201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1081 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1040  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 96 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1081  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  100 
 
 		 96 aa  187  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.678073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4186  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  80.21 
 
 		 96 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1037  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  92.71 
 
 		 96 aa  151  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3374  Sec-independent protein translocase TatB  50.77 
 
 		 120 aa  73.9  0.0000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0259  Sec-independent protein translocase TatB  35.24 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0757626  hitchhiker  0.00426413 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0131  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  49.32 
 
 		 234 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2001  Sec-independent protein translocase TatB  53.57 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.400731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2304  twin-arginine translocation protein TatB  47.95 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.289446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0715  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  53.57 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177109 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0809  twin-arginine translocation protein TatB  49.18 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1487  Sec-independent protein translocase protein TatB  40.62 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3421  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  52.54 
 
 		 151 aa  67.4  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.746627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0592  Sec-independent protein translocase TatB  52.46 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.067468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1703  twin-arginine translocation protein TatB  38.2 
 
 		 149 aa  67  0.00000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0914  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.24 
 
 		 163 aa  67  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0543  twin-arginine translocation protein TatB  48.39 
 
 		 104 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.69735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3236  sec-independent translocase  38.46 
 
 		 168 aa  64.7  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1088  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.31 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3218  sec-independent translocase  41.76 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2871  sec-independent translocase  41.76 
 
 		 170 aa  63.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0579485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0355  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 176 aa  63.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.843267  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0364  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 176 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.488907 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2702  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0340  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0793072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3681  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.655432  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3535  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.74283  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3548  sec-independent translocase  47.89 
 
 		 172 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0868381  hitchhiker  0.000446597 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2981  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5555  sec-independent translocase  47.46 
 
 		 165 aa  62.8  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3251  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1800  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3654  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3712  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2753  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 175 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2941  sec-independent translocase  40 
 
 		 172 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3099  sec-independent translocase  36.08 
 
 		 168 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0416  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001923  twin-arginine translocation protein TatB  43.48 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0410  sec-independent translocase  38 
 
 		 175 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2670  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.410256  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0437  sec-independent translocase  52.54 
 
 		 179 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.496787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2747  sec-independent translocase  47.89 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.990271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0842  sec-independent translocase  45.9 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.516683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0060  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.554164  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2789  twin-arginine translocation protein TatB  39.51 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180162  normal  0.187511 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2321  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.13 
 
 		 254 aa  61.2  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00445114  normal  0.211432 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00566  sec-independent translocase  43.48 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1778  twin-arginine translocation protein TatB  43.04 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0260824  normal  0.022069 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1469  twin-arginine translocation protein TatB  39.77 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0327243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0065  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 139 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0077  sec-independent translocation protein mttA/Hcf106  50 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0700  sec-independent translocase  44.26 
 
 		 154 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3044  Sec-independent protein translocase protein TatB  36.54 
 
 		 102 aa  60.1  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4416  putative sec-independent protein secretion pathway component TatB  44.62 
 
 		 180 aa  60.1  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.918064 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3000  sec-independent translocase  42.03 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4214  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.78 
 
 		 99 aa  60.1  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0745  sec-independent translocase  45.76 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0849771  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0319  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.34 
 
 		 136 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0782  sec-independent translocase  45.76 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0330994 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1181  sec-independent translocase  40.24 
 
 		 152 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2514  twin-arginine translocation protein TatB  43.08 
 
 		 172 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.641034  normal  0.463559 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1054  sec-independent translocase  45.76 
 
 		 164 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0164  Sec-independent protein translocase protein TatB  39.47 
 
 		 157 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1973  twin-arginine translocation protein TatB  41.18 
 
 		 162 aa  58.5  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.268413  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0815  sec-independent translocase  44.26 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0707  sec-independent translocase  37.8 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.114909  normal  0.824643 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2428  sec-independent translocase  39.47 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4254  sec-independent translocase  50 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1739  SEC-independent protein translocase  59.57 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4361  sec-independent translocase  50 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4301  sec-independent translocase  50 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.275024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4205  sec-independent translocase  50 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2744  twin-arginine translocation protein TatB  38.27 
 
 		 188 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.640923  normal  0.254094 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0076  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  46.55 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.85392 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0546  Sec-independent protein translocase TatB  42.31 
 
 		 184 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0338554  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1667  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  59.57 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3911  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  42.03 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4182  sec-independent translocase  50 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1607  sec-independent translocase  44.26 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00172406 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03730  sec-independent translocase  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4142  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03679  hypothetical protein  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4220  sec-independent translocase  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000636785 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3124  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  39.13 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0631328 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5278  sec-independent translocase  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.47844  normal  0.252522 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4358  sec-independent translocase  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4171  sec-independent translocase  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4061  sec-independent translocase  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4309  sec-independent translocase  48.15 
 
 		 171 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1951  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  35.42 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4406  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  40.85 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3172  twin arginine translocase protein A  36.84 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000145044  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3543  twin arginine translocase protein A  37.08 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000207779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1474  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.25 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000760884  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2957  sec-independent translocase  39.34 
 
 		 154 aa  56.2  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.281897  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1789  twin-arginine translocation protein TatB  38.16 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3206  twin-arginine translocation protein TatB  40.85 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1982  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  55.77 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0382774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4243  twin-arginine translocation protein, TatB subunit  36.84 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.828314  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>