More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1102 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A1744  putative ATP-dependent helicase lhr  68.93 
 
 		 1599 aa  802    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4684  DEAD/H associated domain protein  35.37 
 
 		 1523 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.100241 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1332  putative ATP-dependent helicase lhr  68.93 
 
 		 1598 aa  802    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.214802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1061  DEAD/H associated domain protein  99.09 
 
 		 1434 aa  2829    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1579  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.5 
 
 		 1412 aa  1437    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4066  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.02 
 
 		 1505 aa  1723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6550  DEAD/H associated domain protein  51 
 
 		 1573 aa  1078    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.851379  normal  0.30774 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0993  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  68.93 
 
 		 1598 aa  802    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1802  DEAD/H associated domain protein  35.06 
 
 		 1544 aa  677    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0257988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5792  DEAD/H associated domain protein  35.4 
 
 		 1480 aa  660    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356725  normal  0.0833692 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.47 
 
 		 1539 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.35203 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0304  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  68.93 
 
 		 1700 aa  804    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5032  DEAD/DEAH box helicase-like  71.3 
 
 		 1431 aa  2003    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.21227 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1852  DEAD/DEAH box helicase  61.04 
 
 		 1515 aa  985    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.183708 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1130  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  57.95 
 
 		 1626 aa  916    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00800963  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1102  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 1426 aa  2853    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.484648 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1153  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  63.51 
 
 		 1510 aa  1789    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.180513  normal  0.341943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3338  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.5 
 
 		 1518 aa  1749    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0384  DEAD/DEAH box helicase-like  34.83 
 
 		 1531 aa  674    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.224382 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3770  DEAD/DEAH box helicase-like  47.29 
 
 		 1435 aa  1229    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.515383 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1267  DEAD/H associated  34.24 
 
 		 1523 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0406  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.35 
 
 		 1475 aa  937    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.354786  normal  0.0258746 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1091  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  86.58 
 
 		 1451 aa  2468    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3982  DEAD/H associated domain protein  50.21 
 
 		 1388 aa  1191    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.347513  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3591  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.36 
 
 		 1508 aa  976    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.485917 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21690  putative ATP-dependent DNA helicase  66.64 
 
 		 1448 aa  1823    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2240  DEAD/H associated domain protein  35.7 
 
 		 1506 aa  636    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.589998 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5281  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  63.36 
 
 		 1497 aa  1825    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426487 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1829  ATP-dependent DNA helicase  69.1 
 
 		 1598 aa  806    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.850726  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4019  DEAD/H associated domain protein  49.9 
 
 		 1419 aa  1153    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.608541  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1284  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.24 
 
 		 1523 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.148383 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1632  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.35 
 
 		 1514 aa  640    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0582362  normal  0.286828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1849  putative ATP-dependent DNA helicase  66.43 
 
 		 1448 aa  1819    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.210225  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0375  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  68.93 
 
 		 1598 aa  802    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.886751  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4416  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.37 
 
 		 1480 aa  1733    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.600521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4351  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  92.9 
 
 		 1429 aa  2619    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0264  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  68.93 
 
 		 1598 aa  802    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5453  DEAD/H associated domain protein  63.66 
 
 		 1504 aa  1790    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1293  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.13 
 
 		 1523 aa  634  1e-180  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.193705 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2329  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36 
 
 		 1516 aa  635  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2092  DEAD/DEAH box helicase-like  35.16 
 
 		 1536 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3924  DEAD/H associated domain protein  34.73 
 
 		 1535 aa  624  1e-177  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1724  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.26 
 
 		 1553 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0413876  normal  0.423713 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1786  DEAD/H associated domain protein  35.3 
 
 		 1536 aa  621  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.509366  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3527  DEAD/DEAH box helicase-like  33.18 
 
 		 1567 aa  621  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.917212  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.9 
 
 		 1561 aa  620  1e-176  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.338069  hitchhiker  0.000946056 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1865  DEAD/H associated domain protein  35.37 
 
 		 1536 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.299338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1014  DEAD/H associated domain protein  34.61 
 
 		 1493 aa  616  1e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1240  DEAD/H associated domain protein  34.61 
 
 		 1632 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0664  DEAD/H associated domain protein  34.59 
 
 		 1509 aa  613  9.999999999999999e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.240887 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1217  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.36 
 
 		 1613 aa  612  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0938904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0816  DEAD/H associated domain protein  33.58 
 
 		 1572 aa  608  9.999999999999999e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0156  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.11 
 
