 
 
442 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3577  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  37.21 
 
 
437 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1111  General substrate transporter  39.27 
 
 
460 aa  301  2e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2344  major facilitator transporter  39.42 
 
 
461 aa  300  3e-80  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4431  putative transmembrane transport protein (general substrate transporter)  36.77 
 
 
468 aa  300  3e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.90441  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0243  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  38.15 
 
 
437 aa  298  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.292556  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5743  major facilitator superfamily MFS_1  40.68 
 
 
461 aa  296  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0804971  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2032  major facilitator transporter  36.73 
 
 
439 aa  293  3e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.450728  normal  0.16892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10040  nitrate/nitrite transporter  37.06 
 
 
439 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4318  major facilitator transporter  36.96 
 
 
439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3477  major facilitator transporter  36.96 
 
 
439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0160202 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4048  major facilitator transporter  36.96 
 
 
439 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0869813  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4541  major facilitator transporter  37.68 
 
 
439 aa  293  5e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.474963  normal  0.714624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3950  major facilitator transporter  36.96 
 
 
439 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.728189 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3917  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 
446 aa  291  2e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.981496  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3443  major facilitator transporter  36.73 
 
 
439 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0269111 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4973  major facilitator transporter  38.82 
 
 
425 aa  289  5.0000000000000004e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0076  major facilitator transporter  40.19 
 
 
450 aa  289  6e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2499  major facilitator superfamily MFS_1  39.53 
 
 
454 aa  286  4e-76  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2955  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 
431 aa  286  5e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1075  major facilitator transporter  40.14 
 
 
439 aa  286  5e-76  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2307  major facilitator superfamily transporter metabolite/H(+) symporter  37.38 
 
 
452 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3998  General substrate transporter  42.17 
 
 
430 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0925  major facilitator transporter  36.57 
 
 
439 aa  285  8e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.291991  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6110  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 
452 aa  285  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.92916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33020  arabinose efflux permease family protein  37.79 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.471979  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2487  major facilitator transporter  39.16 
 
 
445 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911409  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4172  major facilitator transporter  35.84 
 
 
439 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2735  general substrate transporter  36.41 
 
 
443 aa  282  7.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.453447  normal  0.0434107 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5078  major facilitator transporter  38.9 
 
 
444 aa  282  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4702  general substrate transporter  35.36 
 
 
461 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.57172  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4788  general substrate transporter  35.36 
 
 
461 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5087  general substrate transporter  35.36 
 
 
461 aa  282  9e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.829473 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5496  major facilitator transporter  36.51 
 
 
435 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.499469  normal  0.463125 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3580  major facilitator transporter  36.51 
 
 
435 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4735  major facilitator transporter  40.19 
 
 
445 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110403  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4694  major facilitator transporter  35.62 
 
 
439 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3892  major facilitator transporter  40.19 
 
 
445 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.50239  normal  0.071614 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3628  major facilitator transporter  40.19 
 
 
445 aa  282  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.804515 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4787  major facilitator transporter  36.51 
 
 
435 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.991397  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4107  General substrate transporter  38.99 
 
 
447 aa  281  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1278  citrate-proton symport  38.41 
 
 
456 aa  280  3e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258621  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0338  major facilitator family transporter  39.95 
 
 
433 aa  280  5e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0662361  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0015  major facilitator superfamily MFS_1  36.95 
 
 
456 aa  280  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.170297  normal  0.0989418 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5364  major facilitator transporter  39.24 
 
 
460 aa  279  8e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.556999 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1015  general substrate transporter  37.82 
 
 
438 aa  279  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.383043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2159  major facilitator superfamily MFS_1  38.13 
 
 
438 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5300  major facilitator superfamily transporter  34.32 
 
 
456 aa  278  1e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.363353 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3534  major facilitator transporter  39.01 
 
 
460 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.554978  normal  0.678492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4524  major facilitator transporter  35.92 
 
