More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1489 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_1489  flagellin  100 
 
 
283 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  79.3 
 
 
282 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  75.79 
 
 
282 aa  382  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  71.02 
 
 
283 aa  333  2e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  63.38 
 
 
284 aa  299  3e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  53.36 
 
 
279 aa  281  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  52.65 
 
 
279 aa  279  4e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  51.61 
 
 
278 aa  273  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  52.36 
 
 
290 aa  265  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.79 
 
 
280 aa  261  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.98 
 
 
276 aa  259  3e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  53.19 
 
 
272 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  53.19 
 
 
272 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  51.57 
 
 
287 aa  256  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
283 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  52.56 
 
 
285 aa  255  7e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  49.82 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  50.34 
 
 
294 aa  253  3e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  52.13 
 
 
274 aa  253  3e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  51.77 
 
 
271 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  51.77 
 
 
271 aa  249  3e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  51.22 
 
 
286 aa  249  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  52.65 
 
 
272 aa  249  5e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  50.17 
 
 
294 aa  248  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  51.24 
 
 
272 aa  248  6e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  51.94 
 
 
273 aa  248  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  52.94 
 
 
272 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  50.53 
 
 
273 aa  246  2e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  51.94 
 
 
275 aa  247  2e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  53.33 
 
 
276 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  53.55 
 
 
270 aa  246  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  51.59 
 
 
275 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  51.24 
 
 
272 aa  246  4e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  51.58 
 
 
287 aa  246  4e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  50.71 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  50.71 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  51.24 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  50.35 
 
 
288 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  49.83 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  49.65 
 
 
274 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 
271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 
271 aa  242  3.9999999999999997e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  50.7 
 
 
273 aa  242  6e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  48.41 
 
 
273 aa  241  1e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  49.48 
 
 
274 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  51.59 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  51.94 
 
 
273 aa  238  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  52.21 
 
 
272 aa  238  9e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  50.53 
 
 
273 aa  237  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  50.54 
 
 
275 aa  236  3e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  51.23 
 
 
273 aa  236  4e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  49.47 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  49.12 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  51.94 
 
 
271 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  46.56 
 
 
319 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  50.36 
 
 
281 aa  229  3e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  48.59 
 
 
278 aa  229  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  44.83 
 
 
319 aa  224  9e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  47.7 
 
 
272 aa  224  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  45.58 
 
 
272 aa  223  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  48.35 
 
 
281 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  48.06 
 
 
314 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  45.07 
 
 
278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  46.26 
 
 
275 aa  218  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  44.37 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  44.37 
 
 
278 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  46.05 
 
 
289 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  47.37 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  47.37 
 
 
271 aa  214  9.999999999999999e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  46.15 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  47.02 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  48.75 
 
 
278 aa  211  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  45.61 
 
 
271 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  47.02 
 
 
274 aa  211  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  44.72 
 
 
279 aa  209  3e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  46.15 
 
 
271 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  42.16 
 
 
299 aa  209  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  44.41 
 
 
279 aa  208  6e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  43.66 
 
 
277 aa  207  1e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  44.06 
 
 
279 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  48.76 
 
 
276 aa  205  6e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  62.42 
 
 
687 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  42.16 
 
 
282 aa  204  2e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1453  flagellin-like  44.25 
 
 
287 aa  203  2e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.276413  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  45.83 
 
 
281 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  44.01 
 
 
263 aa  203  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  40.88 
 
 
295 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  45.42 
 
 
271 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  45.42 
 
 
271 aa  204  2e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  42.25 
 
 
263 aa  201  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  44.52 
 
 
273 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  40.98 
 
 
327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  42.52 
 
 
293 aa  199  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1452  flagellin-like  42.86 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000186123  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  38.24 
 
 
356 aa  199  5e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  43.55 
 
 
266 aa  198  7e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  43.26 
 
 
272 aa  198  7.999999999999999e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  43.57 
 
 
272 aa  198  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  41.02 
 
 
295 aa  196  4.0000000000000005e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  43.21 
 
 
264 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>