273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1404 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  98.76 
 
 
484 aa  956  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15550  K+ transporter protein  73.14 
 
 
483 aa  670  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3433  cation transport protein  69.57 
 
 
484 aa  662  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  84.71 
 
 
484 aa  812  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22690  potassium uptake protein TrkH  81.2 
 
 
484 aa  769  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0159023 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  85.33 
 
 
484 aa  820  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40470  TrkH family potassium uptake protein  69.77 
 
 
484 aa  662  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  95.04 
 
 
484 aa  901  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  2.85199e-10 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1567  TrkH family potassium uptake protein  68.74 
 
 
484 aa  659  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.120184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1916  potassium uptake protein TrkH  80.79 
 
 
484 aa  765  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3953  TrkH family potassium uptake protein  68.94 
 
 
484 aa  661  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.433351 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  100 
 
 
484 aa  966  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  99.17 
 
 
484 aa  960  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  90.5 
 
 
484 aa  873  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1826  TrkH family potassium uptake protein  69.21 
 
 
483 aa  644  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.634597  normal  0.612311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1869  cation transporter  68.94 
 
 
484 aa  646  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.130982 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  51.45 
 
 
481 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  51.87 
 
 
481 aa  469  1e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  52.07 
 
 
481 aa  469  1e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  51.24 
 
 
480 aa  462  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  51.77 
 
 
480 aa  460  1e-128  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0034  TrkH family potassium uptake protein  50.83 
 
 
480 aa  451  1e-125  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0561968 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0031  TrkH family potassium uptake protein  51.04 
 
 
480 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.979757  normal  0.0679192 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0027  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0149541 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0028  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.172554  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  51.04 
 
 
480 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0027  potassium uptake protein, TrkH family  50 
 
 
480 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  3.04543e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0023  TrkH family potassium uptake protein  50 
 
 
480 aa  444  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.991161  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0025  TrkH family potassium uptake protein  49.58 
 
 
480 aa  440  1e-122  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.053373  hitchhiker  0.00232056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0023  TrkH family potassium uptake protein  49.58 
 
 
480 aa  440  1e-122  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0882974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0031  TrkH family potassium uptake protein  49.38 
 
 
480 aa  438  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000580956  hitchhiker  1.65872e-06 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3740  TrkH family potassium uptake protein  50.1 
 
 
480 aa  437  1e-121  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00227037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  49.58 
 
 
480 aa  433  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0027  TrkH family potassium uptake protein  50.63 
 
 
480 aa  425  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0037  cation transporter  48.65 
 
 
481 aa  417  1e-115  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1427  cation transporter  50.47 
 
 
472 aa  417  1e-115  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0082  potassium uptake protein TrkH  48.34 
 
 
481 aa  415  1e-114  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1614  cation transporter  47.18 
 
 
490 aa  410  1e-113  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  4.55151e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2171  cation transporter  51.77 
 
 
493 aa  405  1e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1134  cation transporter  48.37 
 
 
498 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075109  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  39.38 
 
 
482 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  40.7 
 
 
482 aa  373  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  43.15 
 
 
485 aa  362  6e-99  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  37.76 
 
 
482 aa  358  2e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0469  cation transporter  43.33 
 
 
498 aa  348  2e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.261483  normal  0.274195 
 
 
-
 
NC_004310  BR1500  cation transport protein  39.78 
 
 
466 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1451  cation transport protein  41.84 
 
 
466 aa  347  4e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1663  cation transporter  38.62 
 
 
500 aa  330  3e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.330745  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0982  putative potassium uptake protein  38.76 
 
 
466 aa  328  1e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.385005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5285  cation transporter  39.81 
 
 
484 aa  309  9e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  37.98 
 
 
478 aa  303  5e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  37.26 
 
 
481 aa  303  5e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  39.61 
 
 
488 aa  301  2e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  37.19 
 
 
482 aa  301  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  37.63 
 
 
491 aa  299  6e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.11 
 
 
483 aa  299  7e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  39.22 
 
 
483 aa  299  9e-80  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1853  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  33.82 
 
 
482 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.385186  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0502  cation transporter  33.82 
 
 
482 aa  296  7e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  38.04 
 
 
488 aa  294  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  36.53 
 
 
485 aa  294  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  34.92 
 
 
482 aa  290  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  36.33 
 
 
498 aa  288  1e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  38.32 
 
 
485 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  36.8 
 
 
483 aa  287  4e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0022  trk system potassium uptake membrane protein  35.38 
 
 
485 aa  286  4e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.78231  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  37.37 
 
 
485 aa  286  7e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0503  cation transporter  37.27 
 
 
484 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  36.98 
 
 
483 aa  285  1e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1374  cation transporter  41.23 
 
 
484 aa  284  2e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1854  potassium uptake transporter, transmembrane component, TrkH  37.07 
 
 
484 aa  284  2e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  37.55 
 
 
488 aa  284  3e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  35.63 
 
 
484 aa  283  4e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  38.18 
 
 
488 aa  283  4e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  37.65 
 
 
485 aa  281  2e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0640  cation transporter  37.21 
 
 
484 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.831916  normal  0.358722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  35.73 
 
 
485 aa  280  4e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1567  cation transporter  37.08 
 
 
510 aa  280  6e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  37.42 
 
 
494 aa  278  1e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  35.88 
 
 
483 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  41.07 
 
 
484 aa  277  3e-73  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  35.2 
 
 
481 aa  277  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  37.24 
 
 
486 aa  277  3e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.93317e-06  unclonable  5.82873e-08 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1093  putative potassium uptake protein TrkH  36.76 
 
 
486 aa  275  9e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  34.18 
 
 
479 aa  275  1e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.31748e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  36.2 
 
 
485 aa  274  2e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 
485 aa  275  2e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  33.33 
 
 
466 aa  274  3e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  37.17 
 
 
485 aa  273  5e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0877  cation transporter  36.31 
 
 
483 aa  272  1e-71  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  35.32 
 
 
485 aa  271  2e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  36.33 
 
 
481 aa  270  4e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  37.45 
 
 
483 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  36.14 
 
 
482 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.33 
 
 
483 aa  269  1e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  38.88 
 
 
485 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78231e-06 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0016  TrkH family potassium uptake protein  36.89 
 
 
485 aa  267  3e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.917288  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  31.25 
 
 
479 aa  266  4e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  36.44 
 
 
482 aa  267  4e-70  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  7.33585e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  36.45 
 
 
479 aa  266  7e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>