 
439 aa  277  3e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.063118  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1708  General substrate transporter  35.65 
 
 
430 aa  276  4e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2036  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  41.08 
 
 
433 aa  276  4e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.70971  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2103  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.46 
 
 
438 aa  276  5e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2608  major facilitator superfamily protein  38.79 
 
 
441 aa  276  7e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495276 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6090  major facilitator transporter  38.19 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.791826  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0772  General substrate transporter  33.48 
 
 
450 aa  275  1.0000000000000001e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5928  major facilitator transporter  39.06 
 
 
442 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0996299  normal  0.185357 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20210  arabinose efflux permease family protein  35.78 
 
 
452 aa  275  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.272116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15920  major facilitator transporter  40.16 
 
 
437 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.246808 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4273  shikimate transporter  37.14 
 
 
435 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.156206 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2710  major facilitator superfamily MFS_1  42.39 
 
 
420 aa  273  3e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.703478 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3805  shikimate transporter  37.14 
 
 
435 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.424485  normal  0.688015 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2487  major facilitator transporter  42.39 
 
 
420 aa  273  3e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1471  general substrate transporter  35.07 
 
 
447 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.360609  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3813  major facilitator transporter  37.93 
 
 
439 aa  273  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000493152 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0851  general substrate transporter  37.7 
 
 
437 aa  273  6e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.80283  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2079  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  39.63 
 
 
436 aa  272  7e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611047  hitchhiker  0.0017507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1437  major facilitator superfamily MFS_1  38.21 
 
 
437 aa  273  7e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11224  integral membrane transport protein  36.83 
 
 
425 aa  272  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000679327  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0863  general substrate transporter  37.7 
 
 
437 aa  272  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.139167  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1469  major facilitator family transporter  37.19 
 
 
438 aa  272  1e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0457955  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5987  major facilitator transporter  34.35 
 
 
458 aa  271  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.0025736  normal  0.0488638 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5065  major facilitator transporter  38.35 
 
 
445 aa  272  1e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0348973  normal  0.262199 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2415  major facilitator superfamily MFS_1  41.37 
 
 
420 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.510425  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6108  major facilitator transporter  34.95 
 
 
459 aa  271  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.164916  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5961  shikimate transporter  35.77 
 
 
434 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3901  general substrate transporter  37.5 
 
 
433 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4723  major facilitator superfamily MFS_1  39.07 
 
 
465 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238752  normal  0.508287 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5869  major facilitator transporter  34.95 
 
 
459 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.179605  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4531  general substrate transporter  37.64 
 
 
456 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1319  general substrate transporter  35.08 
 
 
484 aa  270  5e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2302  General substrate transporter  35.78 
 
 
444 aa  270  5e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000263865 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1458  metabolite-proton symporter  38.88 
 
 
432 aa  269  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.202966  normal  0.170493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4745  major facilitator superfamily metabolite/H(+) symporter  38.39 
 
 
440 aa  269  5.9999999999999995e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5098  putative MFS superfamily transport protein  33.96 
 
 
459 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.393625 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1913  General substrate transporter  37.73 
 
 
463 aa  269  8e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.168957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3302  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  38.79 
 
 
444 aa  269  8.999999999999999e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3881  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  40.59 
 
 
440 aa  269  8.999999999999999e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.148005  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3816  MFS transporter, metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  40.59 
 
 
440 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0860  metabolite/H+ symporter, major facilitator superfamily (MFS)  37.05 
 
 
441 aa  268  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3984  MFS transporter metabolite:H+ symporter family protein  40.59 
 
 
440 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.139706 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3803  MFS transporter metabolite:H+ symporter (MHS) family protein  40.59 
 
 
440 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3925  MFS transporter/metabolite:H+ symporter family protein  40.59 
 
 
440 aa  268  1e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3004  major facilitator transporter  38.52 
 
 
437 aa  269  1e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0512  general substrate transporter  37.24 
 
 
483 aa  268  2e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.509539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>