More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1563 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_1563  major facilitator transporter  100 
 
 		 503 aa  975    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0965366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4603  major facilitator superfamily MFS_1  50.81 
 
 		 500 aa  442  1e-123  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4282  major facilitator superfamily MFS_1  49.9 
 
 		 500 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1883  major facilitator transporter  50.41 
 
 		 495 aa  429  1e-119  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.701897  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3575  major facilitator transporter  54.41 
 
 		 514 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211947  normal  0.0378977 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3794  major facilitator superfamily permease  48.47 
 
 		 500 aa  409  1e-113  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2687  major facilitator transporter  50.85 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471726 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4109  MFS family transporter  49.25 
 
 		 501 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.573233  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47640  major facilitator transporter  50.53 
 
 		 501 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.899355 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1066  major facilitator superfamily MFS_1  46.22 
 
 		 496 aa  313  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13740  arabinose efflux permease family protein  45.58 
 
 		 501 aa  310  4e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.138936 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2158  major facilitator superfamily transporter  44.01 
 
 		 513 aa  306  6e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.139146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1274  major facilitator superfamily MFS_1  41.95 
 
 		 517 aa  301  1e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.131373  normal  0.0158431 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0717  major facilitator superfamily transporter  44.67 
 
 		 510 aa  296  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2361  major facilitator transporter  44.79 
 
 		 594 aa  296  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.213022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3406  major facilitator superfamily MFS_1  39.55 
 
 		 528 aa  296  7e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0194  major facilitator superfamily MFS_1  40 
 
 		 523 aa  294  3e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2114  major facilitator superfamily MFS_1  46.32 
 
 		 501 aa  293  5e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0483  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 525 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0494  major facilitator superfamily transporter  41.1 
 
 		 525 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.55158 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0472  major facilitator transporter  41.1 
 
 		 525 aa  290  4e-77  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.931968 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0241  major facilitator transporter  40.63 
 
 		 533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0051  major facilitator superfamily MFS_1  37.5 
 
 		 509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.241038  normal  0.50529 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7102  major facilitator superfamily transporter  47 
 
 		 517 aa  283  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0492657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2153  major facilitator superfamily MFS_1  45.21 
 
 		 510 aa  283  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2822  major facilitator superfamily MFS_1  42.83 
 
 		 513 aa  279  9e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00189788  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1948  major facilitator superfamily MFS_1  38.66 
 
 		 524 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.621717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0336  major facilitator superfamily MFS_1  40.32 
 
 		 517 aa  278  2e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.145673 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0664  major facilitator superfamily transporter  40.39 
 
 		 535 aa  277  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.490506 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1768  methyl viologen resistance protein SmvA  40.56 
 
 		 495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.556502  normal  0.813756 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1689  methyl viologen resistance protein SmvA  40.56 
 
 		 495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.815414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1587  methyl viologen resistance protein SmvA  40.56 
 
 		 495 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1752  methyl viologen resistance protein SmvA  40.56 
 
 		 495 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1691  methyl viologen resistance protein SmvA  40.56 
 
 		 495 aa  274  3e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.294572  normal  0.850748 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1113  major facilitator superfamily MFS_1  39.95 
 
 		 588 aa  273  7e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2113  major facilitator transporter  37.03 
 
 		 509 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.117023  decreased coverage  0.00370364 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2454  major facilitator superfamily MFS_1  37.21 
 
 		 490 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  38.93 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0831  major facilitator transporter  38.95 
 
 		 526 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2059  major facilitator transporter  38.28 
 
 		 494 aa  265  1e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0762  major facilitator transporter  38.4 
 
 		 532 aa  265  2e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.710581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5781  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 513 aa  264  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.932684  normal  0.0949599 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0537  major facilitator superfamily MFS_1  40.22 
 
 		 524 aa  264  3e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1243  major facilitator superfamily MFS_1  35.57 
 
 		 518 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6311  major facilitator superfamily MFS_1  38.01 
 
 		 516 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.836988  normal  0.161919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0024  major facilitator superfamily MFS_1  36.83 
 
 		 541 aa  259  7e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1369  major facilitator superfamily MFS_1  38.84 
 
 		 521 aa  259  8e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.845322  normal  0.437127 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0078  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 536 aa  259  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0195486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0438  major facilitator superfamily MFS_1  35.94 
 