 		 1476 aa  606  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27850  ATP dependent helicase, Lhr family  34.39 
 
 		 1549 aa  595  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.081171 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1541  DEAD/H associated domain protein  34.28 
 
 		 1694 aa  594  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00672173  normal  0.215224 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13325  ATP-dependent helicase lhr  34.65 
 
 		 1513 aa  592  1e-167  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1113  DEAD/H associated domain-containing protein  35.12 
 
 		 1644 aa  588  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79527  normal  0.12197 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4192  DEAD/H associated domain-containing protein  32.72 
 
 		 1534 aa  582  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0456896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1413  DEAD/H associated domain protein  34.42 
 
 		 1606 aa  572  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0176402  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1545  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.74 
 
 		 1538 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.91893  normal  0.4804 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2365  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.46 
 
 		 1538 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.812889  normal  0.664089 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01623  predicted ATP-dependent helicase  31.3 
 
 		 1538 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01613  hypothetical protein  31.3 
 
 		 1538 aa  556  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1730  putative ATP-dependent helicase Lhr  31.32 
 
 		 1525 aa  555  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1987  DEAD/H associated domain protein  31.32 
 
 		 1538 aa  552  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19580  ATP dependent helicase, Lhr family  33.09 
 
 		 1601 aa  542  9.999999999999999e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.512724  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0197  DEAD/H associated domain protein  36.42 
 
 		 1688 aa  531  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.000798352  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4810  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.75 
 
 		 1517 aa  523  1e-147  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0712014 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1496  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.14 
 
 		 1534 aa  520  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.377611  normal  0.775081 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00432  ATP-dependent DNA helicase  67.41 
 
 		 398 aa  520  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.25382  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0708  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.16 
 
 		 1381 aa  514  1e-144  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405562  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1489  DEAD/H associated domain protein  38.12 
 
 		 1584 aa  509  9.999999999999999e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.369551 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1039  DEAD/H associated domain protein  35.1 
 
 		 1618 aa  492  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1865  putative ATP-dependent helicase Lhr  35.88 
 
 		 1538 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0115691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1976  putative ATP-dependent helicase Lhr  35.88 
 
 		 1538 aa  485  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.987163  hitchhiker  0.00398653 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2613  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.68 
 
 		 1502 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.670287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2140  DEAD/H associated domain protein  34.49 
 
 		 1741 aa  459  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.800534 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1087  DEAD/H associated domain protein  32.78 
 
 		 875 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.414576  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0623  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.1 
 
 		 1694 aa  455  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0751  DEAD/H associated domain protein  34.38 
 
 		 1729 aa  451  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1574  DEAD/H associated domain protein  34.42 
 
 		 1379 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1577  DEAD/H associated domain protein  34.8 
 
 		 1495 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0930  ATP-dependent helicase  34.73 
 
 		 888 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.960036  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2113  ATP-dependent helicase  32.78 
 
 		 873 aa  444  1e-123  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.706735 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0533  ATP-dependent helicase  34 
 
 		 870 aa  436  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1508  ATP-dependent helicase  33.06 
 
 		 872 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0507962  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0463  ATP-dependent helicase  31.13 
 
 		 872 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0110872  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0444  ATP-dependent helicase  32.09 
 
 		 874 aa  417  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2211  putative ATP-dependent helicase Lhr  41.26 
 
 		 1620 aa  416  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.961951 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0392  ATP-dependent helicase  32.39 
 
 		 874 aa  416  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.447466 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1527  ATP-dependent helicase  32.09 
 
 		 874 aa  412  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.983295  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23220  ATP dependent helicase, Lhr family  31.67 
 
 		 1649 aa  412  1e-113  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.408844  normal  0.0469013 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1578  DEAD/H associated domain protein  31.38 
 
 		 1604 aa  407  1.0000000000000001e-112  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2870  DEAD/H associated domain protein  33.86 
 
 		 922 aa  401  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2819  ATP-dependent helicase  33.03 
 
 		 915 aa  394  1e-108  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2116  ATP-dependent helicase  32.7 
 
 		 914 aa  391  1e-107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.200911  normal  0.796736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1253  ATP-dependent helicase  33.26 
 
 		 941 aa  392  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3147  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.72 
 
 		 900 aa  358  5.999999999999999e-97  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0156392  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1016  DEAD/H associated domain protein  30.41 
 
 		 1523 aa  344  7e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160126  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00430  ATP-dependent DNA helicase  49.46 
 
 		 447 aa  328  3e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.774826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>