108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1605 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1605  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.100156  normal  0.0122342 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3828  hypothetical protein  94.44 
 
 		 227 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4263  hypothetical protein  97.98 
 
 		 227 aa  318  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.88561  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1814  hypothetical protein  86.87 
 
 		 227 aa  305  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44460  hypothetical protein  85.35 
 
 		 227 aa  303  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0118688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3785  hypothetical protein  83.84 
 
 		 227 aa  300  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0684997  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2612  hypothetical protein  83.84 
 
 		 227 aa  298  2e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.471108  normal  0.594742 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3581  hypothetical protein  94.44 
 
 		 227 aa  291  4e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1994  hypothetical protein  82.32 
 
 		 227 aa  287  7e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31903  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3422  hypothetical protein  81.31 
 
 		 249 aa  283  8e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.6315  normal  0.0560665 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19930  hypothetical protein  81.82 
 
 		 289 aa  272  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0282  hypothetical protein  51.55 
 
 		 232 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2163  hypothetical protein  44.62 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.434143  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2213  hypothetical protein  44.62 
 
 		 230 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.113796  normal  0.262784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2414  hypothetical protein  49.22 
 
 		 279 aa  159  2e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2221  hypothetical protein  44.1 
 
 		 235 aa  159  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000192671  normal  0.249817 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4494  hypothetical protein  44.62 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2208  hypothetical protein  44.62 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0224679  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2418  hypothetical protein  46.28 
 
 		 230 aa  158  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0165025  decreased coverage  0.000000160717 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2357  hypothetical protein  43.59 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2013  hypothetical protein  43.59 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000381426 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1962  hypothetical protein  43.59 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00784562 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2114  hypothetical protein  43.59 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.141432  normal  0.255263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1952  hypothetical protein  42.56 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2218  hypothetical protein  43.59 
 
 		 230 aa  155  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1792  hypothetical protein  50.54 
 
 		 229 aa  152  4e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2017  hypothetical protein  41.24 
 
 		 229 aa  149  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1992  hypothetical protein  42.56 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0778906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2221  hypothetical protein  42.05 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.157963  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1844  hypothetical protein  46.89 
 
 		 230 aa  148  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.106534  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1798  hypothetical protein  46.94 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.442592  normal  0.18393 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2482  hypothetical protein  47.12 
 
 		 221 aa  142  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2923  hypothetical protein  54.71 
 
 		 225 aa  142  2e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.226057  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1988  hypothetical protein  43.72 
 
 		 249 aa  142  3e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1310  hypothetical protein  42.5 
 
 		 235 aa  140  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2424  hypothetical protein  47.51 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0203  hypothetical protein  41.05 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0932  hypothetical protein  38.95 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.748857  normal  0.699875 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1570  membrane protein  41.21 
 
 		 224 aa  129  4.0000000000000003e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.403322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2066  integral membrane protein  38.95 
 
 		 220 aa  125  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1049  hypothetical protein  51.55 
 
 		 223 aa  124  7e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0252  hypothetical protein  45.98 
 
 		 223 aa  124  9e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0538  hypothetical protein  37.7 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003474  membrane protein  43.75 
 
 		 225 aa  122  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.551919  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02296  hypothetical protein  38.95 
 
 		 225 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0675  hypothetical protein  40.86 
 
 		 226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1095  hypothetical protein  37.71 
 
 		 186 aa  118  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.598703  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1290  hypothetical protein  42.13 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1046  hypothetical protein  39.89 
 
 		 224 aa  117  9.999999999999999e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.165842  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0727  hypothetical protein  42.02 
 
 		 249 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.227366  normal  0.944442 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02062  integral membrane protein  38.86 
 
 		 219 aa  109  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.157996  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1290  hypothetical protein  34.92 
 
 		 274 aa  107  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0771  hypothetical protein  36.67 
 
 		 344 aa  100  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000418366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1473  hypothetical protein  36.41 
 
 		 273 aa  98.2  6e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.068517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0945  hypothetical protein  38.12 
 
 		 272 aa  95.5  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1158  hypothetical protein  34.72 
 
 		 236 aa  77.8  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.115759  normal  0.102701 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1922  hypothetical protein  33.73 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0373  hypothetical protein  28.19 
 
 		 220 aa  73.6  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2119  heavy metal transport/detoxification protein  29.26 
 
 		 621 aa  72  0.000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0850  hypothetical protein  31.36 
 
 		 211 aa  70.9  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1245  hypothetical protein  29.84 
 
 		 228 aa  69.7  0.00000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1236  hypothetical protein  40.62 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1338  hypothetical protein  40.62 
 
 		 223 aa  70.1  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0375  hypothetical protein  24.86 
 
 		 221 aa  66.6  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.767045  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1176  hypothetical protein  40.1 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.526094  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5319  hypothetical protein  35.23 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1112  putative transmembrane protein  36.46 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.75356  normal  0.859222 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2541  hypothetical protein  27.1 
 
 		 233 aa  62  0.000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.832454  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1371  hypothetical protein  32.09 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.538624  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1485  hypothetical protein  26.55 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1205  hypothetical protein  42.34 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1143  hypothetical protein  29.05 
 
 		 226 aa  58.5  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00632883  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1666  hypothetical protein  25.99 
 
 		 219 aa  58.5  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.809334  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0461  putative transmembrane protein  36.91 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2297  ferric reductase domain-containing protein protein transmembrane component domain-containing protein  40 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0238  hypothetical protein  34.72 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.563587 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2036  hypothetical protein  32.39 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.424115 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1815  hypothetical protein  31.94 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.42452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2083  hypothetical protein  29.84 
 
 		 225 aa  57  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.000000109984  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0185  hypothetical protein  25.56 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000266535  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0467  hypothetical protein  29.44 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0792  hypothetical protein  34.55 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1841  hypothetical protein  25.99 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1229  hypothetical protein  36.63 
 
 		 219 aa  53.9  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1191  Ferric reductase domain protein transmembrane component domain protein  41.77 
 
 		 409 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.330139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1284  hypothetical protein  45 
 
 		 248 aa  53.5  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0623013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1574  hypothetical protein  29.19 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3048  hypothetical protein  36.05 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0686  hypothetical protein  30.18 
 
 		 238 aa  52.4  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0800  hypothetical protein  32.93 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.181094  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1224  hypothetical protein  38.07 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.042848  normal  0.766858 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0899  hypothetical protein  29.79 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0576  hypothetical protein  38.46 
 
 		 279 aa  49.7  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0856861  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1849  heavy metal transport/detoxification protein  26.35 
 
 		 499 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0400  hypothetical protein  28.92 
 
 		 297 aa  49.3  0.00004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.686075  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1959  hypothetical protein  37.5 
 
 		 423 aa  48.5  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178526  normal  0.959874 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1355  putative transmembrane protein  33.33 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550104 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1160  hypothetical protein  37.14 
 
 		 197 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2489  integral membrane protein  23.4 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0864666 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0745  Heavy metal transport/detoxification protein  25.88 
 
 		 471 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000126874  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>