 		 516 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2404  major facilitator superfamily protein  46.03 
 
 		 528 aa  256  5e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2010  major facilitator superfamily MFS_1  38.72 
 
 		 521 aa  255  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00308521  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2478  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  40.63 
 
 		 537 aa  255  2.0000000000000002e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2639  major facilitator superfamily MFS_1  36.46 
 
 		 529 aa  252  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.733811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37460  arabinose efflux permease family protein  38.97 
 
 		 554 aa  251  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0616549  normal  0.720711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3881  major facilitator superfamily MFS_1  38.36 
 
 		 513 aa  251  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4792  major facilitator superfamily MFS_1  36.1 
 
 		 562 aa  249  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2765  major facilitator transporter  37.65 
 
 		 584 aa  249  9e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564346  hitchhiker  0.0051414 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2718  major facilitator transporter  36.77 
 
 		 528 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.571064  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2463  major facilitator superfamily MFS_1  42.11 
 
 		 496 aa  248  1e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0817483  hitchhiker  0.00410128 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4802  major facilitator superfamily MFS_1  42.62 
 
 		 508 aa  248  2e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.278501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6964  major facilitator superfamily MFS_1  36.33 
 
 		 553 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.228058 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0879  major facilitator superfamily MFS_1  37.37 
 
 		 519 aa  246  4.9999999999999997e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2592  major facilitator superfamily MFS_1  38.62 
 
 		 520 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0407  major facilitator superfamily MFS_1  36.28 
 
 		 501 aa  244  1.9999999999999999e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.494303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9051  major facilitator transporter  37.2 
 
 		 509 aa  244  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9246  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 555 aa  242  1e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.566604 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02660  arabinose efflux permease family protein  39.13 
 
 		 505 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1369  major facilitator transporter  36.9 
 
 		 509 aa  241  2.9999999999999997e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.559505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0459  major facilitator superfamily MFS_1  37.25 
 
 		 503 aa  239  9e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.492782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1492  major facilitator transporter  36.51 
 
 		 575 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926089  normal  0.297712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8894  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.35 
 
 		 519 aa  237  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.27 
 
 		 534 aa  235  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1251  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  36.77 
 
 		 503 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.157132  normal  0.20495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5250  major facilitator superfamily MFS_1  40.49 
 
 		 477 aa  232  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.411045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3112  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.4 
 
 		 525 aa  231  3e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0999327  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1259  major facilitator superfamily MFS_1  39.88 
 
 		 539 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5148  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 514 aa  230  4e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4992  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.84 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.357314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5220  major facilitator transporter  35.95 
 
 		 558 aa  229  1e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.337283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4489  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 		 536 aa  226  8e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.866266  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2369  major facilitator superfamily MFS_1  38.99 
 
 		 506 aa  225  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0969866  normal  0.0310858 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3734  major facilitator superfamily MFS_1  37.89 
 
 		 497 aa  226  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.065853  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9283  major facilitator superfamily MFS_1  40.08 
 
 		 511 aa  224  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.985351 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2007  major facilitator superfamily MFS_1  36.63 
 
 		 510 aa  224  4e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07890  arabinose efflux permease family protein  34.52 
 
 		 508 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2781  major facilitator superfamily MFS_1  35.4 
 
 		 535 aa  223  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  32.79 
 
 		 503 aa  221  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2735  major facilitator transporter  36.11 
 
 		 481 aa  221  3e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.127959  normal  0.456843 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3210  major facilitator transporter  35.94 
 
 		 540 aa  219  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.1071  normal  0.711743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4607  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  35.76 
 
 		 522 aa  218  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4324  major facilitator superfamily MFS_1  35.31 
 
 		 516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5051  major facilitator superfamily MFS_1  38.1 
 
 		 502 aa  217  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.261408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  37.68 
 
 		 507 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  36.11 
 
 		 538 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0448  major facilitator superfamily MFS_1  39.61 
 
 		 528 aa  214  1.9999999999999998e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.130384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2871  major facilitator transporter  39.54 
 
 		 563 aa  213  5.999999999999999e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.175724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2680  major facilitator superfamily MFS_1  35.46 
 
 		 601 aa  213  7e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0097  major facilitator superfamily MFS_1  35.06 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2441  major facilitator transporter  34.94 
 
 		 519 aa  210  4e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0616003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2993  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.12 
 
 		 607 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.999579  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>