49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1773 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1773  putative prophage repressor  100 
 
 		 224 aa  461  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000495428  hitchhiker  0.00108243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4068  Cro/CI family transcriptional regulator  92.41 
 
 		 234 aa  420  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0144241  unclonable  0.00000065299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1808  XRE family transcriptional regulator  76.79 
 
 		 235 aa  343  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.630846  normal  0.212121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1772  putative prophage repressor  47.79 
 
 		 217 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000601077  decreased coverage  0.000377038 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3666  XRE family transcriptional regulator  48.67 
 
 		 217 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100264  decreased coverage  0.0000000000010366 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  45.85 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  41.28 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  41.28 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  35.59 
 
 		 221 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  35 
 
 		 231 aa  121  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  33.49 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  33.49 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  44.27 
 
 		 216 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  34.11 
 
 		 218 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  44.27 
 
 		 217 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  43.51 
 
 		 133 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  30.84 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  30.84 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  29.91 
 
 		 216 aa  91.7  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  28.97 
 
 		 237 aa  89  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 240 aa  87  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  29.82 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  29.82 
 
 		 240 aa  85.9  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  28.77 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 228 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  27.44 
 
 		 216 aa  77.4  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 229 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  26.19 
 
 		 207 aa  67  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  25.76 
 
 		 220 aa  64.3  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  28.24 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  28.5 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2211  putative repressor protein encoded within prophage CP-933O  24.17 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000372098  hitchhiker  7.21375e-19 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  23.18 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  30.83 
 
 		 243 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  35.42 
 
 		 243 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  24.57 
 
 		 221 aa  51.6  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1406  repressor protein  42.59 
 
 		 211 aa  51.6  0.000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0402463  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0322  helix-turn-helix/peptidase S24-like domain-containing protein  24.78 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.274392  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  23.19 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  39.06 
 
 		 225 aa  45.4  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2539  peptidase S24/S26 domain-containing protein  27.89 
 
 		 149 aa  45.1  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692907 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  23.89 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14260  Helix-turn-helix protein  36.54 
 
 		 291 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  40.3 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  26.17 
 
 		 238 aa  43.1  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>